Nowa wersja platformy, zawierająca wyłącznie zasoby pełnotekstowe, jest już dostępna.
Przejdź na https://bibliotekanauki.pl
Ograniczanie wyników
Czasopisma help
Lata help
Autorzy help
Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 27

Liczba wyników na stronie
first rewind previous Strona / 2 next fast forward last
Wyniki wyszukiwania
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
first rewind previous Strona / 2 next fast forward last
1
Content available remote Zastosowanie technologii ACTIFLOTM w uzdatnianiu wód
100%
|
2005
|
tom Nr 3
18-21
EN
The process of water treatment. Advantages of ACTI FLO process. Example of applying the technology in a water treatment plant in Jasio.
PL
Oszacowanie stopnia podobieństwa sekwencji odgrywa istotną rolę w porównywaniu sekwencji. Aby prawidłowo określić stopień podobieństwa, należy uwzględnić następujące kryteria: - względna zawartość identycznych pozycji, - długość porównywanych sekwencji, - rozmieszczenie pozycji identycznych wzdłuż porównywanego łańcucha, - rodzaj aminokwasów zajmujących pozycje konserwatywne (dla białek), - genetyczne i strukturalne współzależności aminokwasów występujących w odpowiadających sobie pozycjach porównywanych sekwencji (dla białek). Podejście statystyczne opracowane przez Karlina i Altschula pozwala wyodrębnić na tyle duże podobieństwo, by można je było nazwać pokrewieństwem. Nasze rozwiązanie, bazujące na technologii Java, wykorzystuje te same postulaty, wzbogacając dostępną informację o dalsze szczegóły wynikające z dopasowania sekwencji. Nasze podejście wyszukuje sekwencje podobne do sekwencji wzorcowej, w których następnie oszacowany zostaje stopień rozproszenia pozycji identycznych. Identyczności położone blisko siebie w sekwencji są punktowane wyżej niż rozproszone bloki pozycji identycznych, przeplatane odcinkami nieidentycznymi. Co więcej, rozważana grupa sekwencji może być zawężana, by wyodrębnić znaczące pokrewieństwo. W tym celu należy: - zadeklarować wartość progową wartości E-value dla dalszych obliczeń, - wyodrębnić sekwencje o zbliżonej i niskiej wartości E-value, - wyodrębnić sekwencje podobnej długości, - wyodrębnić sekwencje, dla których rozkład pozycji identycznych jest podobny. Wszystkie sekwencje sklasyfikowane jako wzajemnie spokrewnione stanowią dane wejściowe do konstrukcji molekularnego drzewa filogenetycznego. Wzajemny dystans ewolucyjny obliczany jest poprzez analizę dopasowanych par sekwencji z grupy we wszystkich możliwych kombinacjach. Konstrukcja drzewa opiera się na obliczanych wartościach dla konkretnej pary sekwencji w porównaniu do maksymalnego możliwego wyniku dla tej samej względnej zawartości pozycji identycznych oraz długości sekwencji. Praca wykonana została w ramach grantu MAMBA (Centre of Ex- cellence for Multi-scale Biomolecular Modelling, Bioinformatics and Applications) Projekt nr QLRI-CT-2002-90383.
EN
Problem of similarity significance estimation is crucial in sequence comparison work. In order to assess sequence similarity several parameters should be taken into account. They are: - the percentage of identity, - the length of compared sequences, - distribution of the identical positions along the aligned sequences, - the type of units occupying conservative positions (in proteins), - genetic or structural relationships of the units at corresponding positions (in proteins). Statistical approach presented by Karlin and Altschul [1] proposes a model that distinguishes biologically relevant similarities. Our Java application makes use of these formulas but additionally provides more detailed information concerning the alignments. Our approach searches for similar sequences to the query sequence then estimates the distribution of identical positions. Identities which are located in direct mutual neighborhood are scored higher than regular distributed identity blocks separated by non identical blocks. Furthermore an examined group of sequences may be filtered for selecting the actual and univocal homology. This can be accomplished by : - applying the threshold expect (E) value for computation, - selecting the sequences for which E-values are close, - selecting the sequences of similar length, - selecting the sequences that reveal compact blocks of identical positions. All sequences classified as homologous were used to construct the molecular phylogenetic tree by means of pairwise sequence comparison. Phylogenetic tree construction is based on the scores calculated for the most extreme theoretical distribution cases versus scores calculated for particular sequence pair. This work was supported by MAMBA (Centre of Excellence for Multi-scale Biomolecular Modelling, Bioinformatics and Applications) Project No. QLRI-CT-2002-90383.
EN
The activities of superoxide dismutase (SOD), ascorbate peroxidase (APX), catalase (CAT), glutathione S-transferase (GST) as well as proline content were studi ed in leaves and roots of14 day-old pea plants treated with NiSO4 (10, 100, 200 pM) for 1,3, 6 and 9 day s. Exposure of pea plants to nickel (Ni) resulted in the decrease in CuZnSOD as well as total SOD activities in both leaves and roots. The activity of APX in leaves of plants treated with 100 and 200 pM Ni increased following the 3rd day after metal application, while in roots at the end of the experiment the activity of this enzyme was significantly reduced. In both organs CAT activity generally did not change in response to Ni treatment. The activity of GST in plants exposed to high concentrations of Ni increased, more markedly in roots. In both leaves and roots after Ni application accumulation of free proline was observed, but in the case of leaves conceniraiion of this amino acid increased eariier and to a greater extent than in roots. The results indicate that stimulation of GST activity and accumulation of proline in the tissues rather than antioxidative enzymes are involved in response of pea plants to Ni stress.
PL
W artykule przedstawiono automatyczną metodę pomiaru długości systemu wiązkowego korzeni pszenicy z hodowli hydroponicznej opartą o przetwarzanie i analizę obrazu. Badanie tej cechy ma istotne znaczenie w ocenie stopnia tolerancji roślin na działanie czynników środowiskowych wpływających na ich produktywność. W proponowanej metodzie zastosowano uproszczoną procedurę przygotowania preparatów korzeni oraz założono minimalne nakłady sprzętowe w formie standardowego skanera i komputera osobistego. Zawiera ona segmentację barwnego obrazu korzeni, szkieletyzację uzyskanego obrazu binarnego, a następnie odtworzenie, z płaskich szkieletów, topologii trójwymiarowych drzew korzeniowych poszczególnych korzeni wiązki, określonych w pracy jako korzenie 1. rzędu. Analiza struktur danych tych drzew umożliwia odtworzenie w rastrze obrazu przebiegu osi korzeni 1. rzędu i ich bocznych odgałęzień. Długości korzeni są wyliczane wzdłuż tych osi, po uprzednim wygładzeniu ich przebiegu przy użyciu funkcji sklejanych trzeciego stopnia. Pomiary długości korzeni 1. rzędu przeprowadzone dla serii 10 obrazów (ok. 50 korzeni) wykazały niewielką rozbieżność z wynikami pomiarów metodą manualną -średnio 1,94%.
EN
In the paper an automatic method of length measurement has been presented for the roots of wheat from hydroponic culture, based on image processing and analysis. Evaluation of this feature of root systems is important for the estimation of plant tolerance to environmental factors influencing their productivity. In the proposed method simplified procedure of root preparation is applied and low-cost equipment is assumed consisting of typical scanner device and personal computer. The method includes root image segmentation in colour space, binary image skeletonization and then 3D trees topology reconstruction from 2D skeletons of all individual fibrous roots defined as 1. order roots. The analysis of tree data structures enables the reconstruction of axes of 1. order roots and their lateral branches in the image raster. Root lengths are calculated along these axes following cubic splines smoothing of their routes. The measurements of 1. order roots, carried out for the series of 10 images (about 50 roots) revealed only small differences from the results obtained with manual method - 1,94% in average.
EN
The influence of 50 and 100 µM Ni on the activities of nitrate reductase (NR), nitrite reductase (NiR), glutamine synthetase (GS), glutamate synthase (GOGAT), glutamate dehydrogenase (GDH), alanine aminotransferase (AlaAT) and aspartate aminotransferase (AspAT) was studied in the wheat roots. Root fresh weight, tissue Ni, nitrate, ammonium, glutamate and protein concentrations were also determined. Exposure to Ni resulted in a marked reduction in fresh weight of the roots accompanied by a rapid accumulation of Ni in these organs. Both nitrate and ammonium contents in the root tissue were considerably enhanced by Ni stress. While protein content was not significantly influenced by Ni application, glutamate concentration was slightly reduced on the first day after treatment with the higher Ni dose. Treatment of the wheat seedlings with 100 µM Ni led to a decrease in NR activity; however, it did not alter the activation state of this enzyme. Decline in NiR activity observed after application of 100 µM Ni was more pronounced than that in NR. The activities of GS and NADH-GOGAT also showed substantial decreases in response to Ni stress with the latter being more susceptible to this metal. Starting from the fourth day, both aminating and deaminating GDH activities in the roots of the seedlings supplemented with Ni were lower in comparison to the control. While the activity of AspAT remained unaltered after Ni application that of AlaAT showed a considerable enhancement. The results indicate that exposure of the wheat seedlings to Ni resulted in a general depression of nitrogen assimilation in the roots. Increase in the glutamate-producing activity of AlaAT may suggest its involvement in supplying the wheat roots with this amino acid under Ni stress.
EN
It was found previously that methyl jasmonate (JA-Me) induced leaf abscission in Kalanchoe blossfeldiana. In present studies it was shown that JA-Me markedly increased the total activities of cellulase, polygalacturonase, pectinase and xylanase in petioles, but did not affect activities of these enzymes in the blades and apical part of shoots of K. blossfeldiana. These results suggest that methyl jasmonate promotes the degradation of cell wall polysaccharides in the abscission zone and in this way induces leaf abscission in Kalanchoe blossfeldiana. Aktywność glukanaz rozkładających ściany komórkowe w czasie indukowanego odpadania liści u Kalanchoe blossfeldiana przez ester metylowy kwasu jasmonowego.
PL
Poprzednio wykazano, że ester metylowy kwasu jasmonowego (JA-Me) indukuje odpadanie liści u Kalanchoe blossfeldiana. W obecnych badaniach wykazano, że JA-Me znacznie podwyższa całkowitą aktywność celulazy, polygalakturonazy, pektynazy i ksylanazy w ogonkach, ale nie wpływa na aktywność tych enzymów w blaszkach liściowych i pędach wierzchołkowych Kalanchoe blossfeldiana. Otrzymane wyniki sugerują, że ester metylowy kwasu jasmonowego stymuluje degradację polisacharydów ścian komórkowych w warstwie odcinającej i w ten sposób indukuje odpadanie liści u Kalanchoe blossfeldiana.
EN
The analysis of plant root system images plays an important role in the diagnosis of plant health state, the detection of possible diseases and growth distortions. This paper describes an initial stage of automatic analysis-the segmentation method for scanned images of Ni-treated wheat roots from hydroponic culture. The main roots of a wheat fibrous system are placed separately in the scanner view area on a high chroma background (blue or red). The first stage of the method includes the transformation of a scanned RGB image into the HCI (Hue-Chroma-Intensity) colour space and then local thresholding of the chroma component to extract a binary root image. Possible chromatic discolourations, different from background colour, are added to the roots from blue or red chroma subcomponent images after thresholding. At the second stage, dark discolourations are extracted by local fuzzy c-means clustering of an HCI intensity image within the binary root mask. Fuzzy clustering is applied in local windows around the series of sample points on roots medial axes (skeleton). The performance of the proposed method is compared with hand-labelled segmentation for a series of several root systems.
EN
In the paper an algorithm for the extraction of first and second order leaf venation has been presented. The algorithm applies to apple tree leaves specially stained to reveal the areas of H2O2 appearing in the leaf blade as brown spots of different size and intensity. In the considered case they represent the defence reaction of planfs tissue to a bacterial infection called fire blight. Examined leaf images include visible leaf veins with colour hue and brightness similar to the H2O2 spots. They are often superimposed on leaf veins and make serious distortions for the process of their extraction. In these conditions typical algorithms for the detection of venation patterns usually fail, so a new method of primary and secondary veins detection has been proposed. The vein extraction is based on the step-wise tracking of each vein axis using polygonal linę with the line segments of fixed size. The optimal direction for each step is obtained through the minimization of the proposed cost function depending on the prediction angle. The algorithm has been written in the M-language and executed in MATLAB environment. The experiments of leaf vein tracking carried out for the series of images gave promising results accepted by the biologists.
PL
W artykule przedstawiono algorytm wykrywania pierwszo- i drugorzędowego użyłkowania liści. Algorytm ten zastosowano do liści jabłoni specjalnie barwionych pod kątem wykrycia obszarów H2O2, występujących w blaszce liściowej w postaci brązowych plam o różnym rozmiarze i natężeniu barwy. Plamy te są objawem reakcji obronnej tkanki roślinnej na infekcję bakteryjną zwaną zarazą ogniową. Badane obrazy liści zawierają widoczne żyłki, których odcień koloru oraz jasności są zbliżone do tych obserwowanych w obszarach koncentracji H2O2. Obszary te często nakładając się na żyłki liścia, stanowią poważne zakłócenia w procesie ich wykrywania. W tych warunkach typowe algorytmy identyfikacji wzoru unerwienia zazwyczaj nie sprawdzają się, dlatego zaproponowano nową metodę detekcji żyłkowania pierwszego i drugiego rządu. Jest ona oparta na krokowym śledzeniu każdej żyłki z wykorzystaniem linii łamanej o odcinkach stałej długości. Optymalny kierunek w każdym kroku śledzenia uzyskuje się poprzez minimalizację zaproponowanej funkcji kosztu względem kąta predykcji. Algorytm napisano w języku M i zrealizowano w środowisku MATLAB. Testy algorytmu śledzenia żyłek przeprowadzone dla serii obrazów dają obiecujące rezultaty zaakceptowane przez biologów.
EN
Generation of superoxide anion (O2) and peroxidase activity were significantly increased in bean leaves infected with incompatible and compatible pathogens: Botrytis fabae and Botrytis cinerea, respectively, but the induction was greater on direct inoculation with B. fabae, than with B. cinerea. A slightly higher O2 level was also detected in the parts of leaves surrounding the inoculation side. Overproduction of Ó2 was observed earlier than the increase in peroxidase activity. Pretreatment of the leaves with methyl jasmonate enhanced both O2 production and peroxidase activity following inoculation with B. cinerea. Induction of superoxide dismutase activity after the infection was less pronounced than changes in Ó2 level. The differences in the rate of NADH oxidation in the extracts from control and inoculated leaves, correlated with the differences in the rate of O2 production. The results indicate thatCte level is one of the essential factors responsible for the difference in the interactions between bean plant and compatible and incompatible pathogens.
EN
This paper presents a method of automatic recognition of thiarubrine canals in images obtained with Optical Coherence Tomography technique. The plant material was the Ri-transformed root culture of South American herb Schkuhria pinnata. The series of highresolution OCT B-scans for the study were collected using custom made experimental system operating light of 800 nm central wavelength. The method reduces significant artefacts and uses region growing approach adapted to specific features of OCT images. Results of the identification have been compared with data obtained by specialist for selected B-scans. The algorithm accuracy was also verified using a simple numeric phantom.
EN
Effects of two Ni concentrations (50 and 100 µM) on growth, Ni accumulation as well as the activities of glutamine synthetase (GS) and glutamate dehydrogenase (GDH) were studied in shoots of wheat seedlings. Exposure to Ni caused rapid accumulation of this metal in the shoots accompanied by a substantial decrease in the length and fresh weight of these organs. Both aminating (NADH-GDH) and deaminating (NAD-GDH) glutamate dehydrogenase activities were significantly influenced by Ni stress, while GS activity did not change in response to Ni application. The activity of NADH-GDH showed an increase at the end of the experiment and 7 days after Ni treatment it was 68% and 76% higher than in the control, at 50 and 100 µM Ni, respectively. NAD-GDH activity after 1 and 4 days of exposure to a higher concentration of Ni was reduced by 24% and 37%, respectively. However, on the 7th day the activity of this enzyme was enhanced by 150% and 72% over the control level, at 50 and 100 µM Ni, respectively. The obtained results suggest that GDH can play an important role in response of wheat seedlings to Ni toxicity.
PL
Badano wpływ Ni o stężeniu 50 i 100 µM na wzrost, zawartość Ni oraz aktywność syntetazy glutaminowej (GS) i dehydrogenazy glutaminianowej (GDH) w pędach pszenicy. Potraktowanie Ni wywołało szybką akumulację tego metalu w pędach oraz obniżenie długości i świeżej masy tych organów. Stres wywołany nadmiernym stężeniem Ni w podłożu wywarł znaczny wpływ zarówno na aminującą (NADH-GDH), jak i deaminującą (NAD-GDH) aktywność dehydrogenazy gluta- minianowej, natomiast nie spowodował zmian aktywności GS. W końcowym etapie doświadczenia zaobserwowano wzrost aktywności NADH-GDH i po 7 dniach traktowania była ona o 68% i 76% wyższa niż w kontroli, odpowiednio dla 50 i 100 µM Ni. Po 1 i 4 dniach ekspozycji siewek pszenicy na 100 µM Ni stwierdzono obniżenie aktywności NAD-GDH w pędach, odpowiednio o 24% i 37%. Natomiast po 7 dniach aktywność tego enzymu wzrosła i przewyższała ona poziom kontroli o 150% i 72%, odpowiednio dla 50 i 100 µM Ni. Otrzymane wyniki sugerują, że GDH może odgrywać ważną rolę w reakcji siewek pszenicy na toksyczne działanie Ni.
EN
Behavioural problems and shyness are prevalent horse-related causes of accidents in equitation.The aim of the present study was to examine whether tests developed to measure the intensity of reaction to social separation and to novelty and suddenness can predict how riders perceive their safety when handling and riding a horse. Thirteen leisure horses were subjected to the battery of three fear tests, separation test and a test ride. The horses that were more fearful toward a novel surface were perceived to be less secure when handling. The horses showing fear in the startling object test were also perceived as less secure in both handling and riding. Unexpectedly, in the separation test, the more time the horse had remained a standing position, the more insecure when saddling, mounting, walking and trotting was scored. Similarly, a relaxed body posture with the head in a low position was predictive to a low security score by riders. I t may be supposed that the horses that are comfortable when isolated are self-reliant and independent in comparison to other horses, but probably also in other situations,which might make them difficult to be managed by humans.Behavioural tests could be predictive not only for equine personality traits, but also may be applied in the assessment of rider’s perceived safety. Thus, they may serve as tools to differentiate horses In terms of their suitability for leisure riders.
EN
We have studied the influence of 50 sulfate/selenate ratios in the range of 2; 1.5; 1; 0.5; 0 mM/0.125; 0.25; 0.375; 0.5; 0.75; 1; 1.5; 2; 2.5; 3 mM on biomass growth, glucosinolate biosynthesis and selenium accumulation in T. majus and A. caucasica transformed roots producing Phe-derived glucotropaeolin and Met-derived glucoiberverin, respectively. Gradual decrease in glucosinolate production, more significant in glucoiberverin, was correlated both with the decrease in sulfate and increase in selenate concentrations and with increasing Se accumulation in the biomass of the roots. Both T. majus and A. caucasica transformed roots accumulated high amounts of Se in biomass, up to 2177 ± 81.7 µg·g⁻¹ DM and 3110 ± 97.4 µg·g⁻¹ DM, respectively, in the media with sulfate 0.5; 0 mM/selenate 2.5 mM ratios. In transformed roots cultured at sulfate 1.5; 1; 0.5; 0 mM/selenate 0.75; 1; 1.5; 2; 2.5; 3 mM ratios accumulation of Se into glucosinolate fractions occurred, it reached the maxima at sulfate 0.5 mM/selenate 2.5 mM ratio. In T. majus roots Se accumulation in glucosinolate fraction was by about 50% lower than in A. caucasica ones. These results indicated that selenium enriched hairy roots of T. majus and A. caucasica could be fully controlled sources of both glucosinolates and selenium as supplements for cancer chemoprevention.
PL
Badano wpływ 50 kombinacji stosunku siarczanu/selenianu w zakresie 2; 1,5; 1; 0,5; 0 mM/0,125; 0,25; 0,375; 0,5; 0,75; 1; 1,5; 2; 2,5; 3 mM na przyrost biomasty, produkcję glukozynolanów i akumulację selenu w korzeniach transformowanych T. majus i A. caucasica produkujących odpowiednio pochodzącą od Phe-glukotropeolinę i pochodzącą od Met-glukoiberwerynę. Stopniowy spadek produkcji glukozynolanów, wyższy dla glukoiberweryny, skorelowany był zarówno ze spadkiem stężenia siarczanu i wzrostem stężenia selenianu w podłożach, jak i z rosnącą akumulacją Se w biomasie korzeni. Korzenie transformowane, zarówno T. majus jak i A. caucasica, akumulowały duże ilości Se w biomasie, dochodzące do odpowiednio 2177 ± 81,7 µg·g⁻¹ SM i 3110 ± 97,4 µg·g⁻¹ SM na podłożach, w których stosunek siarczanu/selenianu wynosił 0,5; 0 mM/2,5 mM. W korzeniach transformowanych hodowanych na podłożach ze stosunkiem siarczan 1,5; 1; 0,5; 0 mM/selenian 0,75; 1; 1,5; 2; 2,5; 3 mM następowała akumulacja Se we frakcjach glukozynolanowych, osiągająca maksimum przy stosunku siarczanu 0,5 mM : selenianu 2,5 mM. Akumulacja Se we frakcji glukozynolanowej korzeni T. majus była o około 50% niższa niż we frakcji glukozynolanowej korzeni A. caucasica. Uzyskane wyniki sugerują, że wzbogacone w selen korzenie transformowane T. majus i A. caucasica mogłyby być w pełni kontrolowanym źródłem równocześnie glukozynolanów i selenu jako suplementów dla chemoprewencji kancerogenezy.
first rewind previous Strona / 2 next fast forward last
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.