Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

An automated classification of HEp-2 cellular shapes using Bag-of-keypoint features and Ant Colony Optimization

Devanathan Kanchana, Ganesan Kavitha, Swaminathan Ramakrishnan

Biocybernetics and Biomedical Engineering

|

2021

|

Vol. 41, no. 2

376--390

EN

In this study, an attempt has been made to differentiate HEp-2 cellular shapes using Bag-of keypoint features and optimization. For this, the images are considered from a publicly available database. To increase the cell structure visibility, the images are pre-processed using edge-sensitive local contrast enhancement. Further, the Speeded-up Robust Feature (SURF) keypoints are extracted and Bag-of-keypoints for each shape are generated. These features are subjected to Ant Colony Optimization (ACO) algorithm for feature selection. The optimal features obtained are then fed to Support Vector Machine (SVM) and k-Nearest Neighbour (kNN) classifiers. Results show that the ACO algorithm can identify the optimal features that characterize the cellular shapes. SVM and kNN are able to differentiate between the shapes with an average classification accuracy of 93.6% and 94.8% respectively. Since differential diagnosis of HEp-2 cellular shapes is significant in the disease-specific prognosis and treatment, this study seems to be clinically relevant.

2

Identification of HEp-2 specimen images with mitotic cell patterns

Gupta Krati, Bhavsar Arnav, Sao Anil K.

Biocybernetics and Biomedical Engineering

|

2020

|

Vol. 40, no. 3

1233--1249

EN

In this paper, we propose and analyze a novel framework to identify the HEp-2 specimen images, consisting of mitotic spindle (MS) pattern cells. It is based on the fact that the cells showing MS patterns will always be present with other interphase type pattern cells, in a whole slide image (WSI) or specimen image, but the number of MS cells will be very small, unlike interphase patterns. Considering this fact, the work contributes in presenting a framework, using different strategies such as cells-based, region-based and complete image-based approaches. For cell-based approach, the distinctive characteristic of MS patterns is represented using morphology and texture-based features, followed by a traditional Support Vector Machine (SVM) based classifier, whereas the region-based approach uses a Convolutional Neural Network (CNN) as feature extractor and baseline classifier. Finally, for the image-based approach, the Faster Region-CNN (Faster-RCNN) based object detection framework has been applied, considering MS patterns as distinct objects. The region and image-based approaches also contribute in avoiding the requirement of DAPI based segmentation masks. Another contribution of this work is to use a novel and clearly specified threshold-based decision-making criteria for patterns declaration of the specimens with MS pattern cells. All the proposed strategies, integrated with decision-making criteria are validated on a publicly available dataset and across various experiments, we demonstrate good performance, i.e., max. MCC 0.92 in one case. Hence, the proposed framework proves to be an effective solution for the problem statement.

3

Znaczenie diagnostyczne wybranych autoprzeciwciał w chorobach układowych tkanki łącznej

Zińczuk J., Motybel-lwańczuk E., Matowicka-Karna J.

Laboratorium Medyczne

|

2018

|

nr 4

26--31

PL

Choroby autoimmunologiczne należą do chorób przewlekłych o zróżnicowanej, często niewyjaśnionej etiologii o podłożu autoimmunizacyjnym i powstają wskutek nieprawidłowej odpowiedzi immunologicznej skierowanej przeciwko własnym antygenom. Antygeny stymulują wytwarzanie autoprzeciwciał, które wiążąc się z nimi, prowadzą do uszkodzenia komórek i tkanek organizmu. W efekcie dochodzi do rozwoju szeregu chorób o szerokim spektrum objawów, których podstawą rozpoznania jest stwierdzenie w surowicy chorego przeciwciał typowych dla danej jednostki. Przeciwciała te mają dużą wartość diagnostyczną i prognostyczną i pozwalają wnioskować o ciężkości przebiegu choroby.

EN

Autoimmune diseases belong to the group of chronic diseases with diversified, often unexplained, autoimmune aetiology and develop as a result of an abnormal immune response against the body's own antigens. The antigens stimulate the production of autoantibodies, which bind with them and lead to the damage of the cells and tissues of the body. The result is the development of a number of diseases of a broad spectrum of symptoms. ln order to diagnose these diseases, it is necessary to determine antibodies specific to a given disease in a patient's serum. These antibodies have a high diagnostic and prognostic value and enable to conclude on the severity of the course of the disease.

4

Celiaklia

Motybel-lwańczuk E., Zińczuk J., Matowicka-Karna J.

Laboratorium Medyczne

|

2018

|

nr 4

32--36

PL

Celiakia, choroba trzewna, jest najczęściej występującą chorobą o podłożu autoimmunologicznym, w której czynnikiem indukującym procesy chorobowe jest gluten. Dotychczas choroba była kojarzona z okresem wieku dziecięcego, z remisją kliniczną choroby w czasie dojrzewania. Obecnie około 60% nowych przypadków jest rozpoznawanych u osób dorosłych, w tym nawet 20% wykrywanych przypadków dotyczy pacjentów po 60 r.ż. Zdecydowanie częściej na celiakię chorują kobiety, stanowiąc ok. 70% wszystkich chorych. W ostatnich latach zaobserwowano także zmianę przebiegu klinicznego choroby na postać nietypową, z przewagą objawów spoza układu pokarmowego. Prawidłowe postawienie diagnozy oraz szybkie wprowadzenie leczenia wpływają na stan zdrowia i dalsze życie chorego.

EN

Coeliac disease is the most common autoimmune disease in which gluten is the factor inducing disease processes. So far, the disease has been associated with childhood, with its clinical remission during adolescence. Currently, about 60% of new cases are being diagnosed in adults, including up to 20% of detected cases in patients over 60 years of age. Women suffer from coeliac disease more often, accounting for about 70% of all patients. ln recent years, a change in the clinical course of the disease has been also observed - to its atypical or oligosymptomatic form, with the prevalence of non-gastrointestinal symptoms. Correct diagnosis and the rapid introduction of treatment affect a patient's health and their further life.

5

Infekcje bakteryjne - czy mogą być źródłem schorzeń autoimmunologicznych człowieka?

Bugla-Płoskońska G., Futoma-Kołoch B.

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

|

2009

|

nr 5

36--38

PL

Mimikra molekularna dotyczy zjawiska homologii i podobieństwa strukturalnego, serologicznego i funkcjonalnego pomiędzy antygenami drobnoustrojów a tkankami organizmu wyższego. Uznawana jest za ważny czynnik decydujący o patogenności drobnoustrojów, wpływający na rozwój pewnych chorób autoimmunologicznych. Analizy tego zjawiska bazują na obserwacji epidemiologicznych i klinicznych zależności pomiędzy obecnością czynników wirulencji bakterii a występowaniem pewnych chorób autoimmunologicznych.

EN

Molecular mimicry relates to structural, serological and functional homology and similarity between microbial antigens and host tissues. This homology is considered as an important pathogenic factor involved in several autoimmune diseases. The analysis of molecular mimicry is based on the observation of epidemiological and clinical dependence between the presence of bacteria's virulence factors and the occurrence of various autoimmune diseases.