Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

The study of interactions between FAD - flavin adenine dinucleotide and histidine

100%

Sabara D.

Zeszyty Naukowe. Politechnika Łódzka. Chemia Spożywcza i Biotechnologia

|

2008

|

tom 72

2

The Role of Histidine Residue in Coordination Abilities of Peptides with Multi Histidine Sequence Towards Nickel(II) Ions

88%

Matera A. , Brasuń J. , Cebrat M. , Świątek-Kozłowska J.

Polish Journal of Chemistry

|

2008

|

tom Vol. 82, nr 7

1367-1367

EN

Previous studies on the histidine rich pep tides-Cu2+ systems have shown very efficient coordination abilities and high termodynamic stability of the complexes formed. In this work the ability of histidine-rich peptides with Ni2+ ions are presented. The coordination abilities of the series of the N-protected (Ac-His-Arg-His-Gly-His-Gly, Ac-His-Gly-His-Arg-His-Gly, Ac-Gly-His-His-Arg-His-Gly, Ac-His-His-Gly-His-Arg-Gly) and unprotected peptides (His-Arg-His-Gly-His-Gly, His-Gly-His-Arg-His-Gly, Gly-His-His-Arg-His-Gly, and His-His-Gly-His-Arg-Gly) towards Ni2+ ions were studied by spectroscopic (UV/VIS, CD) and potentiometric methods. For the N-protected peptides the dominant complex species with {3Nim} in physiological pH range has been determined, while for the unprotected peptides the coordination of the first amide nitrogen takes place. More over, for the Ni2+-peptide systems the complexes with two geometries were determined: the paramagnetic octahedral species within the acidic pH range and the diamagnetic square-planar species at pH exceeding 7.

3

Polihistydylowe sekwencje z motywem His-tag – ich rola i biologiczne znaczenie oddziaływania z jonami metali

63%

Wątły J. , Kozłowski H.

Wiadomości Chemiczne

|

2016

|

tom [Z] 70, 11-12

1--24

EN

His-tags are specific sequences containing six to nine subsequent histydyl residues and they are used commercially in immobilized metal affinity chromatography (IMAC) as molecular ‘anchors’ that bind to a metal ion (usually nickel), immobilized by chelation with nitrilotriacetic acid (NTA) bound to a solid support [37, 38]. Consecutive histidines are the common denominator for both His-tags used in molecular biology and for quite remote biological phenomena – more than 2000 histidine- rich proteins (HRPs) are found in microorganisms including 60% and 82% of archaeal and bacterial species, respectively and their roles are not well characterized [73]. The physicochemical properties of histidine make it a versatile amino acid that influences protein conformation and enzymatic activity [15]. Many natural proteins with a His-tag domain are assigned to different functions, for example: most bacterial proteins, containing this motif are probably involved in the homeostasis of nickel ions [68, 76], while others, e.g. newly isolated peptides from the venom of the snake genus Atheris contain poly-histidyl-poly-glycyl sequences (pHpG) can act on the cardiovascular system by inhibiting snake venom metalloproteinases and affect its function by acting on specific receptors [58, 62]. His-rich motifs have been found also e.g. in Zn2+ transporters, prion proteins, His-rich glycoproteins, transcription factors or numerous copper-binding proteins [56, 67, 84]. Binding mode and the thermodynamic properties of the system depends on the specific metal ion and the histidine sequence. Despite the wide application of the His-tag for purification of proteins, little is known about the properties of metalbinding to such tag domain. Recent experimental and theoretical studies have shown that metal ions, e.g. Cu2+ can bind to various sets of imidazoles depending on the number of histidine residues that are located in His-rich sequences. The occurrence of polymorphic binding states and the formation of an α-helical structure induced by metal ion coordination suggest that proteins with a His-tag domain may serve as the dynamic site able to ‘move’ metal ions along the tag sequence [99, 100]. This might explain the frequent occurrence of such sequences in bacterial Ni2+ chaperones, which transfer the metal ion between different proteins.

4

Objawy pseudoalergii a zaburzenia metabolizmu histaminy

63%

Kacik J. , Wawrzyniak A. , Rakowska M. , Kalicki B.

Pediatria i Medycyna Rodzinna

|

2016

|

tom 12

|

nr 3

234-241

EN

Histamine intolerance is a poorly investigated type of hypersensitivity responsible for a number of often serious symptoms, erroneously interpreted as food allergy. Endogenous histamine originates from the histidine amino acid with the help of the histidine decarboxylase enzyme. Apart from the endogenous production histamine may be supplied to the body with food. Slow-maturing and fermenting products are characterised by particularly high levels of histamine. Some food products stimulate excessive release of histamine from stores in the body as well as containing significant amounts of it. These products include spices, herbs, dried fruits and a large group of food additives. Histamine intolerance is considered to be a condition in which the amount of histamine in the body exceeds its tolerance threshold, which leads to the development of adverse reactions. These reactions primarily include skin symptoms (pruritus, urticaria, skin reddening, acne lesions), angioedema, respiratory symptoms (nasal obstruction and watery discharge, sneezing, coughing, wheezing), gastrointestinal symptoms (abdominal cramps, diarrhoea, bloating), nervous system symptoms (headaches, fatigue, irritability, anxiety, panic attacks), cardiovascular symptoms (tachycardia, hypotension, chest pain), primary dysmenorrhoea and many more. It is estimated that nearly 1% of society is susceptible to histamine intolerance. The diagnosis of this disorder is based on observing at least two characteristic symptoms and their disappearance or improvement following histamine-free diet. A new, although not easily accessible diagnostic tool is assay for serum diamine oxidase activity, which correlates to a significant extent with symptoms of histamine intolerance. Normal activity of diamine oxidase is considered to be the amount of >80 HDU/mL, decreased activity – 40–80 HDU/mL and severely decreased activity – <40 HDU/mL. Currently the option of diamine oxidase supplementation is being considered as prevention for patients with the decreased activity of this substance.

PL

Nietolerancja histaminy stanowi mało poznany typ nadwrażliwości, odpowiedzialny za szereg często poważnych objawów, mylnie interpretowanych jako alergia pokarmowa. Endogenna histamina powstaje z aminokwasu histydyny przy udziale enzymu dekarboksylazy histydyny. Poza endogenną produkcją histaminy amina ta może być dostarczana do organizmu wraz z pożywieniem. Szczególnie dużą zawartością histaminy charakteryzują się produkty długo dojrzewające i fermentujące. Niektóre produkty spożywcze poza znaczną zawartością histaminy stymulują również nadmierne jej uwalnianie z magazynów w ustroju. Należą do nich przyprawy, zioła, suszone owoce, a także liczna grupa dodatków spożywczych. Za nietolerancję histaminy uznaje się stan, w którym ilość histaminy w ustroju przekracza próg tolerancji organizmu, co prowadzi do rozwoju niepożądanych objawów. Wśród nich wymienia się przede wszystkim: objawy skórne (świąd, pokrzywka, zaczerwienienie skóry, zmiany trądzikowe), obrzęk naczynioruchowy, objawy ze strony układu oddechowego (obturacja i wodnisty wyciek z nosa, kichanie, kaszel, świszczący oddech), pokarmowego (kurcze brzucha, biegunka, wzdęcia), nerwowego (bóle głowy, zmęczenie, rozdrażnienie, niepokój, napady lęku), krwionośnego (tachykardia, hipotensja, ból w klatce piersiowej), pierwotne bolesne miesiączkowanie i wiele innych. Szacuje się, że prawie 1% społeczeństwa wykazuje skłonność do nietolerancji histaminy. Rozpoznanie tego zaburzenia opiera się na stwierdzeniu co najmniej dwóch charakterystycznych objawów oraz ich ustępowania bądź złagodzenia po zastosowaniu diety eliminującej histaminę z pożywienia. Nowym, aczkolwiek trudno dostępnym narzędziem w diagnostyce jest oznaczanie osoczowej aktywności oksydazy diaminowej, która w znaczący sposób koreluje z występowaniem objawów nietolerancji histaminy. Za fizjologiczną aktywność oksydazy diaminowej uważa się wartość >80 HDU/ml, za obniżoną – 40–80 HDU/ml, za bardzo obniżoną – <40 HDU/ml. Obecnie rozważa się możliwość wprowadzenia suplementacji oksydazy diaminowej jako metody profilaktycznej u pacjentów z obniżoną jej aktywnością.

5

Short Peptides in Minimalistic Biocatalyst Design

63%

Duncan K. L. , Ulijn R. V.

Biocatalysis

|

2014

|

tom 1

|

nr 1

EN

We review recent developments in the use of short peptides in the design of minimalistic biocatalysts focusing on ester hydrolysis. A number of designed peptide nanostructures are shown to have (modest) catalytic activity. Five features are discussed and illustrated by literature examples, including primary peptide sequence, nanosurfaces/scaffolds, binding pockets, multivalency and the presence of metal ions. Some of these are derived from natural enzymes, but others, such as multivalency of active sites on designed nanofibers, may give rise to new features not found in natural enzymes. Remarkably, it is shown that each of these design features give rise to similar rate enhancements in ester hydrolysis. Overall, there has been significant progress in the development of fundamental understanding of the factors that influence binding and activity in recent years, holding promise for increasingly rational design of peptide based biocatalysts.

6

Modulation of calcium uptake by exogenous amino acids, in Phaseolus vulgaris seedlings

63%

Rana U. , Rai V. K.

Acta Physiologiae Plantarum

|

1996

|

tom 18

|

nr 2

7

Fragile histidine triad (FHIT) gene is overexpressed in colorectal cancer

51%

Wierzbicki P. M. , Adrych K. , Kartanowicz D. , Dobrowolski S. , Stanislawowski M. , Chybicki J. , Godlewski J. , Korybalski B. , Smoczynski M. , Kmiec Z.

Journal of Physiology and Pharmacology. Supplement

|

2009

|

tom 60

|

nr 4

8

The potential role of Kruppel-like zinc-finger protein glis3 in genetic diseases and cancers

51%

Chou C.-K. , Tang C.-J. , Chou H.-L. , Liu C.-Y. , Ng M.-C. , Chang Y.-T. , Yuan S.-S. F. , Tsai E.-M. , Chiu C.-C.

Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis

|

2017

|

tom 65

|

nr 5

9

Rola bakterii halofilnych w procesie dekarboksylacji histydyny w rybach solonych

51%

Peconek J. , Szczawinski J. , Fonberg-Broczek M. , Sawilska-Rautenstrauch D. , Windyga B.

Roczniki Państwowego Zakładu Higieny

|

1997

|

tom 48

|

nr 2

139-143

PL

Badano zdolność wytwarzania histaminy w pożywkach bakteryjnych, do których dodawano homogenaty ze śledzi solonych poddanych soleniu mocnemu i przechowywaniu przez 2 miesiące w temp. 200C. Ze śledzi solonych dostępnych w sprzedaży detalicznej izolowano szczepy bakterii halofilnych, a następnie określano w warunkach modelowych ich zdolności do dekarboksylacji histydyny.

EN

The purpose of this study was to determine frequency of occurrence of halotolerant and halophilic histamine-forming bacteria under laboratory conditions in salted herrings stored at 20°C for 2 months. The other aim was to isolate these bacteria both from herrings bought in a retail shop and examine the ability of decarboxylation of histidine by these microorganisms using Karnop's method modified by the authors. The amount of histamine formed was determined by fluorometric method. The level of histamine in media containing homogenates of herrings was in a range from 5 to 1950 µg/100 ml of a nutrient medium. All isolated bacteria belong to halotolerant and halophilic strains and produce histamine both at 8% and 20% content of NaCl in a nutrient medium. The obtained results indicate that during storage of salted herrings at ambient temperature the increase of histamine content in their flesh can occur.

10

Beyond sequence similarity – the curious case of GW/WG protein domain

51%

Karlowski W. M.

BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology

|

2011

|

tom 92

|

nr 4

11

The study of interactions between FAD - flavin adenine dinucleotide and histidine

51%

Sabara D.

Zeszyty Naukowe. Chemia Spożywcza i Biotechnologia / Politechnika Łódzka

|

2008

|

tom Z. 72

63-71

EN

In view of the fact that one of the amino acids, histidine, performs an important role in the interactions with flavin adenine dinucleotide (FAD) in the catalytic center of glucose oxidase (GOD), we performed an investigation if interactions between FAD and histidine. The theoretical approach indicates the stacked conformation of FAD, in which the isoalloxazine and adenine ring couple with each other, and an extended - unstacked conformation. Formation of the complex was studied using fluorescence method and computer modeling in order to define the geometrical parameters of the hydrogen bond formation by means of the semi-empirical method (AM1, PM3). The possible distances, angles and stretch vibrations were supported by fluorescence lifetime decay and the Gibbs free energy of the complex.

PL

W pracy opisano badania oddziaływań pomiędzy dinukleotydem flawinoadeninowym a histydyną. Jeden z aminokwasów - histydyna odgrywa ważną rolę w oddziaływaniu z dinukleotydem flawinoadeninowym znajdującym się w centrum aktywnym oksydazy glukozowej (GOD). Teoria potwierdza istnienie dwóch konformacji dinukleotydu flawinoadeninowego; zamkniętej, w której pierścienie adeninowy i izoaloksazynowy reagują ze sobą oraz otwartej - liniowej. Tworzenie kompleksu pomiędzy FAD a histydyną zbadano metodami fluorescencyjnymi oraz przy użyciu optymalizacji komputerowej w celu zdefiniowania parametrów wiązania wodorowego (AM1, PM3). Określenie możliwych interakcji i konfiguracji molekuł zostało wsparte fluorescencyjnymi pomiarami czasów życia oraz wyliczeniem energii Gibbsa powstałego kompleksu.

12

New insights into the signaling and function of cytokinins in higher plants

51%

Ciesielska A. , Ruszkowski M. , Kasperska A. , Femiak I. , Michalski Z. , Sikorski M. M.

BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology

|

2012

|

tom 93

|

nr 4

13

Histamine in the central nervous system: its role in circadian rhythmicity

51%

Nowak J. Z.

Acta Neurobiologiae Experimentalis

|

1994

|

tom 54

|

nr S

14

KID, an interactive kinase inhibitor database

51%

Collin O. , Legoff M. , Meijer L.

Cellular and Molecular Biology Letters

|

1998

|

tom 03

|

nr 3

15

Structure of cell envelope components of the primary and secondary forms of Xenorhabdus luminescens

44%

Popowska M. , Pancer K. , Markiewicz Z.

Acta Microbiologica Polonica

|

1997

|

tom 46

|

nr 1

16

Alzheimer's beta-amyloid peptide as a source of neurotoxic free radicals: the role of structural effects

44%

Pogocki D.

Acta Neurobiologiae Experimentalis

|

2003

|

tom 63

|

nr 2

17

The effect of lead on dopamine, GABA and histidine spontaneous and KCI-dependent releases from rat brain synaptosomes

44%

Struzynska L. , Rafalowska U.

Acta Neurobiologiae Experimentalis

|

1994

|

tom 54

|

nr 3

18

Wplyw kwasu glutaminowego,histydyny i argininy na spozycie diety.Sklad chemiczny oraz przyrosty masy ciala szczurow

32%

Walczewska B. , Trzewikowska M.

Roczniki Państwowego Zakładu Higieny

|

1993

|

tom 44

|

nr 2-3

181-189

PL

Prześledzono wpływ kwasu glutaminowego, histydyny i argininy na spożycie diet, przyrosty i skład chemiczny masy ciała 30-dniowych samców szczurzych szczepu Wistar. Źródłem białka w dietach była kazeina. Do diet dodano jeden z badanych aminokwasów w ilości 5g/100g diety. Dodatek tych aminokwasów spowodował istotne obniżenie spożycia diet, przyrostu masy ciała i jego składników, tj. wody, białka, tłuszczu i popiołu. Dodatek histydyny do diety powodował obniżenie stosunku azotu do wody w ciele, co świadczyło o opóźnieniu chemicznego dojrzewania tkanek, równocześnie ze zmniejszeniem procentowej zawartości tłuszczu w ciele.

EN

100 male rats, aged 30 ± 1 days were investigated by means of 28 days study. The influence of the supplementation of glutaminie acid, histidine and arginine to the diet on dietary intake, weight gain and chemical composition was determinated. It was casein that was used as the source of protein. We investigated the application of 4 kinds of diet during each experiment and the composition of the diets was based on the Miller-Bend non-protein diet model. 100 male rats, aged 30 ± 1 days were investigated by means of 28 days study. The influence of the supplementation of glutaminie acid, histidine and arginine to the diet on dietary intake, weight gain and chemical composition was determinated. It was casein that was used as the source of protein. We investigated the application of 4 kinds of diet during each experiment and the composition of the diets was based on the Miller-Bend non-protein diet model.