Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

50 lat Biura Urządzania Lasu i Geodezji Leśnej w służbie polskiego leśnictwa

100%

Szempliński A. , Rudzki K. , Barszczewski W. , Musiał J.

Przegląd Geodezyjny

|

2007

|

tom R. 79, nr 12

17-24

2

RAPD jako metoda roznicowania i identyfikacji drozdzy

100%

Robak M. , Baranowska K. , Barszczewski W. , Wojtatowicz M.

Biotechnologia

|

2005

|

nr 4

142-155

3

Kierunki rozwoju technologicznego i technicznego urzadzania lasu

100%

Barszczewski W. , Haczek K. , Konieczny A. , Zajaczkowski S.

Postępy Techniki w Leśnictwie

|

1998

|

tom 66

45-51

4

Yarrowia lipolytica cell cycle study

100%

Mitula A. , Barszczewski W. , Robak M.

Electronic Journal of Polish Agricultural Universities. Series: Biotechnology

|

2010

|

tom 13

|

nr 2

5

Porównanie metod ekstrakcji DNA z komórek różnych gatunków drożdży

88%

Piegza M. , Barszczewski W. , Juszczyk P. , Wojtatowicz M. , Robak M.

Acta Scientiarum Polonorum. Biotechnologia

|

2011

|

tom 10

|

nr 1

PL

W diagnostyce mikrobiologicznej coraz częściej stosowane są metody oparte na powieleniu DNA. Jednym z czynników ograniczającym amplifikację fragmentów genomu jest metoda ekstrakcji DNA. Dlatego celem pracy było porównanie trzech metod ekstrakcji genomowego DNA z komórek szczepów drożdży: Yarrowia lipolytica, Geotrichum candidum, Rhodotorula rubra, Saccharomyces cerevisiae, Candida famata, Candida guilliermondii oraz Schizosaccharomyces pombe. Skuteczność ekstrakcji oceniano na podstawie obecności produktu amplifikacji fragmentu rDNA zawartego pomiędzy sekwencjami komplementarnymi do pary primerów: NS3 i ITS4. Stosując do izolacji DNA najprostszą metodę ekstrakcji (metoda A), nie otrzymano produktu PCR w przypadku szczepów z trzech gatunków. Metoda Hoffmanna (metoda C) umożliwiła uzyskanie ze wszystkich badanych izolatów wystarczającej ilości DNA i otrzymanie produktu PCR wybranego fragmentu genu rRNA. W odniesieniu do szczepów z gatunku G. candidum pozytywne wyniki otrzymano także przy zastosowaniu metody opartej na termicznej lizie komórek (metoda B). Wykazano, że zastosowana metoda nie ma wpływu na wielkość powielanego fragmentu rDNA.

EN

Recently, increased usage of methods based on DNA amplification in microbial diagnostics is observed. One of the limiting factors of these methods is the extraction of DNA. The aim of this paper was to compare three extraction methods of DNA from yeast cells of Yarrowia lipolytica, Geotrichum candidum, Rhodotorula rubra, Saccharomyces cerevisiae, Candida famata, Candida guilliermondii and Schizosaccharomyces pombe. The effectiveness of extraction method was estimated by the presence of rDNA fragment amplified with NS3 and ITS4 primers. In case of the simplest method of DNA isolation (method A) no PCR products were detected for strains of three tested species. Hoffman’s method ( method C) allowed to receive enough DNA and to obtain appropriated products in PCR for all tested isolates. In the case of G. candidum strains the positive results were obtained for thermal lysis of the cells (method B). It was confirmed that the method of DNA extraction had no influence on size of amplified region of rDNA.

6

Mikroflora drożdżowa naturalnie fermentowanych warzyw

88%

Lazar Z. , Piegza M. , Walczak E. , Barszczewski W. , Robak M.

|

nr 1

PL

W prezentowanej pracy postanowiono ustalić, które gatunki drożdży zasiedlają domowe fermentowane produkty: kiszone ogórki, kiszoną kapustę oraz kiszone mieszane warzywa. Z wybranych do badań kiszonek wyizolowano 75 szczepów drożdży, które identyfikowano na podstawie o testu API (bioMerieux), amplifikacji wybranych regionów genów rDNA (NS3-ITS4) i analizy restrykcyjnej oraz skanowania genomu w poszukiwaniu sekwencji mikrosatelitarnych. Za dominującą mikroflorę wszystkich kiszonych produktów uznano drożdże Saccharomyces cerevisiae (38,7% izolatów) i Yarrowia lipolytica (25,6% izolatów). Z kiszonych produktów wyizolowano także szczepy należące do następujących gatunków: Pichia etchellsii, P. ohmerii, Candida holmii, C. pelliculosa i Shizosaccharomy- cesjaponicus. Wykorzystując API 32C, niektóre izolaty zidentyfikowano tylko do rodzaju, a z uwagi na ubogie bazy danych szczepów wzorcowych nie wszystkie izolaty udało się jednoznacznie zidentyfikować na poziomie gatunku technikami molekularnymi. Wyniki badań pozwoliły na rozbudowanie tworzonej bazy danych o nowe szczepy drożdży (szczepy o odmiennych profilach restrykcyjnych), co w przyszłości powinno ułatwić prowadzenie prac identyfikacyjnych.

EN

This research aims at determining which yeast types can be encountered in the following home products: pickled cucumbers, sauerkraut and mixed pickled vegetables. Seventy-five strains of yeast have been isolated from the pickles selected for the research. These strains have been identified on the basis of API tests (bioMerieux), amplification of the selected regions of rDNA genes (NS3-ITS4) and restrictive analysis, as well as genome scanning, performed in order to detect microsatellite sequences. Yeast Saccharomyces cer- evisiae (38.7% isolates) and Yarrowia lipolytica (25.6% isolates) have been determined as a dominant microflora for the pickles. There have been also isolated strains belonging to the following types: Pichia etchellsii, P. ohmerii, Candida holmii, C. pelliculosa and Shizo- saccharomyces japonicus. With the use of API 32C, some isolates have been identified merely in accordance to their type, and due to a limited data base of model strains, not all the isolates have been possible to be classified on the level on their type with the support of molecular techniques. The obtained results of the research allowed to supply the database with new yeast strains (strains of different restrictive profiles), which should consequently facilitate conducting the identifying works.