Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

Epidemiology and damage caused by stem canker of oilseed rape in Poland

100%

Jedryczka M.

Phytopathologia Polonica

|

2007

|

tom 45

2

Identification of minisatellite DNA markers for quantitative traits loci in geese

100%

Zawadzka M. , Jaszczak K. , Rabsztyn A.

Animal Science Papers and Reports

|

2001

|

tom 19

|

nr 1

3

Polymorphism of ten new minisatellite markers in subpopulations of phytopathogenic fungus Leptosphaeria maculans differing with metconazole treatment

80%

Jedryczka M. , Irzykowski W. , Jajor E. , Korbas M.

|

nr 1

103-109

EN

Stem canker of brassicas is one of the most damaging diseases of oilseed rape worldwide. The disease is caused by two related Leptosphaeria species, and L. maculans is regarded as the more damaging one. Being an ascomycete, the pathogen is able to quickly create new variants that can overcome new resistance genes introduced by researchers and breeding companies. The aim of this work was to study polymorphism of L. maculans populations using 10 recently developed minisatellite markers. The studied subpopulations differed with metconazole treatment. Seven minisatellite markers showed polymorphisms and formed alleles varying from 2 to 10 different core motifs, with 5 alleles on average. In total 36 alleles were found. The majority of alleles (72%) were found in both studied subpopulations of L. maculans. There were 28 alleles in the group of L. maculans isolates originating from plants not treated with any fungicide and 32 in the subpopulation treated with metconazole. Ten unique alleles and imbalanced ratios between some alleles contributed to differences between L. maculans subpopulations. The minisatellites MinLm555, MinLm935-2, MinLm939, MinLm1139 and MinLm2451 showed 6 new variants as compared to the isolates described so far.

PL

Sucha zgnilizna kapustnych stanowi jedną z najgroźniejszych chorób rzepaku na świecie. Jej przyczyną są dwa spokrewnione gatunki rodzaju Leptosphaeria, przy czym L. maculans powoduje większe straty plonu nasion. Przynależność do workowców umożliwia szybkie tworzenie nowych wariantów patogena, zdolnych do przełamania genów odporności. Celem pracy było oznaczenie polimorfizmu w obrębie populacji L. maculans, przy zastosowaniu dziesięciu nowych markerów minisatelitarnych. Badane subpopulacje patogena różniły się pod względem ich traktowania preparatem grzybobójczym zawierającym metkonazol. W zestawie badanych markerów minisatelitarnych 7 wykazało polimorfizm i tworzyło od 2 do 10 alleli - średnio 5 alleli. Sumaryczna liczba wariantów wynosiła 36, przy czym 28 alleli znaleziono w grupie izolatów L. maculans wyodrębnionych z roślin nie traktowanych żadnymi fungicydami, natomiast w subpopulacji z rzepaku traktowanego metkonazolem stwierdzono występowanie 32 alleli. Do zróżnicowania badanych subpopulacji przyczyniło się 10 unikalnych alleli obecnych wyłącznie w jednej grupie izolatów oraz zróżnicowanie procentowego udziału niektórych alleli. Wśród produktów PCR otrzymanych dla markerów minisatelitarnych MinLm555, MinLm935-2, MinLm939, MinLm1139 oraz MinLm2451 stwierdzono występowanie sześciu nowych wariantów, nie znalezionych w dotychczas badanych izolatach grzyba L. maculans.

4

Frekwencja alleli minisatelitarnego markera MinLm1 w trzech kolekcjach chorobotwórczego grzyba Leptosphaeria maculans z terenu Polski

60%

Jedryczka M. , Stachowiak A. , Wesolowska I. , Irzykowski W.

Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych

|

2010

|

tom 555

PL

Grzyb workowy Leptosphaeria maculans jest jednym z najgroźniejszych patogenów rzepaku na świecie, przyczyniających się do znacznych strat ekonomicznych. Poznanie sekwencji genomu L. maculans umożliwiło wyodrębnienie licznych sekwencji mini- (MinLm) i mikrosatelitarnych (Lema). Ustalenie zakresu zmienności tych sekwencji oraz frekwencji poszczególnych alleli umożliwia charakteryzowanie i porównywanie populacji L. maculans występujących w różnych latach i regionach geograficznych. Badania dotyczyły porównania frekwencji alleli minisatelitarnego markera MinLm1 w trzech kolekcjach izolatów L. maculans zgromadzonych na terenie Polski w latach 2000-2002 (kolekcja KBN, 94 izolaty), 2003-2004 (kolekcja SECURE, 186 izolatów) oraz 2005 (kolekcja WLKP, 24 izolaty). Udział poszczególnych alleli w danej populacji określono metodą PCR i rozdziału produktów w żelu agarozowym w obecności markerów wewnętrznych o znanej wielkości lub poprzez porównanie ze standardami o znanej wielkości i sekwencji DNA. W kolekcjach stwierdzono obecność siedmiu alleli (od 1x do 7x). Wykazano malejący udział allelu 2x, którego frekwencja co roku zmniejszała się średnio o ok. 8,5%, gdy tymczasem udział allelu 5x co roku średnio rósł o ok. 8%. W kolekcji z terenu Wielkopolski zebranej w 2005 roku stwierdzono jedynie 8,3% udział allelu 2x, który często występował w populacjach zgromadzonych w latach 2000-2004 i stanowił średnio 30,4% izolatów. Taki wynik sugeruje znaczne zmiany zachodzące w składzie populacji L. maculans porażającej rzepak w naszym kraju.

EN

The ascomycete fungus Leptosphaeria maculans is one of the most damaging pathogens of oilseed rape in the world, causing considerable economic losses. Recent sequencing of L. maculans genome allowed the detection of numerous sequences of mini- (MinLm) and microsatellites (Lema). The knowledge of the range of polymorphism and the frequency of particular alleles allows to characterize L. maculans populations from different years and geographic regions. The comparison of the frequency of MinLml minisatellite alleles done in this study concerned three L. maculans populations gathered from infected oilseed rape plants in 2000-2002 (KBN collection, 94 isolates), 2003-2004 (SECURE collection, 186 isolates) and 2005 (WLKP collection, 24 isolates). The percent of alleles in a particular population was calculated on the basis on PCR reaction followed by product separation in agarose gels, with internal size markers or comparison with the standards of the known size and DNA sequence. Seven alleles (from 1x to 7x) were found in the studied collections. The decreasing frequency of 2x allele was observed with the mean rate of 8.5% peryear, whereas 5x allele with increased frequency of 8% per year, on average. In the collection gathered from Wielkopolska region in 2005 allele 2x was found in only 8.3% isolates, contrary to the populations collected in the years 2000-2004, accounting for 30.4% of the isolates, on average. Such result suggests considerable changes in the population of L. maculans infecting oilseed rape in Poland.