Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

Nowa wersja platformy, zawierająca wyłącznie zasoby pełnotekstowe, jest już dostępna.
Przejdź na https://bibliotekanauki.pl

Ograniczanie wyników

1 Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych

1 2010

Znaleziono wyników: 1

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: markery minisatelitarne

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Frekwencja alleli minisatelitarnego markera MinLm1 w trzech kolekcjach chorobotwórczego grzyba Leptosphaeria maculans z terenu Polski

100%

Jedryczka M. , Stachowiak A. , Wesolowska I. , Irzykowski W.

tom 555

Grzyb workowy Leptosphaeria maculans jest jednym z najgroźniejszych patogenów rzepaku na świecie, przyczyniających się do znacznych strat ekonomicznych. Poznanie sekwencji genomu L. maculans umożliwiło wyodrębnienie licznych sekwencji mini- (MinLm) i mikrosatelitarnych (Lema). Ustalenie zakresu zmienności tych sekwencji oraz frekwencji poszczególnych alleli umożliwia charakteryzowanie i porównywanie populacji L. maculans występujących w różnych latach i regionach geograficznych. Badania dotyczyły porównania frekwencji alleli minisatelitarnego markera MinLm1 w trzech kolekcjach izolatów L. maculans zgromadzonych na terenie Polski w latach 2000-2002 (kolekcja KBN, 94 izolaty), 2003-2004 (kolekcja SECURE, 186 izolatów) oraz 2005 (kolekcja WLKP, 24 izolaty). Udział poszczególnych alleli w danej populacji określono metodą PCR i rozdziału produktów w żelu agarozowym w obecności markerów wewnętrznych o znanej wielkości lub poprzez porównanie ze standardami o znanej wielkości i sekwencji DNA. W kolekcjach stwierdzono obecność siedmiu alleli (od 1x do 7x). Wykazano malejący udział allelu 2x, którego frekwencja co roku zmniejszała się średnio o ok. 8,5%, gdy tymczasem udział allelu 5x co roku średnio rósł o ok. 8%. W kolekcji z terenu Wielkopolski zebranej w 2005 roku stwierdzono jedynie 8,3% udział allelu 2x, który często występował w populacjach zgromadzonych w latach 2000-2004 i stanowił średnio 30,4% izolatów. Taki wynik sugeruje znaczne zmiany zachodzące w składzie populacji L. maculans porażającej rzepak w naszym kraju.

The ascomycete fungus Leptosphaeria maculans is one of the most damaging pathogens of oilseed rape in the world, causing considerable economic losses. Recent sequencing of L. maculans genome allowed the detection of numerous sequences of mini- (MinLm) and microsatellites (Lema). The knowledge of the range of polymorphism and the frequency of particular alleles allows to characterize L. maculans populations from different years and geographic regions. The comparison of the frequency of MinLml minisatellite alleles done in this study concerned three L. maculans populations gathered from infected oilseed rape plants in 2000-2002 (KBN collection, 94 isolates), 2003-2004 (SECURE collection, 186 isolates) and 2005 (WLKP collection, 24 isolates). The percent of alleles in a particular population was calculated on the basis on PCR reaction followed by product separation in agarose gels, with internal size markers or comparison with the standards of the known size and DNA sequence. Seven alleles (from 1x to 7x) were found in the studied collections. The decreasing frequency of 2x allele was observed with the mean rate of 8.5% peryear, whereas 5x allele with increased frequency of 8% per year, on average. In the collection gathered from Wielkopolska region in 2005 allele 2x was found in only 8.3% isolates, contrary to the populations collected in the years 2000-2004, accounting for 30.4% of the isolates, on average. Such result suggests considerable changes in the population of L. maculans infecting oilseed rape in Poland.