Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

Ten serwis zostanie wyłączony 2025-02-11.

Nowa wersja platformy, zawierająca wyłącznie zasoby pełnotekstowe, jest już dostępna.
Przejdź na https://bibliotekanauki.pl

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: dokowanie

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Molecular docking studies on the phytoconstituents as therapeutic leads against SARS-CoV-2

100%

Tiwari A. , Tiwari V. , Verma N. , Singh A. , Kumar M. , Saini V. , Sahoo B. M. , Kaushik D. , Verma R. , Sagadevan S.

tom Vol. 67, nr 7-8

355---374

Because of the present pandemic researchers are seeking for phytocandidates that can inhibit or stop SARS-CoV-2. The main protease (Mpro) of SARS-CoV-2 and spike glycoprotein (S) are both suppressed by bioactive compounds found in plants that work by docking them together. The Mpro proteins 6LU7 (complex with an inhibitor N3) and 5C3N (space group C2221) were employed in docking research. PyRx and AutoDock Vina software were used as docking engine. 22 identified phytoconstituents were selected from IMPPAT, a manually curated database, on the basis of their antiviral effects. Docking studies showed that phytoconstituents β-amyrin (-8.4 kcal/mol), withaferin A (-8.3 kcal/mol), oleanolic acid (-7.8 kcal/mol), and patentiflorin A (-8.1 kcal/mol) had the best results against 5C3N Mpro protein whereas kuwanon L (-7.1 kcal/mol), β-amyrin (-6.9 kcal/mol), oleanolic acid (-6.8 kcal/mol), cucurbitacin D (-6.5 kcal/mol), and quercetin (-6.5 kcal/mol) against 6LU7 Mpro protein. All the compounds were examined for their ADMET characteristics using SwissDock. Present research reports that the phytoconstituents along with docking score will be helpful for future drug development against Covid-19.

W związku z pandemią prowadzone są badania mające na celu znalezienie fitosubstancji, które mogą hamować lub zatrzymywać rozwój SARS-CoV-2. Działanie głównych białek proteazy (Mpro) SARS-CoV-2 i glikoproteiny kolca (S) jest osłabiane przez związki bioaktywne występujące w roślinach poprzez proces dokowania. Do badań dokujących użyto białka Mpro 6LU7 (kompleks z inhibitorem N3) i 5C3N (grupa przestrzenna C2221). Jako silnik dokujący zastosowano PyRx i AutoDock Vina. Zidentyfikowano 22 fitoskładniki wybrane z bazy danych IMPPAT, z uwzględnieniem ich działania przeciwwirusowego. Najbardziej skuteczne w przypadku białka Mpro 5C3N okazały się fitoskładniki β-amyryna (-8,4 kcal/mol), witaferyna A (-8,3 kcal/mol), kwas oleanolowy (-7,8 kcal/mol) i patentifloryna A (-8,1 kcal/mol), a w przypadku białka Mpro 6LU7 kuwanon L (-7,1 kcal/mol), β-amyryna (-6,9 kcal/mol), kwas oleanolowy (-6,8 kcal/mol), kukurbitacyna D (-6,5 kcal/mol) i kwercetyna (-6,5 kcal/mol). Wszystkie substancje zbadano pod kątem ich właściwości ADMET przy użyciu SwissDock. Wykazano, że fitoskładniki mogą być pomocne w pracach nad lekami przeciwko Covid-19.

Generating and modeling of braking curve and the assessment of the quality of automatic stopping of the train

100%

Anuszczyk J. , Gocek A. , Pacholski K. , Dominikowski B.

2018

tom T. 13, z. 2

13--25

This paper presents the theory about generating the braking curve and the analysis of the influence of the braking controller parameters on the generation of the braking curve of the train. In this paper, computed examples of braking quality developed using generic quality factor are shown, and on the basis of the calculations, weight components of the factor and an additional criterion for assessing the quality of braking were proposed. It has been demonstrated that the developed algorithms can be used to verify the effectiveness of the braking controller and the adjustment of the terms, and the change of these algorithms affects the shape of the generated braking curve of the train. It has been shown that the analysis of a failure of the propulsion car revealed the existence of a safe braking area. The performed statistical analysis confirmed the normal distribution of the scatter of braking results, for which the regression model fitted.