The paper presents the current state of the art in the area of data preparation. It proposes a complete methodology for industrial data preparation, as well as a nomenclature connected with the proposed methodology. The reasons behind the need to develop a new methodology are explained. The relevant notions, such as process, stage, task, operation, technique or method, are defined. The paper contains a diagrammatic representation of the proposed methodology.
PL
W artykule przedstawiono dotychczasowy stan zagadnienia przygotowania danych. Zaproponowano kompletną metodykę przygotowania danych przemysłowych i związaną z nią terminologię. W pracy wyjaśniono powody, dla których opracowano nową metodykę. Zdefiniowano stosowane pojęcia, takie jak: proces, etap, zadanie, czynność, technika lub metoda. W pracy umieszczono graficzną prezentację zaproponowanej metodyki.
Do najważniejszych zadań biologii systemowej należy badanie sieci biologicznych, celem ich lepszego poznania i praktycznego wykorzystania. W artykule przedstawiono zintegrowane środowisko BiNArr do wstępnego przetwarzania oraz wizualizacji danych, pochodzących z wybranych baz sieci biologicznych. Zaproponowano jednolitą grafową reprezentację struktur pozyskanych z oryginalnych zasobów oraz przygotowano moduły do ich wizualizacji i edycji. Przewidziano także możliwość eksportu grafów w formatach wymaganych przez aplikacje drążenia grafów. Do prezentacji wybranych funkcji systemu posłużyły – udostępnione w bazach KEGG – mapy szlaków metabolicznych oraz sieci oddziaływań białko-białko, pozyskane z za-sobów DIP.
EN
The investigation of biological networks for their better understanding and making available for practical use is currently the important task in systems biology. The paper presents an integrated environment BiNArr aimed to perform some data preparation operations as well as visualization of the network data stored in biological databases. We proposed the unified graph representation for the structures extracted from original resources and developed the modules for their visualization and edition. Another important feature is the automatic coding of the resulting graphs in several formats required by different graph mining applications. In order to present some capabilities of the application, the structures from example databases representing metabolic pathways (KEGG) as well as protein-protein interactions (DIP) were used.
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.