Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

Genetic diversity of Pyricularia grisea, the causal agent of rice blast by SRR

100%

Motlagh M. R. S. , Hbibi F. , Ebadi A. A.

Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus

|

2015

|

tom 14

|

nr 1

EN

Pyricularia grisea, the rice blast fungus is the main pathological threats to rice crop in Iran and worldwide. In this research was evaluated the genetic diversity of P. grisea collected from different fields of Guilan province by using of 14 microsatellite primers. These primers produced 64 polymorphic bands by an average of 4.57 bands for each marker. An average of polymorphic information content in whole primers was 0.734, an average of effective number of alleles was 2.68, an average of Nei’s expected heterozygosity was 0.734 and an average of Shannon’s information index was 1.05. Primer SSR43,44 had the most polymorphic information content (PIC = 0.85), observed number of alleles (na = 8), effective number of alleles (ne = 3.76), Nei’s expected heterozygosity (Ne = 0.861) and Shannon’s information index (I = 1.38). This marker was the best primer between 14 used primers for evaluation the genetic diversity of P. grisea. Cluster analysis was done with simple matching similarity matrix and UPGMA method. The results showed that the studied isolates were classified into 3 lineages by cutting off the dendrogram at 0.76 similar linkage level. Number 1 was the major group and represented most of those isolates. Results of principal coordinate analysis also divided the isolates into three groups exactly similar to obtained with cluster analysis. Overall, our results confirmed that microsatellite primers were good and suitable markers for analyzing structure of P. grisea

PL

Pyricularia grisea, grzyb zarazy ryżowej, jest zagrożeniem dla plonów ryżu w Iranie i na całym świecie. W niniejszym badaniu przy użyciu 14 markerów mikrosateklitarnych oceniano różnorodność genetyczną P. grisea zebranego z różnych pól prowincji Guilan. Markery te tworzyły 64 polimorficznych wiązać przy średnio 4,57 wiązaniach dla każdego markera. ĝrednia informacji polimorficznych we wszystkich markerach wynosiła 0,734, średnia efektywna liczba alleli – 2,68, średnia heterozygotyczność oczekiwana Nei – 0,734 a średni indeks informacji Shannon – 1,05. Marker SSR43,44 miał największą zawartość informacji polimorficznej (PIC = 0.85), największą liczbę alleli obserwowanych (na = 8), liczbę efektywnych alleli (ne = 3.76), największą heterozygotyczność oczekiwaną Nei (Ne = 0,861) i indeks informacji Shannon (I = 1.38). Był to najlepszy spośród 14 markerów użytych do oceny różnorodności genetycznej P. grisea. Analizę skupieć przeprowadzono za pomocą prostego współczynnika simple maching oraz metody UPGMA. Na podstawie wyników badać izolaty zaklasyfikowano do 3 linii przez odcięcie dendogramu na podobnym poziomie powiązać 0,76. Numer 1 był główną grupą i reprezentował większość tych izolatów. Wyniki analizy głównych współrzędnych także dzieliły izolaty na trzy grupy podobne do tych, które otrzymano za pomocą analizy skupieć. Podsumowując, wyniki badać potwierdziły, że markert mikrosatelitarne to dobre i odpowiednie markery do analizy struktury P. grisea.

2

Effects of rice blast fungus (Pyricularia grisea) on phenolics, flavonoids, antioxidant capacity in rice (Oryza sativa L.)

67%

Toan N. P. , Ha P. T. T. , Xuan T. D.

International Letters of Natural Sciences

|

2017

|

tom 61

EN

Rice blast fungus (Pyricularia grisea) is one of the most problematic pathogen to significantly reduce rice production worldwide. In this study, after being inoculated with P. grisea, changes in phenolic components and antioxidant capacity and correlation with the resistant level against rice blast fungus were investigated. Among screened rice cultivars, AV-3 was the strongest resistant, whereas BII-3 was the most susceptible. It was found that although total contents of phenolics and flavonoids, and antioxidant capacities varied among studied varieties, no significant coefficient with the resistance against P. grisea was observed. After rice was affected by rice blast fungus, total phenolics and flavonoids were markedly reduced, but in contrast, the DPPH scavenging activities of only the susceptible rice cultivars was reduced. Among the 11 phenolic acids detected, catechol was found only in the tolerant cultivar AV-3, whereas the amount of cinnamic acid was increased after infection. Quantity of vanillin was also promoted, except in the susceptible cultivar BII-3 that was significantly reduced. Findings of this study showed that the resistant level against P. grisea was proportionally correlated to the antioxidant capacity. Catechol, cinnamic acid, and vanillin may play a role but it needs further elaboration. Observations of this study suggested that the infection of blast disease by reducing amount of phenolics and flavonoids that may weaken the resistance of rice against this detrimental fungus.

3

Effect of weather factors on spore population dynamics of rice blast fungus in Guilan province

67%

Mousanejad S. , Alizadeh A. , Safaie N.

Journal of Plant Protection Research

|

2009

|

tom 49

|

nr 3

319-329

EN

Effect of weather factors on fluctuations of spore population of Pyricularia grisea and the occurrence of the disease was considered. During growing seasons of 2006-2007, paddy fields were chosen in distance of five kilometers from weather stations of Rasht, Lahijan and Anzali in Guilan province and spore population (Ps) were measured daily using sporetraps. Weather data including precipitation (P), daily maximum and minimum temperature (Tmax, Tmin), daily maximum and minimum relative humidity (RHmax, RHmin) and sunny hours (SH) were obtained from weather stations. The relationship between spore population fluctuations and weather data was analyzed and the most important weather factors affecting spore population and predicting blast were determined. Accordingly, weather factors such as P, Tmax, RHmin and SH are the most important factors predicting rice blast in Guilan and enough precipitation, increased daily RHmin, decreased daily Tmax and SH result in increased spore population and blast occurrence during next 7-10 days. To predict final leaf blast severity (Yflbs) and neck blast index (Ynbi), factors such as Tmax, Tmin, T, RHmax, RHmin, RH, P and SH and Ps were used for modeling. For leaf blast, these factors were considered for June and July and for neck blast, the same factors used for August. Step wise regression was applied for modeling. Statistics like r, R2, aR2, SE, F and Durbin-Watson were applied for evaluating the models. Finally, the two quantitative models: Yflbs = -2.41-2.80 Tmin+0.68RHmin-0.015Ps-0.014P+0.052SH (R2 = 96.73%) and Ynbi = -24.11+0.08Tmax+0.19 RHmax+0.034Ps-0.015P+0.016SH (R2 = 73.97%), were introduced for predicting final leaf blast severity and neck blast index, respectively. Related to effects of amount of applied N fertilizer (F) and date (D) and space (S) of transplanting, the results showed high correlation between F and Yflbs and Ynbi, but such high correlation was not observed for D and S. The best function for predicting Yflbs was Y = 4.46-4.12F+1.93F2 (R2 = 96.37). The best equation for predicting Ynbi acquired when F, D and S were applied in multiple regression, Y = 2.06+0.33F+0.10D-0.03S(R2 = 54.40).

PL

Omówiono wpływ czynników pogodowych na wahania w populacji zarodników Pyricularia grisea i występowanie choroby. W okresach wegetacji lat 2006-2007 wytypowano podmokłe pola w odległości pięciu kilometrów od stacji meteorologicznych w Rasht, Lahijan i Anzali w prowincji Guilan; populację zarodników określano wykorzystując pułapki zarodników. Dane pogodowe obejmujące opady, temperatury dobowe, minimalne i maksymalne, dobową wilgotność względną i godziny nasłonecznienia otrzymano ze stacji meteorologicznych. Analizowano związek pomiędzy wahaniami populacji zarodników i danymi pogodowymi mogącymi wpływać na populację zarodników, a prognozowaniem wystąpienia zgorzeli ryżu. Opady, maksymalne temperatury, minimalna wilgotność względna i godziny nasłonecznienia są najważniejsze dla prognozowania choroby w Guilan, a wystarczająca ilość opadów zwiększała dobową wilgotność względną, zmniejszała dobową maksymalną temperaturę i ilość godzin nasłonecznienia, powodując zwiększanie populacji zarodników i wystąpienie zgorzeli ryżu w okresie następnych 7-10 dni. W celu uzyskania danych o nasileniu zgorzeli ryżu i wskaźnika zgorzeli szyjki, dane te były wykorzystane do modelowania przebiegu choroby. Dla zgorzeli liści wzięto pod uwagę informacje z czerwca i lipca, a dla zgorzeli szyjki dane z września. Do modelowania wykorzystano metodę stopniowej regresji. Do oceny modeli wykorzystano statystykę taką jak r, R2, aR2, SE, F i Durbin-Watson. W końcu opracowano dwa ilościowe modele: Yflbs = -2,41-2,80 Tmin +0,68RHmin-0,015Ps-0,14P+0,052SH (R2 = 96,73%) i Ynbi = -24,11+0,08Tmax+0,034Ps-0,015P+0,016SH (R2=73,97%), co zostało wprowadzone odpowiednio do przewidywania końcowego indeksu nasilenia zgorzeli liści i szyjki. W stosunku do efektu zastosowanego nawożenia azotowego (F), terminu (D) i rozstawy (S) przy przesadzaniu, wyniki wykazały wysoką korelację pomiędzy F i Yflbs i Ynbi, ale takiej wysokiej korelacji nie obserwowano dla D i S. Najlepszą funkcją do przewidywania Ynbi była: Y = 4,46-4,12+1,93F2 (R2 = 96,37). Gdy F, D i S były stosowane w wielokrotnej regresji najlepszym równaniem do przewidywania Ynbi, było Y = 2,06+0,33F+0,10D-0,035 (R2 = 54,40).