Nowa wersja platformy, zawierająca wyłącznie zasoby pełnotekstowe, jest już dostępna.
Przejdź na https://bibliotekanauki.pl
Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 9

Liczba wyników na stronie
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
Wyniki wyszukiwania
Wyszukiwano:
w słowach kluczowych:  DNA jadrowy
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
EN
The aim of the study was to assess the biodiversity of farmed fur animals from the Canidae family (common fox, polar fox, and raccoon dog) using nuclear and mitochondrial markers. The study involved 434 animals. The biological material included whole peripheral blood or skin tissue. The isolated genetic material was subjected to qualitative and quantitative analyses. Mitochondrial DNA (mtDNA) gene fragments (COX1, COX2, CYTB) and nuclear DNA (nDNA) gene fragments (MSTN1, MSTN2, MSTN3, IGF1, GHR) were amplified with the PCR (polymerase chain reaction) technique. The amplicons obtained were sequenced or subjected to PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism) reaction, and bioinformatics analyses were performed. The interspecific analysis of the nDNA sequences revealed a total of 25 polymorphisms. On the other hand, the interspecific analysis of the mtDNA gene fragments identified 277 polymorphisms. The COX1 gene fragment exhibited the greatest variability. It was shown that the frequency of polymorphisms within the mitochondrial genome was almost 20-fold higher than that in the nuclear genome of the raccoon dog. It was found that the genetic distances revealed by the analysis of the mitochondrial gene fragments were similar to the results obtained by the nDNA analysis. The genetic distance between the raccoon and common fox was the greatest. The smallest phylogenetic distance was revealed between the two fox species. The study results indicate mitochondrial and nuclear genes may be alternatively used for determining the phylogenetic relationships between fur animals from the Canidae family.
PL
Przedmiotem badań było potomstwo czterech proweniencji jodły pospolitej (Abies alba MILL.) z północno-wschodniej granicy zasięgu, rosnące na powierzchni doświadczalnej w Nadleśnictwie Nawojowa. Celem badań było poznanie międzyproweniencyjnej zmienności genetycznej jodły pospolitej. Do badań wytypowano potomstwo 111 drzew matczynych (rodów) jodły z: Nadleśnictwa Białowieża, Rezerwatu Jata, Rezerwatu Kamienna Góra oraz Rezerwatu Łabowiec. Przeanalizowano zmienność 2 loci mikrosatelitarnego jądrowego DNA. Obliczono: liczbę alleli w locus (Na), liczbę efektywnych alleli (Ne), obserwowaną i oczekiwaną heterozygotyczność (Ho, He), indeks wsobności Wrightʼa (F), parametry równowagi genotypowej (FIS, FIT), współczynnik zróżnicowania międzypopulacyjnego FST, przepływ genów (Nm), oraz odległości genetyczne. Dodatkowo wykonano molekularną analizę wariancji (AMOVA), która wykazała, że populacje różnią się między sobą istotnie statystycznie. Wykryto, że 5% ogólnego wykrytego zróżnicowania występuje pomiędzy populacjami, a 95% wewnątrz populacji. Badania wykazały, że poziom zmienności genetycznej jodły jest niski w porównaniu z innymi drzewami iglastymi, pomimo że wszystkie analizowane loci były polimorficzne. Żadna populacja nie posiadała alleli unikatowych. Przepływ genów (Nm) pomiędzy populacjami był duży, a współczynnik zróżnicowania międzypopulacyjnego był niski. Najwyższą heterozygotyczność obserwowaną wykazywały populacje z Łabowca i z Kamiennej Góry, a najmniejszą populacja z Białowieży. Najwyższą heterozygotyczność oczekiwaną wykazywała populacja z Białowieży, a najmniejszą populacja z Kamiennej Góry. Wszystkie badane populacje wykazały niedobór heterozygot, a największy niedobór heterozygot zaobserwowano w potomstwie populacji z Białowieży, a najmniejszy z Kamiennej Góry. Największą odległość genetyczną zaobserwowano pomiędzy potomstwem populacji z Jaty i Białowieży, a najmniejszą pomiędzy potomstwem populacji z Łabowca i z Kamiennej Góry. Niniejsze badania wykazały, że Białowieska proweniencja różni się zdecydowanie od trzech pozostałych. Proweniencja ta, jest populacją sztuczną, założoną na początku XX wieku i powstałą z nasion niewiadomego pochodzenia. Odrębność proweniencji z Białowieży może wynikać z jej lokalizacji. Rośnie ona ok. 100 km poza granicą naturalnego zasięgu gatunku, co może ograniczać przepływ genów z innymi proweniencjami.
EN
The main purpose of the analyses was to describe and estimate the level of nSSRs differentiation between the progeny of four provenances of silver fir (Abies alba MILL.) from the north-eastern range limits. The progeny grew in the experimental area which was located in the Nawojowa District. The progeny of 111 maternal trees from Białowieża District, Jata Reserve, Kamienna Góra Reserve (Roztocze National Park) and Łabowiec Reserve were studied. Two polymorphic nuclear microsatellite loci were analysed. Genetic parameters such as the number of alleles per locus (Na), the number of effective alleles (Ne), observed and expected heterozygosity (Ho, He), Wrightʼs fixation index (F), genetic similarity coefficient (IN), genetic differentiation coefficient (FST), gene flow (Nm) and Nei’s genetic distances were calculated. The analysis of molecular variance (AMOVA) showed a significant difference in the level of gene diversity between progeny. AMOVA showed that 5% of the total nSSR variations were attributable to the differences between populations and 95% to differences within populations. The genetic differentiation level among populations was low, but all the analyzed loci were polymorphic. No unique alleles were detected. Gene flow (Nm) between populations was high and genetic differentiation coefficient (FST), was low. The highest observed heterozygosity (Ho) was detected in populations from Łabowiec and Kamienna Góra, while the lowest from Białowieża. The highest expected heterozygosity (He) was recorded in Białowieża population, whereas the lowest in Kamienna Góra. Analysis of F values revealed deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium in all populations, with the excess of homozygotes, being the highest in the population from Białowieża. The highest genetic distance was between the progeny from Jata and Białowieża and the lowest between Łabowiec and Kamienna Góra. Results indicate that the population from Białowieża differs from other analyzed populations. It is probably the result of the non-natural derivation of this population, from seeds of unknown origin. Another reason for such difference could be the localization of Białowieża population, over 100 km from the limit of natural range, which may have reduced the gene flow between populations.
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.