Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

Separation of large DNA molecules on agarose gel. I. Classical (stable field) electrophoresis

100%

Wojcierowski J. , Wojcierowski P.

Applied Biology Communications. Lublin Scientific Center

|

1991

|

tom 01

|

nr 6

2

Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. IV. The product of the applied technologies

100%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1997

|

tom 37

|

nr 1-2

EN

The Polymerase Chain Reaction and other molecular technologies were applied to isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene. This research object was realized and the importance of this result has been discussed in view of the mechanisms of the regulation of gene expression.

PL

Reakcja Łańcuchowa Polimerazy i inne technologie molekularne zostały zastosowane w celu izolacji fragmentu DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C. Cel badawczy został zrealizowany i omówiono znaczenie tego wyniku w świetle mechanizmów regulacji ekspresji genu.

3

Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. II. The technology for the preparation of the template

88%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1997

|

tom 37

|

nr 1-2

EN

The technology for the preparation of the template in the research aimed to isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene is presented i.e. the linearisation of the template by Bam H I digestion, the purification of the template and the estimation of the template concentration.

PL

Przedstawiono technologię przygotowywania matrycy DNA w badaniach zmierzających do izolacji Otwartej Ramy Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans. Technologia ta obejmowała linearyzację DNA matrycy poprzez trawienie Bam H I oraz oczyszczenie matrycy i oznaczenie stężenia matrycowego DNA.

4

Genomic DNA library of Veillonella parvula H2 in the rumen

75%

Liu G. W. , Zhang Z. G. , Yang W. Y. , Yang L. Y. , Wang Z.

|

2010

|

tom 54

|

nr 1

15-17

EN

To construct a genomic library of Veillonella parvula H2, total DNA was extracted, sheared by a Hydroshear machine, and the DNA fragments ligated a into Smal-digested vector pUC18 before being transformed into E. coli DH5a. Colonies were selected on Luria-Bertani (LB) plates containing ampicillin, 5-bromo-4-chloro-3-indoyl-3-galactose (X-gal), and isopropy-β-D-thiogalactoside (IPTG) and proliferated. Recombinant plasmids were analysed for the presence of inserted DNA fragments of 3-4 kb by restriction mapping. The titre of the library was determined to be 10⁵ pfu/mL according to the formula N=ln(l-p)/(l-f). The genomic library consisted of 99% of the genome of Veillonella parvula, demonstrating a successful library construction.

5

5S rRNA pseudogenes in a genome of callus culture of Lupinus angustifolius

75%

Karpinski S. , Kedzierski W. , Nuc P. , Balcerkiewicz L. , Pawelkiewicz J.

Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Biological Sciences

|

1991

|

tom 39

|

nr 3

6

Cross species amplification of coat colour genes in nutrias (Myocastor coypus Mol)

75%

Migdal L. , Zabek T. , Migdal A. , Lapinski S. , Bieniek J. , Bugno-Poniewierska M.

Folia Biologica

|

2016

|

tom 64

|

nr 2

7

Cloning and expression of the two DNA fragments of the I-18 C region of Chironomus tentans. II. The effects of the applied technology

75%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1998

|

tom 38

|

nr 1

EN

The chromosomal I-18 C region of Chironomus tentans contains the I-18 C gene. Two different open reading frames (i.e. the ORF I and II) of two different transcripts (i.e. the 1.8 kb and 4.6 kb RNA) of the I-18 C gene of Chironomus tentans were isolated, at the DNA level, by the Polymerase Chain Reaction, then were cloned into the bluescript vector and finally were cloned into the pET-3a vector in order to translate them in T7 RNA polymerase / promoter system of E. coli. It was possible to obtain the ORF I overexpressed. In a case of the ORF II the low molecular weight polypeptide was detected, however it was not overexpressed, but still this polypeptide was strongly visible on the SDS-polyacrylamide gel.

PL

Region chromosomalny I-18 C Chironomus tentans zawiera gen I-18 C. Dwie odrębne otwarte ramy odczytu (tj. ORF I i II) genu I-18 C Chironomus tentans zostały wyizolowane, na poziomie DNA, przy użyciu Reakcji Łańcuchowej Polimerazy (PCR), a następnie zostały wklonowane do wektora blueskrypt i ostatecznie zostały wklonowane do wektora pET-3a w celu ich translacji w systemie promotora T7 RNA polimerazy w E. coli. Uzyskano bardzo dużą ekspresję ORF I. W przypadku ORF II wykryto obecność polipeptydu o niskiej masie cząsteczkowej i chociaż nie uzyskano jego bardzo dużej ekspresji, tym niemniej polipeptyd ten był silnie widoczny w żelu poliakryloamidowym z SDS.

8

Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. V. Different mechanisms of regulation regarding the open reading frames

75%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1997

|

tom 37

|

nr 1-2

EN

Different mechanisms of regulation regarding the Open Reading Frames (ORFs) have been discussed to have a broader perspective that is necessary to evaluate the role of the ORFs of the I-18 C gene. This consideration includes the ORF II of the I-18 C gene which is the object of the presented research.

PL

Omówiono różnorodne mechanizmy regulacji dotyczące Otwartych Ram Odczytu, w celu wytworzenia szerszego spojrzenia na to zagadnienie, które jest potrzebne do oceny roli poszczególnych Otwartych Ram Odczytu (ORF) genu I-18 C. Omówienie to dotyczy również ORF II genu I-18 C, co było przedmiotem zaprezentowanych badań.

9

The effect of DNA labeling with the fluorescent dyes R110 and R6G on genotype analysis using capillary electrophoresis

75%

Khan H. A.

Cellular and Molecular Biology Letters

|

2005

|

tom 10

|

nr 2

10

Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. II. Preparation of the intermediate vector - bluescript plasmid for ligation with the inserts

75%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1999

|

tom 39

|

nr 1

EN

The technology used for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments of the I-18 C gene in regard to the preparation of the intermediate vector i.e. the bluescript for the ligation with the ORF I and II reflecting DNA fragments, is presented. The main steps include the Eco RV digestion of the bluescript plasmid, the phenol / methylene chloride extraction of the plasmid, dephosphorylation of the bluescript plasmid and finally its extraction with the phenol and ethanol precipitation.

PL

Przedstawiono technologię, którą zastosowano do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających translacyjną otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans w zakresie: przygotowania wektora pośredniego - plazmidu blueskrypt do ligacji z wymienionymi sekwencjami wstawek. Główne etapy obejmują: trawienie plazmidu blueskrypt enzymem Eco RV, ekstrakcję plazmidu fenolem/ chlorkiem metylenu, defosforylację plazmidu blueskrypt, ostatecznie jego oczyszczenie poprzez ekstrakcję fenolową i precypitację etanolem.

11

Noninvasive fluorescent screening of microinjected bovine embryos to predict transgene integration

75%

Rosochacki S. J. , Kozikova L. V. , Korwin-Kossakowski M. , Matejczyk M. , Poloszynowicz J. , Duszewska A. M.

Folia Biologica

|

2003

|

tom 51

|

nr 1-2

12

Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. III. The DNA amplification technology

75%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1997

|

tom 37

|

nr 1-2

EN

The technology used to amplify and isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans is described i.e. the Polymerase Chain Reactioin and the agarose gel electrophoresis of this reaction product, as well as the blunting reaction of the product and its isolation.

PL

Opisano technologię zastosowaną do powielenia i izolacji fragmentu DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans, tj. Reakcję Łańcuchową Polimerazy (PCR) oraz elektroforezę w żelu agarozowym produktu tej reakcji jak również reakcję tzw. Stępiania końców wyżej wymienionego produktu i ostatecznie jego izolację .

13

Microdissected bovine X chromosome segment delineates homologous chromosomal regions in sheep and goat

63%

Bugno M. , Zyga A. , Slota E.

Folia Biologica

|

2008

|

tom 56

|

nr 3-4

149-151

14

Polymorphism of the genus Isophya [Orthoptera, Phaneropteridae, Barbitistinae] revealed by RAPD

63%

Grzywacz B. , Warchalowska-Sliwa E.

Folia Biologica

|

2008

|

tom 56

|

nr 3-4

153-157

15

Manipulation of vanillin synthesis genes in flax

63%

Pastor M. , Boba A. , Zuk M. , Szopa-Skorkowski J.

BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology

|

2015

|

tom 96

|

nr 1

16

Genetic variability in the Antarctic hairgrass Deschampsia antarctica Desv. from maritime Antarctic and Subantarctic sites

63%

Chwedorzewska K. J. , Bednarek P. T.

Polish Journal of Ecology

|

2008

|

tom 56

|

nr 2

209-216

EN

The level of polymorphism, genetic variability and relatedness of the Antarctic hairgrass Deschampsia antarctica Desv. Populations from South Shetlands Is. (King George I., Penguin I., Livingstone I.), from vicinity of Antarctic Peninsula (Galindez I., Uruguay I.), and Falklands Is. (Jason Is., Sealion I.) were studied using the AFLP approach. Six EcoRI/MseI type selective primer pairs combinations were used for AFLP profiling and amplified scoreable DNA fragments; than AMOVA and PCA were performed. The level of molecular variability among all individuals from all the analysed populations was low and reach only 5.4 % irrespective of the distance between the localities and it was not significant at a broader geographical scale, even among the three groups of populations (South Shetlands Is., vicinity of Antarctic Peninsula, and Falklands Is.). PCA analysis shows that all populations formed uniform groups according to their locations.

17

Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. V. Identification of the bacterial colonies, containing the recombinant bluescript plasmids

63%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1999

|

tom 39

|

nr 1

EN

The technology applied for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments in regard to the identification of the bacterial colonies, of E. coli XL-1 strain, containing the recombinant bluescript plasmids, is described. The particular steps include: the α-complementation test, growing of the preliminary selected bacterial colonies in culture, isolation of the plasmids from these colonies, the Nde I and Bam HI digestion of the plamids mini-preparations, analysis of the digestion products and the identification of the bacterial colonies, containing the bluescript plasmids with the cloned inserts by the agarose gel electrophoresis (2% gel, 1 x TBE buffer).

PL

Opisano technologię zastosowaną do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans, w zakresie: identyfikacji kolonii bakteryjnych szczepu XL-1, zawierających zrekombinowane plazmidy blueskrypt. Poszczególne etapy obejmowały: test α-komplementacji, hodowlę wstępnie wybranych kolonii bakteryjnych, izolację plazmidów bakteryjnych poszczególnych kolonii z tych hodowli, trawienie mini-izolatów plazmidów Nde I i Bam HI, analizę produktów trawienia i identyfikację kolonii bakteryjnych, zawierających plazmidy blueskrypt z wklonowanymi wstawkami przy zastosowaniu elektroforezy w żelu agarozowym (2% żel, 1 x stężony bufor TBE).

18

Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. I. The technology for the preparation of the primers

63%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1997

|

tom 37

|

nr 1-2

EN

The above mentioned technology in a case of the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene is described i.e. the primers design, purification and phosphorylation of the oligonucleotide primers.

PL

Dla określonego w tytule pracy, celu badań przedstawiono technologię przygotowywania starterów, w przypadku DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans. Technologia ta obejmowała zaprojektowanie starterów dla PCR oraz oczyszczenie i fosforylację zsyntetyzowanych oligonukleotydowych starterów.

19

Evaluation of three methods for DNA fingerprinting of Corynebacterium pseudotuberculosis strains isolated from goats in Poland

63%

Stefanska I. , Rzewuska M. , Binek M.

Polish Journal of Microbiology

|

2008

|

tom 57

|

nr 2

EN

Phenotypic approaches based on metabolic and biological characteristics of Corynebacterium pseudotuberculosis have been limited due to insufficient discrimination between closely related isolates. In this paper we present performance and convenience of three molecular typing methods: BOX-PCR, random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and amplification of DNA fragments surrounding rare restriction site (ADSRRS-fingerprinting) in genome analysis of these bacteria. Among examined 61 strains there were distinguished four, eight and 10 different genotypes by BOX-PCR, RAPD and ADSRRS-fingerprinting, respectively. The value of discrimination index was the lowest for BOX-PCR (D = 0.265), much bigger for RAPD (D = 0.539) and the highest for ADSRRS-fingerprinting (D = 0.604). The good discriminatory ability and reproducibility of RAPD and ADSRRS-fingerprinting indicates that those techniques may be particularly applied for epidemiological studies of C. pseudotuberculosis isolates. We found that ADSRRS-fingerprinting is a rapid method offering good discrimination power, excellent reproducibility and may be applied for epidemiological studies of intraspecific genetic relatedness of C. pseudotuberculosis strains.

20

Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. IV. The ligation of the bluescript vector with the inserts

63%

Borowicz B. P.

Journal of Plant Protection Research

|

1999

|

tom 39

|

nr 1

EN

The technology used for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments of the I-18 C gene in regard to the ligation reactions of the bluescript vector with the inserts, is presented. The main steps include: the calculation of the molar ratio of the bluescript plasmid to the ORF I and II reflecting DNA fragments as the inserts, the ligation reaction, the transformation of the E. coli cells of the XL- 1 strain with the ligation reactions products and growing of the transformed bacterial cells.

PL

Przedstawiono technologię użytą do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans w zakresie: reakcji ligacji wektora blueskrypt ze wstawkami sekwencji klonowanych wymienionych wyżej. Przedstawione główne etapy obejmują: obliczenie stosunku molarnego plazmidu blueskrypt do fragmentu DNA odzwierciedlającego otwartą ramę odczytu I i II. Fragmenty te zostały użyte jako wstawki. Przedstawiono także zastosowaną technologię dotyczącą reakcji ligacji, transformacji komórek bakteryjnych E. coli szczepu XL-1 produktami reakcji ligacji oraz hodowlę na płytkach agarowych stransformowanych komórek bakterii.