Wyniki wyszukiwania - Biblioteka Nauki

1

Zastosowanie metod biologii molekularnej w diagnostyce bakterii z rodzaju Alicyclobacillus

100%

Dekowska A.

|

nr 2

PL

Klasyczne, oparte na posiewach i testach biochemicznych, metody wykrywania i różnicowania bakterii z rodzaju Alicyclobacillus zajmują kilka do kilkunastu dni. Metody molekularne, oparte na hybrydyzacji lub amplifikacji kwasów nukleinowych umożliwiają szybszą i niejednokrotnie bardziej precyzyjną charakterystykę badanych bakterii. Spośród opisywanych metod, najpopularniej stosowaną w diagnostyce rodzaju Alicyclobacillus jest analiza sekwencji genu 16S rDNA. Do metod molekularnych stosowanych w procesie wyodrębniania nowych gatunków w obrębie rodzaju Alicyclobacillus zaliczają się również analiza stosunku par G-C do par A-T, hybrydyzacja genomów oraz analiza sekwencji genu gyrB. Najbardziej uniwersalne metody różnicowania genetycznego, jak np. RAPD-PCR, nie wymagają znajomości sekwencji badanego DNA. Metoda LAMP-PCR ze względu na niskie koszty i specyficzność stanowi atrakcyjną alternatywę w odniesieniu do metod opartych na klasycznej reakcji PCR.

EN

Conventional methods of detecting and differentiation of Alicyclobacillus are based on plating and biochemical tests, and require several days do accomplish. Molecular methods are based on hybridization and amplification of DNA, and enable faster and more specific characterisation of tested bacteria. The most popular among all described methods, is the 16S rDNA sequence analysis. Molecular methods used in the process of describing new species belonging to Alicyclobacillus genus are also G-C content, genome hybridization, and gyrB gene sequence analysis. The most universal differentiation methods do not require any knowledge of the sequence of tested DNA. The LAMP-PCR method, due to it’s low cost and precision, is an attractive alternative to the classic PCR methods.

2

Analysis of a 35-kb plasmid isolated from enteropathogenic strain of Escherichia coli using randomly inserted cassettes carrying antibiotic resistance genes

63%

Dekowska A. , Kaczorowski T.

|

tom 53

|

nr Supplement 1

3

Direct sequencing of plasmids isolated from hospital environment using cassettes carying antibiotic resistance genes inserted randomly

51%

Dekowska A. , Chec E. , Kaczorowski T.

|

nr Supplement 1

4

Wpływ lizozymu i nizyny na przeżywalność przetrwalników Alicyclobacillus acidoterrestris poddanych działaniu wysokiego ciśnienia hydrostatycznego i temperatury

45%

Sokolowska B. , Skapska S. , Niezgoda J. , Dekowska A. , Fonberg-Broczek M.

|

tom 70

|

nr 1

PL

Acidotermofilne bakterie przetrwalnikujące (Alicyclobacillus acidoterrestris) są przyczyną psucia soków owocowych i warzywnych. Przetrwalniki A. acidoterrestris wykazują wysoką oporność na działanie czynników fizycznych i chemicznych. Celem pracy była ocena wpływu lizozymu i nizyny na przeżywalność przetrwalników A. acidoterrestris poddanych działaniu wysokiego ciśnienia hydrostatycznego i temperatury. Scharakteryzowano wpływ ciśnienia 200 MPa i 300 MPa w temperaturze 50°C na przeżywalność przetrwalników dwóch szczepów A. acidoterrestris w soku jabłkowym oraz w soku jabłkowym z dodatkiem lizozymu lub nizyny. Dodatek lizozymu w stężeniu 0,05 i 0,1 mg/ml przy ciśnieniu 300 MPa nie wpływał na przeżywalność przetrwalników obu szczepów. Jednakże dodatek tej substancji w stężeniu 0,05 mg/ml soku ciśnieniowanego w 200 MPa spowodował dodatkową inaktywację przetrwalników o ok. 1 log po 10 min procesu. Dodatek nizyny w stężeniach 500, 750 i 1000 IU/ml spowodował zwiększoną redukcję przetrwalników szczepu TO-29/4/02 o ok. 1 log podczas całego procesu prowadzonego w ciśnieniu 300 MPa przez 30 min, natomiast w przypadku szczepu TO-117/02 dodatkową redukcję stwierdzono tylko w początkowym etapie ciśnieniowania. W procesie ciśnieniowania prowadzonym w 200 MPa w soku jabłkowym z dodatkiem 250 IU nizyny/ml obserwowano wyraźny wpływ bakteriocyny na stopień inaktywacji przetrwalników A. acidoterrestris. Już po 10 min ciśnieniowania dodatkowa redukcja wynosiła około 1,3 log, a po 45 min dodatkowe zwiększenie redukcji wynosiło 1,9–2,3 log w zależności od szczepu.

EN

Alicyclobacillus acidoterrestris, thermoacidophilic and spore-forming bacteria, can cause spoilage of fruit and vegetable juices. A. acidoterrestris spores show high resistance to physical and chemical treatments. The aim of the study was to evaluate the effect of lysozyme or nisin on survival of A. acidoterrestris spores treated with high hydrostatic pressure and temperature. The effects of pressure of 200 MPa and 300 MPa at 50°C on the survival of spores of two A. acidoterrestris strains in apple juice or in apple juice with lysozyme or nisin addition have been characterized. The addition of lysozyme at concentration of 0.05 and 0.1 mg/ml did not affect the survival of the spores of both strains, when 300 MPa was used. However, the addition of this compound at concentration 0.05 mg/ml of juice resulted in additional spores inactivation of approx. 1 log after 10 min pressurization at 200 MPa. The addition of nisin at concentrations of 500, 750 and 1000 IU/ml resulted in increase in the reduction of TO-29/04/02 strain spores, of approx. 1 log, during the whole process carried out at 300 MPa for 30 min, but for spores of TO-117/02 strain the additional reduction was observed only at the initial stage of pressurization. In apple juice supplemented with 250 IU of nisin/ml pressurized at 200 MPa the pronounced effect on inactivation of A. acidoterrestris spores, due to the bacteriocin addition was noted. Already after 10 min pressurization additional reduction of about 1.3 log was achieved, and after 45 min the additional reduction was 1.9–2.3 log, depending on the strain.

5

Inactivation of the native microflora in beetroot juice by high pressure carbon dioxide combined with temperature

45%

Sokolowska B. , Porebska I. , Nasilowska J. , Niezgoda J. , Dekowska A.

|

tom 30

|

nr 1

EN

Commercially available unpasteurized, freshly-squeezed beetroot juice with a 24–72 hour shelf-life in cold storage, retains its natural flavour and nutritional value but can be a source of undesirable microflora. In this paper, the suitability of high pressure carbon dioxide (at 20 and 60 MPa, and a temperature of: 20, 35 and 60°C) to inactivate the native microflora in this juice has been studied. The results show that high pressure carbon dioxide was effective in the inactivation of the studied groups of microorganisms only when combined with increased temperature. The reduction in the total count of spoilage microorganisms and lactic acid bacteria was 5–6 log when 20 or 60 MPa and 60°C for at least 30 min were used. Yeasts treated with carbon dioxide at 20 MPa and 60°C were totally (>6 log) inactivated. The reduction in moulds count above 3 log, was observed in this conditions.

PL

Dostępny w handlu niepasteryzowany, świeżo wyciskany sok z buraków ćwikłowych posiada 24–72 godzinny okres przydatności do spożycia. Zachowuje swój naturalny smak i walory odżywcze, ale może być źródłem niepożądanej mikroflory. W artykule przedstawiono ocenę przydatności ditlenku węgla pod wysokim ciśnieniem (20 i 60 MPa w temperaturze: 20, 35 i 60°C) do inaktywacji naturalnej mikroflory soku z buraków ćwikłowych. Wyniki badań wskazują, że działanie ditlenku węgla jedynie w połączeniu z podwyższoną temperaturą skutecznie eliminuje poszczególne grupy badanych drobnoustrojów. Przy zastosowaniu ditlenku węgla pod ciśnieniem 20 lub 60 MPa i temperatury 60°C przez co najmniej 30 min, osiągnięto redukcję ogólnej liczby drobnoustrojów psujących i bakterii fermentacji mlekowej o 5–6 log. Drożdże ulegały całkowitej inaktywacji (>6 log) po zastosowaniu ditlenku węgla pod ciśnieniem 20 MPa i temperatury 60°C. W tych samych warunkach redukcja liczby pleśni wynosiła powyżej 3 log.

6

Zastosowanie pasteryzacji wysokociśnieniowej do inaktywacji przetrwalników Alicyclobacillus acidoterrestris w soku jabłkowym

38%

Skapska S. , Sokolowska B. , Fonberg-Broczek M. , Niezgoda J. , Chotkiewicz M. , Dekowska A.

Żywność Nauka Technologia Jakość

|

2012

|

tom 19

|

nr 3

PL

Acidotermofilne bakterie przetrwalnikujące Alicyclobacillus acidoterrestris (AAT) są przyczyną psucia soków owocowych i warzywnych. Proces pasteryzacji nie niszczy całkowicie przetrwalników tych bakterii, aktywując je jednocześnie do kiełkowania i dalszego wzrostu. Celem pracy była ocena przydatności pasteryzacji wysokociśnieniowej do inaktywacji przetrwalników AAT w soku jabłkowym. Scharakteryzowano wpływ ciśnienia hydrostatycznego 300 i 500 MPa stosowanego w temperaturze 50 °C, na przeżywalność przetrwalników ośmiu szczepów AAT w soku jabłkowym. Redukcja liczby przetrwalników po zastosowaniu ciśnienia 300 MPa przez 10 min wynosiła 1,27 - 3,46 log jtk/ml soku, w zależności od szczepu. Przedłużenie pasteryzacji do 30 min, zastosowane do dwóch najbardziej opornych szczepów, umożliwiło redukcję przetrwalników o 2,06 i 2,64 log jtk/ml. Dalsze zwiększenie ciśnienia do 500 MPa nie spowodowało istotnego zwiększenia skuteczności procesu pasteryzacji. Efektywniejsze okazało się zastosowanie ciśnieniowania pulsacyjnego. Stosowano sześć 5-minutowych cykli ciśnienia 100 MPa, 300 MPa i 500 MPa w temperaturze 50 ºC. Największą redukcję liczby przetrwalników dwóch szczepów AAT, wynoszącą 2,40 i 3,11 log jtk/ml, uzyskano przy zastosowaniu ciśnienia 300 MPa. Ciśnieniowanie pulsacyjne (100 MPa, 50°C) połączone z godzinną inkubacją w temperaturze 50 ºC i kolejnym etapem ciśnieniowania w 500 MPa spowodowało redukcję liczby przetrwalników o ponad 4 log jkt/ml. Przetrwalniki AAT wykazywały oporność na działanie wysokiego ciśnienia hydrostatycznego przy parametrach stosowanych w niniejszej pracy.

EN

Alicyclobacillus acidoterrestris (AAT), thermoacidophilic, and spore-forming bacteria cause fruits and vegetable juices to spoil. A pasteurization process does not completely destroy the spores of those bacteria, but it activates their germination and further growth. The objective of this study was to assess the usefulness of high pressure pasteurization applied to inactivate AAT spores in apple juice. There was described the effect of a 300 MPa and 500 MPa pressure at 50° C on the survival of spores of eight AAT strains in the apple juice. When a 300 MPa pressure was applied for 10 min, the number of living spores was reduced to 1.27 - 3.46 log cfu/ml of juice depending on the strain. When the pasteurization process was prolonged by 30 min. and applied to the two most resistant strains, it was possible to reduce the number of living spores to 2.06 and 2.64 log cfu/ml. The increasing of the pressure to 500 Mpa did not cause the pasteurization process to become significantly more efficient. It was confirmed that the application of a pulsed high pressure was the most effective. There were applied six five-minute pressure cycles of 100 MPa, 300 MPa, and 500 MPa, at 50° C. The highest reduction in the number of spores of the two AAT strains amounting to 2.40 and 3.11 log cfu/ml was achieved when a 300 MPa pressure was applied. The application of a pulsed high pressure (100 MPa at 50° C), followed by one hour incubation at 50° C, and the subsequent application of high pressure (500 MPa) resulted in the reduction in the number of the spores by more than 4 log cfu/ml. The AAT spores were resistant to the high hydrostatic pressure under the conditions as described in this study.

7

Wpływ wysokiego ciśnienia hydrostatycznego na naturalną mikroﬂorę i barwę soków z warzyw korzeniowych

32%

Sokolowska B. , Skapska S. , Fonberg-Broczek M. , Niezgoda J. , Rutkowska M. , Chotkiewicz M. , Dekowska A. , Dobros N. , Rzoska S. J.

|

nr 4

PL

W pracy scharakteryzowano wpływ ciśnienia hydrostatycznego w wysokości 300 MPa, stosowanego w temperaturze 20°C, na przeżywalność naturalnej mikroflory soków z warzyw korzeniowych–marchwi, selera i buraków ćwikłowych. W zależności od rodzaju soku liczba drożdży zmniejszyła się od 2,65 do 5,17 log w czasie 10 min działania ciśnienia. Redukcja liczby pleśni wynosiła w tych samych warunkach od 2,00 do 3,30 log. W tych samych warunkach uzyskano również inaktywację liczby bakterii fermentacji mlekowej od 1,12 do 3,08 log. Ogólna liczba drobnoustrojów psujących ulegała redukcji o 4,15 log po 10 min działania ciśnienia. Zmiany poszczególnych parametrów barwy były niewielkie, ale istotne statystycznie, podczas gdy całkowita zmiana barwy ciśnieniowanych próbek soków była wizualnie słabo zauważalna.

EN

The survival of the native microflora of root vegetable juices –carrot, beetroot and celery, treated with 300 MPa at 20ºC was characterized. Count of yeasts decreased by 2,65-5,17 log after 10 min pressurization, depending on the type of juices. Reduction of moulds was 2,00–3,30 log in the same treatment conditions. Lactic acid bacteria inactivation reached 1,12–3,18 log. Reduction of total count of spoilaging microorganism was 4,15 log after 10min pressurization. Changes of individual colour parameters were small but significant (p < 0.05), while the total colour changes were barely perceptible.