Ontologia mammografii - struktura modelu, definicje i instancje pojęć

• Autorzy: Podsiadły-Marczykowska, T. , Guzik, A.

Warianty tytułu

EN

Mammographic ontology - structure of the model, definitions and instances of concepts

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy przedstawiono problemy występujące w dziedzinie mammografii, takie jak: zmienność interpretacji mammogramów, konieczność sfomułowania bardziej efektywnych kryteriów do oceny i opisu mammogramów i niepokojąco wysoki odsetek pominiętych lub błędnie zinterpretowanych przypadków raka piersi. Stwierdzono, że dla pełnego wykorzystania potencjału tkwiącego w badaniu mammograficznym, konieczna jest systematyzacja i objaśnienie struktury wiedzy tego fragmentu medycyny - ontologia mammografii. Podano definicję ontologii, opisano metodologię jej tworzenia i użyty edytor - Protege-2000. Opisano ogólne zasady tworzenia ontologii mammografii, podział modelu na moduły i hierarchię klas w poszczególnych modułach. Przedstawiono definicje podstawowych klas modelu i ich instancje.

EN

The paper presents mammographic ontology model of restricted domain of radiology. Method used to build the model, ontology editor, the structure of the model, class hierarchy, definitions of the main notions in the domain and their instances have been presented.

Słowa kluczowe

PL

mammografia; ontologia; modelowanie pojęć medycznych

EN

mammography; ontology; medical concept modeling

• Czasopismo: Bio-Algorithms and Med-Systems
• Rocznik: 2005
• Tom: Vol. 1, no. 1/2
• Strony: 247--252
• Opis fizyczny: Bibliogr. 23 poz., rys.

Twórcy

autor

Podsiadły-Marczykowska, T.

• Instytut Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej, Warszawa,

autor

Guzik, A.

• Zakład Radiologii Szpitala Grochowskiego, ul. Grenadierów 51/59, 04-073 Warszawa

Bibliografia

• 1. Beam C. A., Loyde P. M., Sullivan D. C.: Variability in Screening Mammography by US Radiologists. Findings from a National Sample, Archives of Internal Medicine vol 145 No.2 January 22 1996.
• 2. Chandrasekaran, B., Josephson, J. R., Benjamins V. R.: What Are Ontologies, and Why We Need Them ?, IEEE Inteligent Systems pp. 20-26, 1999.
• 3. Ciminio J. J.: From Data to Knowledge through Concept Orinted Terminologies:Experience with the Medical Entities Dictionary, Journal of American Medical Infromation Association, vol 7, pp. 288-297.
• 4. Didkowska J., Wojciechowska U., Tarkowski W., Zatoński W.: Nowotwory Złośliwe w Polsce w 2003 roku, Centrum Onkologii - Inst. Im. M. Skłodowskiej-Curie Zakład Epidemiologii i Prewencji Nowotworów, Krajowy Rejestr Nowotworów, Warszawa 2003
• 5. D'Orsi C. J., Kopans D. B.: Mammogarphic Feature Analysis, Seminars in Roentgenology, 28, pp. 204-229, 1998.
• 6. Dziukowa J.: Mammografia w Diagnostyce Raka Sutka Copyright BEL CORP Scientific Publ. Co., Warszawa 1998.
• 7. Duineveld A. J., Stoter R., Weiden M. R., Kanepa B., Benjamins V. R., WonderTools ? A Comparative Study of Ontological Engineering Tools. http://ncs.scienceuva.nl/wondertools/html/paper.htm
• 8. Fikes R., Kechler T.: The Role of Frame-Based Repreasentations in Reasoning Commun, ACM, vol. 28, pp. 904-920, 1985.
• 9. Pandha H. S., et. all.: Breast cancers missed in the prevalent screening round, Radiology 2002.
• 10. Friedman Noy N., Fergerson R. W., Musen. M. A.: The Knowledge Model of Protege-2000: Combining Interoperability and Flexibility, SMI technical report, Stanford University, School of Medicine, 2000.
• 11. Felbaum C. (Ed.): WordNet an Electronic Lexical Database, MIT Press, Cambridge, MA, 1998.
• 12. Gruber T. R.: A transactional Approach to Portable Ontology Specification, Knowledge Acquisition 5 (2), pp. 199-221, 1993.
• 13. Iwaszkiewicz K.: Atlas Mammografii, PZW, Warszawa 1993.
• 14. Jasper R., Uschold A.: A Framework for Understanding and Classifying Ontology Applications. W Twelfth Workshop on Knowledge Acquisition Modeling and Menagement KAW' 99, 1999.
• 15. Karp P. D: The Design Space of Frame Knowledge Representation Systems, SRI International Artificial Intelligence Center 1992.
• 16. Karp P. D., Riley M. et all.: The EcoCyc Database, Nucleic Acid. Res., vol. 30, pp. 56-62, 2002.
• 17. Kerlikowske K. et all.: Difference in Mammography Reading Journal of the National Cancer Institute, 1998.
• 18. Kopans D. B., D'Orsi C. J., Adker D. D.: Breast Imaging Reporting and Database System (BI-RADS), American College of Radiology, 1993.
• 19. Minsky M.: A Framework for representing Knowledge. Readings In Knowledge Representation., Levesque, H. (ed.), Morgan Kaufmann, Los Altos CA, pp. 246-262 , 1987.
• 20. Pinto H. S., Martins J. P.: Ontologies: How can they be built, Knowledge and Information Systems, (6) pp. 441-464, 2004.
• 21. Podsiadły-Marczykowska T.: Ocena Jakości Opisowych Danych Medycznych na Przykładzie Raportu Mammograficznego, Acta Bio-Optica Medica et Informatica Medica, vol. 9, pp. 105-110, 2003.
• 23. Rector A. L.: Modularisation of Domain Ontologies Implemented in Description Logics and Related Formalisms including OWL, in Proceedings K-CAP'03, October 23-25 pp. 121-128, 2003.
• 24. Tabar L. et all.: Beyond randomized Controlled Trials: organized Mammographic Screening Substantially Reduces Breast Carcinoma Mortality, Cancer 2001.