Porownanie czulosci wykrywania bakterii we krwi ludzkiej przy uzyciu klasycznych metod hodowlanych oraz technik wykrywania DNA i RNA bakteryjnego metodami PCR i FISH

• Autorzy: Gosiewski T. , Kasprzyk A. , Strus M.

Warianty tytułu

EN

Comparision of the sensitivity of detection of bacteria in human blood using classic culture methods and molecular techniques: PCR and FISH

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Bakteryjne zakażenia krwi są jednymi z najcięższych postaci zakażeń wykrywanych przy użyciu klasycznych metod hodowlanych. Ze względu na ich niską czułość i czasochłonność, konieczne jest wprowadzenie szybkich, molekularnych metod diagnostycznych, takich jak PCR czy FISH. Wyniki tej pracy wskazują na wysoką czułość obu metod molekularnych wymagają one jednak standaryzacji przed ich szerszym wykorzystywaniem w rutynowej diagnostyce mikrobiologicznej.

EN

Blood infections are one of the major problems of the contemporary medical care. Their detection depends strongly on sensitivity of the used microbiological methods. Widely applied classical techniques based on blood cultivation are time consuming and less sensitive. Therefore, it is necessary to search for new molecular tools to detect bacteria in blood directly taken from patient, like as PCR or FISH. In this paper we have proved that both PCR and FISH show very high sensitivity but due to various limitations their procedures need for further standardization before future application to routine diagnosis of blood infections.

Słowa kluczowe

PL

czlowiek; krew; infekcja bakteryjna; zakazenia krwi; bakterie; wykrywanie; metody analizy; metody diagnostyczne; metody molekularne; lancuchowa reakcja polimerazy; hybrydyzacja fluorescencyjna in situ; standaryzacja; diagnostyka mikrobiologiczna

• Wydawca: -
• Czasopismo: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia
• Rocznik: 2005
• Tom: 57
• Numer: 3
• Strony: 319-325
• Opis fizyczny: s.319-325,rys.,tab.,bibliogr.

Twórcy

autor

Gosiewski T.

• Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellonskiego w Krakowie, ul.Czysta 18, 31-121 Krakow

autor

Kasprzyk A.

autor

Strus M.

Bibliografia

• 1. Abu AI-Soud W, RÍdström P. Capacity of Nine Thermostable DNA Polymerases To Mediate DNA Amplification in the Presence of PCR - Inhibiting Samples. Appl Environ Microbiol 1998; 64: 3748-53.
• 2. Akane A, Matsubara K, Nakamara H i inni. Identification of the Heme Compound Copurified with Deoxyribonucleic Acid (DNA) from Bloodstains a Major Inhibitor of Polymerase Chain Reaction (PCR) Amplification. J Forensic Sci 1994; 37: 362-72.
• 3. Byrnes J, Downey K.M, Esserman L. Mechanism of Hemin Inhibition of Erythroid Cytoplasmic DNA Polymerase. Biochemistry 1997; 74: 796-9.
• 4. Carrol N, Adamson P, Okhravi N. Elimination of Bacterial DNA from Taq Polymerases by Restriction Endonuclease Digestion. J Clin Microbiol 1999; 37: 3402-4.
• 5. Carrol N, Adamson P, Okhravi N i inni Detection of and Discrimination between Gram - Positive and Gram - Negative Bacteria in Intraocular Samples by Using Nested PCR. J Clin Microbiol 2000; 38: 1753-7.
• 6. Cherie B, Xu J, Moore J. Risk Assessment Models and Contamination Management: Implications for Broad - Range Ribosomal DNA PCR as a Diagnostic Tool in Medical Bacteriology. J Clinic Microbiol 2002; 40: 1575-80.
• 7. Grandel U, Grimminger F. Endothelial responses to bacterial toxins in sepsis. Crit Rev Immunol. 2003; 23: 267-99.
• 8. Hryniewiecki T, Gzyl A, Augustynowicz E, Rawaczyńska I. Reakcja amplifikacji bakteryjnego DNA w diagnostyce infekcyjnego zapalenia wsierdzia. Med Dosw Mikrobiol. 2002; 54: 265-72.
• 9. Jansen G. J, Harmsen J.M, Welling G. W i inni. Rapid identification of bacteria in blood cultures by using fluorescently labeled oligonucleotide probes. J Clin Microbiol 2000; 38: 814-7.
• 10. Kane T, Johannigman J. The Detection of Microbial DNA in the Blood. Ann Surg 1998; 1: 1-9.
• 11. Doniesienie z konferencji Kiibler A. Konferencja Sepsa - wyzwanie zdrowotne XXI wieku (klinika i mikrobiologia) Kraków, Czerwiec 2002.
• 12. Mercier В, Gaucher C, Feugeas O, Mazurier C. Direct PCR from whole blood, without DNA extraction. Nucleic Acids Res 1990; 19: 5908.
• 13. RÍdström P, Abu Al-Soud P, Lantz P i inni. A sample preparation method which facilitates detection of bacteria in blood cultures by the polymerase chain reaction. J. Microbiol Methods 1998; 217-24.
• 14. Shimada J, Hayashil, Inamatsu Ti inni. Clinical trial of in-situ hybridization method for the rapid diagnosis of sepsis. J Infect Chemother. 1999; 5: 21-31.
• 15. Soutern S.A, Herrington C.S. In situ hybrydyzation - a practical approach. IRL press. Volume 3 Oxford 2001.
• 16. Talmud F, Hansen A, Bhatnagar D i inni. Rapid screening for specific mutations in patients with a clinical diagnosis of familial hypercholesterolaemia. Atherosclerosis 1991; 89: 137-141.