Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: zliczanie komórek

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Constructing software for analysis of neuron, glial and endothelial cell numbers and density in histological Nissl-stained rodent brain tissue

Kołodziejczyk A., Ładniak M., Piórkowski A.

Journal of Medical Informatics & Technologies

2014

Vol. 23

77--85

Cell number, density and volume of white and gray matter in brain structures are not constant values. Cellular alterations in brain areas might coincide with neurological and psychiatric pathologies as well as with changes in brain functionality during selection experiments, pharmacological treatment or aging. Several softwares were created to facilitate quantitative analysis of brain tissues, however results obtained from these softwares require multiple manual settings making the computing process complex and time-consuming. This study attempts to establish half automated software for fast, ergonomic and an accurate analysis of cellular density, cell number and cellular surface in morphologically different brain areas: cerebral cortex, pond and cerebellum. Images of brain sections of bank voles stained with standard cresyl-violet technique (Nissl staining), were analyzed in designed software. Results were compared with other commercially available tools regarding number of steps to be done by user and number of parameters possible to measure.

Semi-automatic count of hepatic stellate cells from microscopic in-vitro images by modeling elliptical nuclei

Bołdak C., Sadowski M., Jaroszewicz J.

Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka

2008

Z. 3

23-38

A new method of semi-automatic liver cell counting is presented. Instead of segmenting the cells bodies (not regular and fragmented in some stages of the cells life) it localizes the cells nuclei which are bright, homogeneous and elliptical structures with darker body (body fragments) on their circumference. The nuclei are modeled by ellipses which can be found in two manners: by local region growing algorithm and by reconstruction of the ellipse equation from its contour points. The found ellipses set is then downsized (since all possible ellipses are initially considered) by eliminating the closest one to another and the worst ones by mean of a special fitness function. The method is implemented as a visual, multiplatform JAVA application, easy to use in the scientific every-day work. It is evaluated on real microscopic in-vitro images of the hepatic stellate cells.

W artykule tym zaprezentowana jest nowa, półautomatyczna metoda zliczania komórek wątroby. Zamiast skupiać sięna ciałach komórek (w niektórych fazach ich życia nieregularnych i pofragmentowanych) lokalizuje ona ich jądra, które są jasnymi, jednolitymi i eliptycznymi strukturami otoczonymi przez ciemniejsze ciało (lub jego fragmenty). Jądra komórek są modelowane na 2 sposoby: przez lokalny algorytm rozrostu obszaru i przez odtworzenie równania elipsy z jej punktów na obwodzie.Wśród wszystkich znalezionych elips (początkowa każda jej potencjalna lokalizacja jest brana pod uwagę) wybierane są lokalnie najlepsze oraz te, których dopasowanie, mierzone specjalną funkcją, jest powyżej pewnego progu. Metoda została zaimplementowana jako graficzna, wieloplatformowa, przyjazna dla użytkownika aplikacja w języku JAVA. Jej działanie zostało ocenione na rzeczywistych mikroskopowych obraz in-vitro komórek wątroby.