Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: szlaki sygnałowe

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Sensitivity Analysis Aimed at Finding Potential Molecular Drug Targets

Śmieja Jarosław, Kardyńska Małgorzata, Pudlo Marta

Mathematica Applicanda

2019

Vol. 47, no. 2

197--205

Sensitivity analysis has become one of the standard tools in analysis of models of intracellular processes. Various methods have been proposed, developer for either local or global sensitivity of systems under investigation. In this work, we propose a method that may be used to find potential molecular drug targets, taking into account heterogeneity of population of cells with respect to their responses to a particular drug agent.

Analiza wrażliwości stała się jednym ze standardowych narzędzi w analizie modeli procesów wewnątrzkomórkowych. Do tej pory zaproponowano różne metody, opracowane dla lokalnej lub globalnej wrażliwości badanych systemów. W niniejszej pracy proponujemy metodę, która może być wykorzystana do znalezienia potencjalnych molekularnych celów leków, biorąc pod uwagę heterogeniczność populacji komórek w odniesieniu do ich odpowiedzi na konkretny lek.

Analiza proteomu osteoblastów stymulowanych nowym kompozytem HAp-glukan przy wykorzystaniu metody mikromacierzy białkowych

Sawiniec J., Borkowski K., Malewski T., Ginalska G.

Materiały Ceramiczne

2011

T. 63, nr 4

769-772

Hydroksyapatyt (HAp) jest uznanym materiałem kościozastępczym, jednakże jego szerokie zastosowanie w chirurgii i ortopedii ograniczone jest poprzez jego niską poręczność chirurgiczną. Wytworzenie połączenia HAp-polimer organiczny prowadzi do uzyskania biomateriału o korzystniejszych właściwościach. Zastosowanie kliniczne nowego kompozytu musi być poprzedzone jego kompleksowymi badaniami molekularnymi, zarówno na poziomie transkryptomu jak i proteomu. Szczególnie ważne jest określenie zmian jakie może on wywołać na szlakach apoptozy, nekrozy czy też karcynogenezy. Zaproponowana przez nas nowoczesna technika mikromacierzy białkowych pozwala na jednoczesną ocenę zmian stężenia wielu białek biorących czynny udział w ważnych szlakach metabolicznych. Celem naszych doświadczeń było porównanie wpływu granulatu HAp i kompozytu HAp-glukan na zmiany zachodzące w stężeniu różnych białek osteoblastów. Za wyniki istotne funkcjonalnie przyjęto te oznaczenia, w których stosunek pomiędzy poziomem białek w osteoblastach stymulowanych HAp w porównaniu do biokompozytu był około dwukrotnie zmieniony. Nasze badania wykazały, że poziomy ponad 90. procent białek nie uległy istotnym statystycznie zmianom. Wyraźne zmiany obserwowano w grupie białek regulujących szlaki apoptozy. Szczególnie znamienny był wzrost poziomu białka AKT (anti-protein kinase B@alpha;) oraz obniżenie poziomu białka PTEN (phosphatase and tensin homolog) w osteoblastach stymulowanych nowym kompozytem. Obydwa te efekty mogą być odpowiedzialne za zwiększenie zdolności komórek stymulowanych nowym kompozytem HAp-glukan do migracji i zasiedlania ubytków kostnych.

Hydroxyapatite (HAp) is well known as a bone-replacement material, but its widespread use in orthopedic and surgery is limited by its poor surgical handiness. To overcome this problem, Hap is frequently combined with organic polymers. The clinical use of new designed hydroxyapatite-glucan composite should be preceded by its complex tests on transcriptome and proteome level to find and identify changes that may trigger the pathways of apoptosis, necrosis or carcinogenesis. The effective tool, such the protein microarray technology enables simultaneous assessment of changes in concentrations of many proteins involved in the important metabolic pathways. The aim of our study was to compare the changes in the concentration of different osteoblast proteins caused by granular HAp or HAp-glucan composite stimulation. The proteins were assessed as functionally significant, when the ratio between the level of protein in cells stimulated with Hap compared to the cells stimulated with the Hap-glukan composite was changed @ge;2-fold. Our study showed that the levels of over 90 % of proteins were not statistically changed. The significant changes were observed in the group of proteins that were responsible for regulation of apoptosis pathways. The increase of level of AKT (Anti-Protein Kinase B@alpha;) and the decrease of level of PTEN (Phosphatase and Tensin Homolog) in osteoblasts stimulated with the Hap-glukan composite may lead to enhancement of cell survival and migration.