Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Ascertaining optimal protocols for DNA extraction of different qualities of pike (Esox lucius) tissue samples - a comparison of commonly used solid phase extraction methods

Eschbach E.

Environmental Biotechnology

|

2012

|

Vol. 8, No. 1

7-14

EN

High quality DNA extractions are a prerequisite for genetic studies of a variety of organisms including fish. The current study focused on the applicability of different commercially available solid phase extraction (SPE) methods as the easiest and fastest methods for DNA extraction and their efficiency with different tissue qualities. These were represented by different kinds of pike tissues (fins, muscle, scales) preserved with different methods and stored at different temperatures over different periods of time (0.5 to 10.0 years). All DNA extractions were analysed according to their yield, purity, integrity and functionality in PCR based downstream analysis. Additionally mechanical pre-treatment of poor quality tissues (e.g. old or aged tissues) and efficient ethanol preservation of frozen bulk fin tissue were investigated. All SPE methods yielded functional DNA from very different qualities of pike tissues as shown by PCR analysis of small nuclear (microsatellite) and large mitochondrial (complete D-loop) DNA fragments. DNA from poor quality tissue can be extracted using single column SPE and in some cases mechanical pre-treatment even improved the yield. Good quality tissue as obtained e.g. from commercial fishermen as frozen bulk material is more efficiently preserved by thawing in ethanol at room temperature than at 2-8°C. DNA from these and air dried tissues was very efficiently prepared by applying reverse SPE in 96-well format, allowing for fast processing of a multitude of samples for high throughput analysis.

2

Wpływ pory dnia i czynników pogodowych na żerowanie szczupaka (Esox lucius L.) w jeziorze Podgaje

Łukaszewicz B., Dąbrowski J.

Ekologia i Technika

|

2011

|

R. 19, nr 5

277-280

PL

W pracy analizowano wpływ pory dnia i czynników pogodowych na aktywność żerowania szczupaka w jeziorze Podgaje, przy zastosowaniu metody połowu na spinning. Połowy prowadzone były z brzegu jeziora przez 30 dni pod koniec lata 2010 r. Każdego dnia łowiono 3 godziny rano, począwszy od wschodu słońca, 3 godziny około południa i 3 godziny przed zachodem słońca. Podczas połowów stosowano 3 rodzaje różnych przynęt sztucznych: rippery, twistery, błystki obrotowe. Po złowieniu szczupaka delikatnie odhaczano, ważono i określano jego długość całkowitą, a następnie wypuszczano. Podczas każdego dnia połowu rejestrowano wartość czynników pogodowych. Najwięcej szczupaków złowiono rano, były to głównie osobniki niewymiarowe. Wieczorem złowiono najmniej szczupaków, lecz udział osobników wymiarowych był większy. Szczupaki najlepiej żerowały w dni o znacznym zachmurzeniu, ustabilizowanym ciśnieniu zbliżonym do normalnego, przy znacznych wiatrach wiejących z kierunku południowego-zachodu. Najskuteczniejszą przynętą sztuczną okazała się błystka obrotowa, na którą skusiło się najwięcej szczupaków, wśród których były te największe.

EN

The influence of the time of day and weather factors on the pike preying activity in Podgaje lake, using the spinning fishing method was investigated, The fish were caught by the lake coast during 30 days in late summer 2010. Fishing was conducted every day for 3 hours in the morning, starting on sunrise, 3 hours around noon and 3 hours before sunset. 3 types of entice were used during fishing: rippers, twisters and spinners. After the pike was caught it was delicately unhooked, weighted and measured, and then put back into the water. Weather factors were recorded on each day of fishing. The largest number of pikes were caught in the morning, these specimen were mainly of unusual size. The smallest number of pikes were caught in the evening, however the percentage of usual sized specimen was higher. Pikes were praying mainly on days with heavy clouds, stabilized atmospheric pressure close to the norm, with stronger winds coming from south-west. Spinners turned out to be the most efficient artificial entice that allowed to catch most pikes, the largest among them.

3

Mercury contamination of tissues and organs of pike (Esox lucius L. 1758)

Żarski T. P., Ożóg A., Żarska H., Budzińska-Wrzesień E., Majdecka T.

Ecological Chemistry and Engineering. A

|

2008

|

Vol. 15, nr 9

1011-1017

EN

The aim of the study was examination in which tissues and in what quantity predatory fish accumulates the highest amount of mercury. Concentration of mercury were determined in tissues and organs of pikes. Ten fish were bought in fish wholesale firm in Warsaw. Analyzed material comprised samples of chosen tissues like: scales, skin, fins, skeleton, muscles, a liver, spleen, swinbladder, heart, bones, frontal and dorsal kidneys, spawn or milt, eyes, gills, brain and intestine. Before collecting samples of tissues, the fish were measured and weighed with 10-1 g and samples were a weighed with accuracy of 10-3 g. 16 samples were collected for each fish. Mercury was determined by the atomic absorption spectrometry method using traces mercury analyzer AMA 254 controlled by the computer program AMA. The investigation demonstrated that mercury quantity in tissues depends on mass and age of fish. In pike the highest level of mercury was in muscles, considerable amounts were found also in guts and liver which indicates that the digestive system was the main way of absorbing mercury.

PL

Celem pracy było stwierdzenie, w których tkankach i w jakiej ilości kumuluje się rtęć w organizmie szczupaka. Badania przeprowadzono u 10 śniętych szczupaków zakupionych w hurtowni na terenie Warszawy. Ryby poddano dysekcji i wypreparowano tkanki i narządy, tj: łuski, skórę, płetwy, szkielet, mięśnie, wątrobę, śledzionę, serce, pęcherz pławny, nerkę przednią i grzbietową, ikrę lub mlecz, oczy, skrzela, mózg dyrekcji jelito. Przed dysekcją całą rybę zważono i zmierzono, a po dysekcji wyznaczono masę poszczególnych tkanek i narządów z dokładnością do 10-3 g. W sumie z każdej ryby pobrano 16 próbek do dalszych badań. Zawartość rtęci w tkankach i narządach obliczono z iloczynu masy i stężenia tego pierwiastka w badanym materiale. Stężenie rtęci oznaczano przy użyciu automatycznego analizatora śladów rtęci AMA 254 metodą spektrometrii absorpcji atomowej pod kontrolą programu komputerowego AMA. Stwierdzono, że największe ilości rtęci występują w mięśniach, w jelicie i w wątrobie, co wskazuje, że droga pokarmowa jest głównym szlakiem wchłaniania rtęci. Stwierdzono także, że koncentracja rtęci w tkankach i narządach jest zależna od wieku i masy ryby.