Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Powiadomienia systemowe

Sesja wygasła!
Sesja wygasła!

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: structure refinement

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Improving protein structure prediction, refinement and quality assessment techniques

Leelananda S. P., Pawłowski M., Faraggi E., Kloczkowski A.

TASK Quarterly : scientific bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk

2014

Vol. 18, No 3

231--243

Several novel techniques have been combined to improve protein structure prediction, structural refinement and quality assessment of protein models. We discuss in brief the development of four-body potentials that take into account dense packing and cooperativity of interactions of proteins, and its success. We have developed a metho d that uses whole protein information filtered through machine learning to score protein models base d on their likeness to native structure. Here we consider electrostatic interactions and residue depth, and use these for structure prediction. These potentials were tested to be succe ssful in CASP 9 and CASP 10. We have also developed a Quality Assessment technique, MQAP single, which is a quasi-single-model MQAP , by combining advantages of both “pure” single-model MQAP s and clustering MQAP s. This technique can be used in ranking and assessing the absolute global quality of single protein models. This model (Pawlowski-Kloczkowski) was ranked 3rd in Model Quality Assessment in CASP 10. Consideration of protein flexibility and its fluctuation dynamics improves protein structure prediction and leads to better refinement of computational models of proteins. Here we also discuss how Anisotropic Network Model ( ANM ) of protein fluctuation dynamics and Go-like model of energy score can be used for novel protein structure refinement.

Rozdrobnienie struktury w wyniku mechanicznego mielenia ferrytu baru

Ławecka M., Leonowicz M.

Archiwum Nauki o Materiałach

2001

T. 22, nr 3

191-201

Przeprowadzono badania procesu rozdrabniania struktury ferrytów baru w trakcie ich długotrwałego mechanicznego mielenia w młynie kulowym. Stwierdzono, że wielkość cząstek proszku zmniejsza się od wartości 340 nm dla materiału wyjściowego do 50 nm dla czasów mielenia dłuższych niż 100 h, po czym pozostaje stała. Wielkość krystalitów jest zbliżona do wielkości cząstek proszku. Jednak dla długich czasów przemiału, rzędu 200 h, zaczyna odbiegać od wielkości cząstek, a struktura ulega zdefektowaniu, co przejawia się w utracie własności typowych dla materiału magnetycznie twardego i w zdolności cząstek do orientacji w polu magnetycznym.

Studies of structure refinement, in the course of high-energy ball milling, were performed for barium ferrite material. It has been found that the powder particle size decreases from 340 nm, for the as supplied powder, down to 50 nm for milling times longer than 100 h, thereafter settles down at the level of 50 nm. The crystallite size follows the particle size, however, for milling times longer than 200 h the gap between these two parameters becomes wider. This leads to the loss of permanent magnet properties as well as the ability of particle alignment in a magnetic field.