Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Sondy fluorescencyjne typu „light up” do detekcji i obrazowania G-kwadrupleksów in vitro i in vivo. Cz. 1 i 2

Baranowski Daniel

Wiadomości Chemiczne

|

2020

|

[Z] 74, 11-12

883--901

EN

G-quadruplexes are non-canonical guanosine rich four stranded nucleic acids structures consisting of at least two or more G-tetrads stabilized by an array of Hoogsteen hydrogend bonds and monovalent cations. The distinguishing feature of the G-quadruplexes is their high thermal stability and structural polymorphism in aqueous media. In parallel, a great number of GQ structures have been extensively surveyed ex vivo by means of biophysical techniques such as nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, circular dichroism (CD) spectroscopy, and X-ray crystallography. Accumulating evidence suggesting that G-quadruplexes play essential role in a numerous biological processes in vivo, including DNA replication and transcription, RNA translation as well as genomic maintenance. Consequently, G-quadruplexes has attracted attention as therapeutic targets in cancer or hereditary diseases as well as molecular target in cellular biology. Study on G-quadruplexes:ligand interaction by NMR, CD, UV and fluorescence spectroscopy in vitro or in vivo has become an intensive research work area of many groups in recent years. Nowadays, there are available large amount of organic compounds that selectively bind to G-quadruplexes and their photophysical and kinetic properties were comprehensively characterized but only few of them are endowed with fluorescence properties that could be applicable as fluorescent probes in cellular biology or in vitro detection. Interestingly, the group of these fluorescent probes is characterized by a vast structural diverisity resulting from the different way of interaction with G-quadruplexes as well as G-quadruplex polymorphism. This review focuses on the G-quadruplex-selective light up fluorescent probes that have been employed for in vitro detection as well as cellular imaging along with a summary of the key photophysical, biophysical, and biological properties of reported examples.

2

Molekularne sondy fluorescencyjne w biologii, biochemii i biotechnologii

Kukuła K., Kamińska I., Ortyl J., Chachaj-Brekiesz A.

Technical Issues

|

2015

|

nr 4

19--25

EN

Nowadays molecular fluorescent probes are widely used in many fields of science, primarily in biology, medicine and biotechnology. Particular emphasis on the development of technologies to cancer cells diagnosis and detection of genetic mutations led to numerous modification of luminescent fluorophores, which has resulted in a wide range of such compounds. Scientists from around the world are continuously trying to experience the mechanism of cells function and metabolic pathways. Certainly, it is affected by the fact that any analytical techniques using fluorescence operate easily and nondestructively. A phenomenon of fluorescence is observable by chromophore which absorbs energy at a certain wavelength and is able to emit electromagnetic radiation at another wavelength.

3

Barwniki skwaryliowe jako sondy fluorescencyjne do oznaczania biocząsteczek

Jurek K., Kabatc J.

Prace Instytutu Elektrotechniki

|

2015

|

Z. 268

57--64

PL

Chemiczna modyfikacja struktury barwników skwaryliowych daje nowe układy chromoforowe o szerokim zakresie właściwości optycznych, takich jak absorpcja światła i emisja fluorescencji, z zakresu światła od widzialnego do bliskiej podczerwieni. Otrzymano nowe funkcjonalne barwniki, w których pod wpływem bodźca zewnętrznego lub oddziaływań chemicznych, zachodzą zmiany w rozmieszczeniu ładunku elektronowego w chromoforze skwaryliowym. Z uwagi na wyraźne zmiany ich właściwości spektroskopowych pod wpływem połączenia z substancją analizowaną, mogą zaleźć praktyczne zastosowanie, jako markery fluorescencyjne do oznaczania biocząsteczek.

EN

Chemical modification of the structure of squarylium dyes gives a new chromophoric systems that have a wide range of optical properties, such as the light absorption and fluorescence emission in the range from the visible light to the near infrared one. The new functional dyes in which the changes of the electron charge distribution in chromophore under the influence of an external stimulus or chemical undergo have been obtained. The interaction between dye and analyte leads to the significant changes of their spectroscopic properties. It can give the possibility of practical application of these new dyes as the fluorescent markers for biomolecules labeling.

4

Survey identification of 50 Hz magnetic field impast on selected biological processes in the model organizm Saccharomyces cerevisiae

Sztafrowski D., Wróblewski Z., Łukaszewicz M.

Przegląd Elektrotechniczny

|

2013

|

R. 89, nr 1a

56--58

EN

The paper presents results of a research to determine the impact on selected biological processes in a model organism Saccharomyces cerevisiae of 50 Hz variable frequency magnetic field. The investigations have been performed on testing stand constructed at the Institute of Electrical Power Engineering, Wroclaw University of Technology.

PL

W artykule przedstawiono wyniki badań wpływu przemiennego pola magnetycznego 50 Hz na wybrane procesy biologiczne organizmu modelowego Saccharomyces cerevisiae. Badania przeprowadzono na zaprojektowanym w Instytucie Energoelektryki Politechniki Wrocławskiej stanowisku badawczym.

5

Evaluation of how low frequency magnetic field 50 Hz affect living cells

Sztafrowski D., Wróblewski Z., Łukaszewicz M.

Przegląd Elektrotechniczny

|

2011

|

R. 87, nr 2

250-254

EN

The mechanism of ELF-MF impact on the metabolic processes occurring in cells of the living organisms is discussed. Existing research suggests that biological membranes may be composite antenna for stimulation by an electromagnetic field. To further elucidate this mechanism the use of fluorescent probes is suggested.

PL

W referacie przedstawiono postulowany mechanizm oddziaływania ELF-MF na procesy metaboliczne zachodzące w komórkach organizmów żywych. Błony biologiczne mogą być anteną zbiorczą dla bodźca, jakim jest pole elektromagnetyczne. Postuluje się wykorzystanie sond fluorescencyjnych do dalszych badań.

6

Sole stilbazoliowe jako sondy fluorescencyjne do monitorowania lokalnej lepkości i pH roztworów

Bajorek A., Wrześniewska I., Pietrzak M.

Chemik

|

2011

|

Vol. 65, nr 4

255-260

PL

Serię 7. barwników stilbazoliowych, p-podstawionych jodków 2- i 4-styrylochinoliniowych oraz 2- i 4-styrylopirydyniowych otrzymano przez kondensację aldehydu 4-(N,N-dimetyloamino)benzoesowego oraz aldehydu 4-(N,N-dimetyloamino)-1-naftoesowego z jodkami N-podstawionych pikolin i metylochinolin. Wyznaczono właściwości spektroskopowe otrzymanych związków w rozpuszczalnikach znacznie różniących się polarnością, oraz zbadano ich przydatność jako sond fluorescencyjnych do badania lokalnej lepkości i pH roztworów.

EN

A series of p-substituted 2- or 4-styrylquinolinium iodides and 2- or 4- styrylpyridinium iodides were prepared by the condensation of 4-(N,N-dimethylamino)benzaldehyde and 4-(N,N-dimethylamino)-1-naphthaldehyde with N-substituted picolines and methylquinolinium iodides. Spectroscopic properties of the dyes are characterized in organic solvents. These dyes were then tested as fluorescence probes to study the local viscosity and pH of the solutions.

7

Monitorowanie syntezy poliuretanu metodą FPT

Ortyl J., Sawicz-Kryniger K., Popielarz R.

Czasopismo Techniczne. Chemia

|

2010

|

R. 107, z. 1-Ch

233-242

PL

Zbadano przydatność technologii sond fluorescencyjnych (FPT) do monitorowania przebiegu procesów syntezy poliuretanów na przykładzie reakcji poliaddycji heksametylenodiizocyjanianu do glikolu polipropylenowego. Do roli sond fluorescencyjnych zastosowano Styryl 7, 4-dimetyloamino-4'-nitrostilben (DMANS) oraz 7-dietyloamino-4-metylokumarynę (Coumarin 1). Jako wskaźnik postępu polimeryzacji zastosowano stosunek intensywności fluorescencji (R), mierzony przy dwóch długościach fali, zlokalizowanych po obu stronach maksimum widma fluorescencji sondy. Stwierdzono, że widma fluorescencji badanych sond przesuwają się w stronę fal krótszych w miarę postępu addycji grup izocyjanianowych do hydroksylowych, co przejawiało się wzrostem wartości R. Tym samym technologia FPT umożliwia śledzenie postępu reakcji syntezy poliuretanów oraz może być z powodzeniem stosowana do kontroli stopnia utwardzenia powłok poliuretanowych stosowanych w przemyśle.

EN

Applicability of fluorescence probe technology (FPT) for monitoring of synthesis of polyurethanes by addition polymerization of diisocyanates to polyols has been evaluated, using hexamethylene diisocyanate and poly(propylene glycol) as example monomers. Styryl 7, 4-dimethylamino-4'-nitrostilbene (DMANS) and 7 -diethylamino-4-methylcoumarin (Coumarin 1) were applied as the fluorescent probes. The ratio of fluorescence intensities measured at two wavelengths located on both sides of the fluorescence spectrum maximum was applied as an indicator of the reaction progress. It was found that the fluorescence spectra of the probes studied shifted to shorter wavelength during the addition polymerization of the monomers, which resulted in increase of the ratio R. Hence, the FPT method is applicable for tracing of the progress of addition polymerization reactions used for synthesis of polyurethanes, and, it can be applied successfully for monitoring of the degree of cure of polyurethane coatings used in industry.

8

Ocena przydatności pochodnych ftalimidu do monitorowania fotopolimeryzacji kationowej metodą FPT

Ortyl J., Sawicz K., Popielarz R.

Czasopismo Techniczne. Chemia

|

2009

|

R. 106, z. 1-Ch

67-73

PL

Zbadano przydatność N-podstawionych pochodnych ftalimidu w roli sond fluorescencyjnych do monitorowania procesów fotopolimeryzacji kationowej metodą FPT. Przebadanymi związkami były: N-(4-karboksyfenylo)ftalimid, N-(4-metylofenylo)ftalimid, N-butyloftalimid, N-hydroksyftalimid oraz N-(1-naftylo)ftalimid. Stwierdzono, że jedynie N-(4-karboksyfenylo) ftalimid jest wystarczająco trwały w warunkach fotopolimeryzacji kationowej eterów winylowych, aby mógł być stosowany do monitorowania tego procesu w całym zakresie konwersji monomeru.

EN

Applicability of a series of N-substituted phthalimides as fluorescent probes for monitoring of cationic photopolymerization processes by FPT method has been evaluated. The following phthalimides were studied: N-(4-carboxyphenyl)phthalimide, N-(4-methylphenyl)phthalimide, N-butylphthalimide, N-hydroxyphthalimide and N-(1-naphthyl)phthalimide. It has been found that only N-(4-carboxyphenyl)phthalimide is sufficiently stable under the cationic photopolymerization conditions of vinyl ethers to allow monitoring that process within entire range of the monomer conversions.

9

Nowe sondy fluorescencyjne do monitorowania procesu utwardzania żywic epoksydowych

Sawicz K., Ortyl J., Popielarz R.

Czasopismo Techniczne. Chemia

|

2009

|

R. 106, z. 1-Ch

119-126

PL

Zbadano możliwość wykorzystania pochodnych kumaryny w roli sond fluorescencyjnych do monitorowania metodą FPT procesów sieciowania żywic epoksydowych. Przebadano następujące pochodne: 7-hydroksy-4-metylokumarynę (A), 7-metoksy-4-metylokumarynę (B) oraz 4-metylo-2H-benzo[h]chromen-2-on (C). Stwierdzono, że sondy A i C umożliwiają śledzenie postępu procesu utwardzania kompozycji epoksydowych z użyciem stosunków intensywności fluorescencji sondy, mierzonych przy dwóch różnych długościach fali. Jednak w wypadku sondy B konieczne jest zastosowanie intensywności względnej jako wskaźnika postępu reakcji, mierzonej względem intensywności początkowej, gdyż widmo fluorescencyjne tej sondy nie zmienia położenia wraz ze zmianami zachodzącym w jej mikrootoczeniu.

EN

Applicability of coumarin derivatives as fluorescent probes for monitoring of crosslinking process of epoxy resins, using FPT method, has been studied. The following coumarins were evaluated: 7-hydroxy-4-methylcoumarin (A), 7-methoxy-4-methylcoumarin (B) and 4-methyl-2H-benzo[h]-chromen-2-one (C). It was found that the probes A and C enabled monitoring of the crosslinking process using the fluorescence intensity ratios, measured at two different wavelengths. However, in the case of probe B, the use of relative fluorescence intensity measured at a single wavelength, relative to the initial intensity determined at the start of the process, was necessary, because fluorescence spectrum of that probe did not shift upon changes occurring in its microenvironment.

10

Monitorowanie procesu utwardzania żywic epoksydowych za pomocą sondy fluorescencyjnej

Ortyl J., Sawicz K., Popielarz R.

Czasopismo Techniczne. Chemia

|

2008

|

R. 105, z. 1-Ch

65-74

PL

Zbadano przydatność technologii sond fluorescencyjnych (FPT) do monitorowania przebiegu procesu utwardzania żywic epoksydowych aminami alifatycznymi. W roli sondy fluorescencyjnej wykorzystano oranż akrydynowy. Jako wskaźnik postępu utwardzania przyjęto stosunek intensywności fluorescencji mierzonych przy dwóch długościach fali, zlokalizowanych po obu stronach maksimum widma fluorescencji sondy. Stwierdzono, że widmo fluorescencji sondy akrydynowej przesuwa się w stronę fal krótszych w miarę postępu addycji grup aminowych do epoksydowych. Umożliwia to śledzenie postępu utwardzania żywic epoksydowych. Zaproponowano więc użycie metody FPT do badań kinetyki utwardzania kompozycji epoksydowych oraz do kontroli stopnia utwardzenia powłok epoksydowych stosowanych w przemyśle.

EN

Applicability of fluorescence probe technique (FPT) for monitoring of the progress of curing of epoxy resins with amine hardeners has been evaluated. Acridine orange was applied as a fluorescent probe. Ratio of fluorescence intensities, measured at two wavelengths located on both sides of the probe fluorescence spectrum, was applied as an indicator of the curing progress. It was found that the fluorescence spectrum of acridine orange shifted to shorter wavelengths with the progress of addition polymerization of the amine/epoxide system. This enabled monitoring of the curing process of epoxy formulations by FPT. Hence, the application of FPT for study of the curing kinetics and for control of degree of cure of epoxy coatings used in industry has been proposed.

11

Barwniki styrylochinoliniowe jako sondy spektroskopowe w procesie polimeryzacji rodnikowej

Bajorek A., Kabatc J., Pączkowski J.

Polimery

|

2007

|

T. 52, nr 7-8

556-561

PL

Omówiono wyniki badań dotyczących 8 związków z grupy soli organicznych typu D-?-A+ X- składających się z organicznego kationu alkilochinoliniowego (akceptor elektronów A+) połączonego przez system elektronów ? z grupą N,N-dialkiloanilinową (donor elektronów D) oraz nieorganicznego anionu jodkowego (X-). Oceniono wpływ polarności środowiska na właściwości spektroskopowe takich soli użytych jako sondy fluorescencyjne. Zarejestrowano widma absorpcji i fluorescencji w rozpuszczalnikach różniących się polarnością: tetrahydrofuranie (THF) i dimetyloformamidzie (DMF). Zbadano zmiany następujące w widmach fluorescencyjnych tych związków w toku termicznie inicjowanej polimeryzacji metakrylanu metylu, określając w ten sposób ich przydatność do monitorowania przebiegu procesu polimeryzacji w charakterze sond fluorescencyjnych. W celach porównawczych wprowadzono przy tym względny parametr nazwany czułością sondy.

EN

The results of investigations concerning the organic salts compounds of D-?-A+X- type consisting of organic alkylquinolinium cation (electron acceptor A+), bonded via ? electrons system with N,N-dialkylaniline group (electron donor D), and inorganic iodide anion (X-) (Table 1) were discussed. The effect of environment polarity on the spectroscopic properties of such salts used as fluorescent probes was evaluated. Absorption (Fig. 1) and fluorescence spectra (Fig. 2-4) in the solvents differing in polarity: tetrahydrofuran (THF) and dimethylformamide (DMF) were recorded. The changes in the fluorescent spectra of the compounds tested during thermally initiated methyl methacrylate polymerization (Fig. 5-7) were investigated. This way their usability for polymerization process monitoring, as fluorescent probes, has been determined. Comparatively, a relative parameter called probe sensitivity (Table 2) was introduced.

12

Sondy fluorescencyjne jako narzędzie badawcze w chemii polimerów

Pączkowski J.

Polimery

|

2005

|

T. 50, nr 7-8

520-529

PL

W artykule przeglądowym przedstawiono typy sond fluorescencyjnych oraz ich zastosowania w badaniach właściwości polimerów w fazie stałej i kinetyki polimeryzacji. Omówiono budowę oraz właściwości fotofizyczne pięciu typów sond fluorescencyjnych wykorzystujących: powstawanie ekscymerów [wzór (I)], podwójną fluorescencję (twisted intramolecular charge transfer - TICT), wewnątrzcząsteczkowe przeniesienie elektronu (ICT) {w tym sondy "Fluoroprene" [wzór (II)] oraz na podstawie 9-akrydynowych pochodnych amin aromatycznych [wzory (III)-(IV)]}, sole organiczne [wzory (VII) i (VIIII), schemat A] i zdolność przekazywania energii pomiędzy fluorescencyjnymi cząsteczkami.

EN

In the review the types of fluorescent probes and their applications in investigations of properties of solid phase polymers and polymerization kinetics are presented. There are described the structures and photo-physical properties of five types of fluorescent probes, using: excimers' formation [Formula (I)]; twisted intramolecular charge transfer (TITC); intramolecular charge transfer (ITC) (including probe "Fluoroprene" [Formula (II)]; and based on 9-acridine derivatives of aromatic amines [Formulas (III)-(IV)] or organic salts [Formulas (VII) and (VIII), Scheme A]; and using an ability of energy transfer between fluorescent molecules.