Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Application of active contours with expert knowledge to heart ventricle segmentation

Tomczyk A.

Journal of Applied Computer Science

|

2013

|

Vol. 21, nr 2

181--194

EN

Automatic heart ventricle segmentation in CT heart images can be an element of system supporting pulmonary embolism diagnosis. To solve that problem in this paper an application of two classical active contour models, snakes and geometric active contours, is proposed. The prepared implementation uses the unified model of those techniques which allows to define forces acting upon a contour only once. The nature of the images causes that the process of force construction requires additional expert knowledge since using only the information visible in the image satisfactory results cannot be obtained.

2

Application of active region model for detection of liver cancer

Tracz P., Szczepaniak P. S., Tomczyk A.

Journal of Medical Informatics & Technologies

|

2011

|

Vol. 17

263--268

EN

Active region models are methods for automatic image segmentation. The models are able to detect shapes of irregular borders. In the present paper, the method is examined using medical images of liver changed locally by cancer cells.

3

Modelowanie linii krawędziowych powierzchni na podstawie danych skaningu laserowego

Borkowski A.

Archiwum Fotogrametrii, Kartografii i Teledetekcji

|

2007

|

Vol. 17a

73--82

PL

W wielu zastosowaniach istotnym elementem jest informacja o położeniu linii krawędziowych powierzchni. Skanowanie laserowe, zarówno z pokładu samolotu jak i naziemne, jest źródłem szczegółowej informacji o skanowanej powierzchni. Źródłowa informacja ma postać zbioru punktów {x, y, z} o nieregularnym rozkładzie w płaszczyźnie xy i dużym zagęszczeniu, od kilku punktów, w przypadku lotniczego skaningu laserowego do tysiąca punktów na metr kwadratowy w przypadku skanowania naziemnego. Duże zagęszczenie informacji punktowej pozwala na modelowanie (w postaci wektorowej) linii krawędziowych powierzchni. W pracy przedstawiono algorytm modelowania linii krawędziowej, jako linii przecięcia dwóch powierzchni. Zakładając aproksymacje danych skaningu laserowego po prawej i lewej stronie modelowanej linii krawędziowej funkcja postaci z1 = f1(x,y) i z2 = f2(x,y) odpowiednio, zadanie wyznaczenia w postaci wektorowej krzywej przecięcia [x(s), y(s), z(s)]T, gdzie s jest bieżącym parametrem długości krzywej, powierzchni z1 i z2 sprowadza sie do wyznaczenie rzutu tej krzywej na płaszczyznę xy. Wysokość z zostanie wyznaczona po wstawieniu współrzędnych {x,y} zrzutowanej krawędzi do któregoś z równań powierzchni. W prezentowanym algorytmie przebieg linii krawędziowej w płaszczyźnie xy wyznacza sie z wykorzystaniem metody aktywnych konturów (snakes), przy czym energia zewnętrzna w modelu snakes zdefiniowana jest jako proporcjonalna do odległości pomiędzy obydwoma powierzchniami w aktualnym położeniu aktywnego konturu. Jako funkcje aproksymująca, fi(x,y), i=1,2, wykorzystano w pracy funkcje sklejana o minimalnej krzywiznie (thin plate spline). Prezentowany algorytm zastosowano do danych rzeczywistych. Dokładność modelowania linii krawędziowych oszacowano na podstawie bezpośrednich pomiarów terenowych.

EN

The location of edge lines is a key issue for numerous applications. Laser scanning, airborne as well as terrestrial deliver information about scanned surfaces. Source information has the character of a set of points {x, y, z} with irregular xy plane distribution. In case of using airborne laser scanners, the density of points per square meter ranges from a few points to thousand points, when using terrestrial laser scanners. The great density of discrete information allow to model (as a vector) the edge lines of the surfaces. In the present study, the algorithm for modeling edge lines as an intersection of two surfaces was presented. These surfaces were approximated from laser scanning data using the z1=f1(x,y) and z2=f2(x,y) functions (adequate on left and right side of edge line). The task of determination a vector [x(s), y(s), z(s)]T (intersection curve), where s parameter of curve length were solved as projection of the curve onto plane xy. Height z was calculated after substitution of {x,y} coordinates in equation of any surface. In the algorithm presented, the plane xy location of edge line was determined using active contour (snakes) method. The external energy of snakes model was defined proportional to the distance between both surfaces of actual place of active contour. In the present paper, thin plate spline functions were chosen as a function fi(x,y), i=1,2 of approximation. The algorithm presented was tested with real data. The accuracy of edge line modeling was estimated based on direct field measurements.

4

Realizacja operatora odsunięcia kartograficznego za pomocą aktywnych funkcji sklejanych - test metody

Borkowski A., Lipski R.

Acta Scientiarum Polonorum. Geodesia et Descriptio Terrarum

|

2006

|

Vol. 5, nr 1-2

3-15

PL

Jednym z operatorów graficznej generalizacji kartograficznej jest operator odsunięcia, wykorzystywany do rozwiązywania na mapie sytuacji konfliktowych, w których obiekty nie są dostatecznie rozróSnialne bądź zachodzą na siebie. Konflikty te można rozwiązać w oparciu o zasadę minimalizacji energii, na której bazują aktywne modele krzywych. W pracy przedstawiono sposób implementacji operatora odsunięcia za pomocą algorytmu snakes. Oceny jakościowej i ilościowej rezultatów dokonano z wykorzystaniem istniejących map topograficznych. Określono różnice w położeniu i kształcie geometrycznym obiektów względem ich odpowiedników na mapach topograficznych.

EN

One of the graphical generalization operators is displacement operator applied in solving proximity conflicts on maps where objects are not explicitly distinguished or where the objects overlap. Such conflicts may be solved on the strength of energy minimization rule on which active curve models are based. In this paper the method of displacement operator implementation by means of snakes algorithm has been presented. Results quality and quantity evaluation was made by using existing topographic maps. Geometrical shape and location between objects and their equivalents on topographic maps were discriminated.

5

Modelowanie powierzchni terenu zawierającej linie nieciągłości na podstawie danych skaningu laserowego

Borkowski A.

Archiwum Fotogrametrii, Kartografii i Teledetekcji

|

2003

|

Vol. 13b

307--314

PL

Wzrost rozdzielczości techniki skaningu laserowego w ostatnich latach pozwala na modelowanie linii nieciągłości powierzchni terenu na podstawie informacji punktowej. W pracy przedstawiono metodę aproksymacji powierzchni będącą rozwiązaniem zadania wariacyjnego (uogólnienie techniki snake), w którym minimalizowana jest energia wewnętrzna powierzchni i zewnętrzna opisująca defekt danych. Energia wewnętrzna opisuje nachylenie i naprężenie powierzchni i jest sumą składowych gradientu i krzywizny powierzchni. Poszczególne składniki energii wewnętrznej są wzajemnie ważone za pomocą swobodnych parametrów, poprzez które możliwe jest lokalne modelowanie właściwości geometrycznych powierzchni. Zadanie wariacyjne rozwiązano metoda Ritza z funkcją bazową typu Gaussa. Parametry modelowanej powierzchni otrzymuje się z rozwiązania układu równań liniowych. Podano przykład modelowania danych skaningu laserowego.

EN

The resolution increase of the laser-scanning technique within the last few years enables on modeling of terrain discontinuities considering only discrete information. In the paper there has been presented the method of surface approximation which was a solution of variational principle (generalization of the snakes technique) where the internal – and external energy of surface describing the data defect are minimized. The internal energy describes an inclination and tension of surface and presents a sum of gradient and curvature components. Particular components of internal energy have been weighted by the use of free parameters enabling a modeling of geometrical properties of surface. The variational problem has been solved by the use of the Ritz method with the base Gaussian-type function. Parameters of modeled surface are obtained by solving the linear equations system. Furthermore, a modeling example of laser-scanning data has been presented.

6

On the segmentation of the Comet Assay images

Smolka B., Szczepański M., Świerniak A., Palus H., Plataniotis K. N.

Journal of Medical Informatics & Technologies

|

2001

|

Vol. 2, Part. 1

MI29--MI39

EN

The single cell gel electrophoresis, called Comet Assay is a microelectrophoretic technique of direct visualization of DNA damage at the cell level. In the comet assay, the cells suspended in an agarose gel on a microscope slide are subjected to lysis, unwinding of DNA and electrophoresis. After staining with fluorescent DNA binding dye, cells with DNA damage display increased migration of genetic material from the cell nucleus. Under the influence of weak, statics electric field, charged DNA migrates away from the nucleus forming a so called comet. The damage is quantified by measuring the amound of the genetic material, which migrates from the nucleus to form the comet tail. The foremost advantage of the comet assay is that it analyses individual cells, thus allowing the measurement of the heterogeneity of response within a cell population. In this paper we present three novel method of the comet tail and head extraction.