Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Polymers for peptide/protein arrays

Szweda R., Lipowska D., Silberring J., Dworak A., Trzebicka B.

Polimery

|

2015

|

T. 60, nr 2

75--86

EN

Peptide and protein arrays have gained increasing attention due to their potential application in many areas of research, clinical diagnosis, and pharmacy. A typical array consists of asupport containing immobilized peptides or proteins positioned in an addressable format. The greatest advantage of the arrays is the possibility for miniaturization, which relies on dividing the surface into miniature spots, thus allowing for hundreds/thousands of analyses to be simultaneously performed using minimal amounts of aprecious biological material. The quality of assays with the use of peptide and protein arrays depends on the surface properties, e.g., hydrophilicity, homogeneity, density of functional groups, surface morphology, etc. In recent years, it was shown that the quality of the assays might be improved by introducing polymers acting as spacers between the peptide and the solid support. This approach causes changes in the surface properties, e.g., it reduces the undesirable non-specific adsorption of biomolecules, increases the density of functional groups, or can improve the biological activity of biomolecules attached to the surface. In this review, various types of polymers that are used for peptide and protein arrays and their impact on the assay quality are discussed.

PL

Peptydy lub białka naniesione w regularnych, uporządkowanych pozycjach na nośnik stały tworzą tzw. macierze. Układy takie wzbudzają coraz większe zainteresowanie, ponieważ można je wykorzystywać do prowadzenia analiz w biochemii, diagnostyce klinicznej czy farmacji. Największą zaletą macierzy jest możliwość miniaturyzacji. Podział powierzchni macierzy na mikroplamki (mikrospoty) pozwala na wykonywanie do kilkuset analiz jednocześnie z wykorzystaniem minimalnej ilości cennego materiału biologicznego. Jakość analiz przeprowadzanych przy użyciu macierzy peptydowych i białkowych zależy od takich właściwości powierzchni, jak: hydrofilowość, jednorodność, gęstość obsadzenia grupami funkcyjnymi, morfologia, itp. W ostatnich latach wykazano, że można poprawić jakość analiz w wyniku wprowadzenia polimerów między peptyd/białko a podłoże. Polimery zmieniają właściwości powierzchni macierzy, np. redukują niepożądaną adsorpcję biocząsteczek, zwiększają gęstość obsadzenia powierzchni grupami funkcyjnymi lub poprawiają dostępność biocząsteczek związanych z powierzchnią. W niniejszej pracy omówiono różne typy polimerów stosowane do otrzymywania macierzy peptydowych i białkowych oraz ich wpływ na jakość przeprowadzanych analiz.

2

Metody wykrywania i oznaczania GMO. Cz. I. Techniki molekularne - analiza DNA

Słowianek M.

Przemysł Spożywczy

|

2012

|

T. 66, nr 8/9

64-66

PL

Rozwój inżynierii genetycznej doprowadził do wprowadzenia na rynek żywności genetycznie zmodyfikowanej, tzn. żywności zawierającej organizmy genetycznie zmodyfikowane (GMO) lub wyprodukowanej z ich udziałem. Zastosowanie GMO w diecie i rolnictwie budzi obawy i kontrowersje. Dlatego wiele krajów, w tym kraje UE, wprowadziło obowiązek znakowania żywności GM. W związku z tym opracowano wiele metod detekcji i oznaczenia ilościowego GMO w materiale roślinnym oraz w produktach żywnościowych. W artykule opisano metody wykrywania i oznaczania GMO w żywności na poziomie DNA. Wskazano zalety i wady technik takich jak PCR, biosensory, mikromacierze oraz przykłady produktów żywnościowych badanych za ich pomocą.

EN

Development of genetic engineering has led to the launch of GM foods, that means, food containing genetically modified organisms or food produced with their participation. The GMO introduction into diet and agriculture is arousing fears and controversies. Therefore, many countries, including the European Union, require mandatory labeling of GMO derived food. Consequently, a lot of methods for detection and quantification of GMO in the plant material and food products was developed. This paper focuses on methods for detection and quantification of GMO in food on the DNA level. The review describes techniques such as PCR, biosensors and microarrays with their advantages and drawbacks and specific examples of food products examined with their help.

3

Mikromacierze w hematologii : nowe kierunki diagnostyki hematologicznej

Demkow U.

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

|

2012

|

nr 5-6

36--38

PL

Mikromacierze znajdują coraz szersze zastosowanie w biologii, medycynie oraz w diagnostyce. Ważnym kierunkiem badawczo-rozwojowym jest zastosowanie mikromacierzy w diagnostyce hematologicznej, gdzie pozwalają one m.in. identyfikować geny istotne w patogenezie nowotworów hematoonkologicznych czy opracowywać nowe leki na podstawie oceny ekspresji genów w komórkach nowotworowych.

EN

Microarrays are becoming widely used in biology, medicine and diagnostics. An important direction of research and progress is the use of microarrays in the haematological diagnostics, where they allow to identify genes important in the pathogenesis of cancer. They are also useful for the development of new drugs based on the assessment of gene expression in cancer cells.

4

Application of the adaptive noise removal technique to the enhancement of cDNA microarray images

Smolka B., Bieda R.

Journal of Medical Informatics & Technologies

|

2005

|

Vol. 9

131--142

EN

In this paper a novel class of filters designed for the removal of impulsive noise in colour images is presented. The proposed filter family is based on the kernel function which controls the noise suppression properties of the new filtering scheme. The comparison of the new filtering method with the standard techniques used for impulsive noise removal indicates its superior noise removal capabilities and excellent structure preserving properties. The proposed filtering scheme has been successfully applied to the denoising of the cDNA microarray images. Experimental results proved that the new filter is capable of removing efficiently the impulses present in multichannel images, while preserving their textural features.