Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

2 Automatyka / Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie

2 2007

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: kodowanie wokseli

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Metoda segmentacji obrazów mikroskopowych komórek roślinnych znakowanych radiograficznie do wyznaczania poziomu syntezy DNA w jądrach komórkowych

Gocławski J., Sekulska-Nalewajko J., Anioł P.

Automatyka / Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie

2007

T. 11, z. 3

75-87

W artykule przedstawiono algorytm segmentacji autoradiogramów preparatów mikroskopowych komórek korzenia rzodkiewki (Raphanus sativus) wybarwionych metodą Feulgena. Celem segmentacji jest wyróżnienie obszarów skupień znacznika, co daje podstawą do dalszej oceny ilościowej poziomu syntezy kwasu nukleinowego (DNA) w jądrach komórkowych. Tempo namnażania materiału genetycznego może sygnalizować zaburzenia procesu wzrostu roślin powodowane różnymi czynnikami szkodliwymi w środowisku. Badane mikroskopowe obrazy autoradiograficzne są poddawane odwzorowywaniu z przestrzeni koloru RGB do HSV, filtracji medianowej, operacjom morfologicznym i w końcu progowaniu w celu znalezienia obiektów markera i powierzchni jąder komórkowych. Operacje te umożliwiają kompensację nierówności tła i redukcję artefaktów. Zastosowano dwa różne sposoby obróbki w celu wyodrębnienia dużych i małych skupień markera. Proponowany algorytm został zrealizowany w środowisku MATLAB 7 a wyniki segmentacji uzyskane dla serii 10 obrazów autoradiogramów zostały zweryfikowane pozytywnie przez cytologów.

This paper presents the segmentation algorithm for autoradiograms of microscopic slices made of radish (Raphanus sativus) root meristematic cells stained with the Feulgen method. The segmentation purpose is the separation of isotopic marked agglomeration areas, what makes the base for subsequent quantitative discrimination of nucleic acid (DNA) synthesis level. The speed of genetic material multiplication can indicate the distortions of plant growth caused by various factors harmful for the environment. The investigated autoradiographic microscopic images are mapped from RGB to HSV colour space, median filtered, processed by morphological operations and finally thresholded to find the searched marker objects and nuclei surfaces. These operations enable image background equalization and artefact reduction. Two different paths of processing have been applied to extract small and big marker agglomerations. The proposed algorithm has been developed in MATLAB 7 environment and segmentation results for the series of 10 autoradiograms have been positively verified by cytologists.

Detekcja mostów w obrazach 3D prezentujących propagację pęknięć korozyjnych naprężeniowych w stali nierdzewnej

Janaszewski M., Babout L.

Automatyka / Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie

2007

T. 11, z. 3

103-114

Artykuł prezentuje algorytm detekcji mostów w obrazach 3D szczelin reprezentowanych za pomocą zbioru połączonych wokseli. Przy czym most definiowany jest jako fragment materiału o podwyższonej odporności na korozje i naprężenia, co powoduje, że zwykle szczelina po napotkaniu takiego obszaru rozwidla się i łączy po jego ominięciu. Stąd analizując obraz 3D propagacji szczeliny, mosty można traktować jako otwory w obiekcie objętościowym reprezentującym szczelinę. Analiza literatury pokazuje, że zwykle detekcję otworów przeprowadza się przez wyznaczenie szkieletu obiektu, a następnie lokalizację pętli w tym szkielecie, z których każda oznacza występowanie jednego otworu w badanym obiekcie. Niestety ze wzgledu na niespotykaną złożoność badanych przez autorów obrazów najpopularniejsze, znane z literatury algorytmy szkieletyzacji zawodzą. Stąd opracowano specjalny algorytm detekcji otworów oparty na dwóch etapach. Pierwszy polega na zastosowaniu techniki kodowania wokseli, która prowadzi do transformaty obrazu w zbiór klasterów - gdzie klaster jest zbiorem połączonych wokseli. Wygenerowany zbiór klasterów ułatwia analizowanie topologii badanego obiektu. W drugim etapie algorytm analizuje każdy klaster w poszukiwaniu tych, które determinują wystąpienie jednego bądź wielu otworów. Algorytm przetestowano na kilku obrazach prezentujących propagację szczeliny korozyjnej naprężeniowej w próbkach stali nierdzewnej. Ponadto w artykule zaprezentowano dyskusję otrzymanych rezultatów oraz propozycje przyszłych prac badawczych.

This paper presents an algorithm to identify bridges in 3D objects represented with a set of connected voxels. The notion of a bridge can be defined as a part of a material with higher resistance to stress corrosion. Therefore if a crack meets a bridge it splits itself into two branches, which surround the bridge and merge when it finishes. Thus from the 3D image analysis point of view a bridge can be treated as a hole in a volumetric object which represents a crack. The literature analysis shows that usually detection of holes is carried out based on the object skeleton and localization of loops in the skeleton as each loop implies occurrence of a hole. Unfortunately, due to unprecedented complexity of tested images, commonly used skeletonization algorithms fail. Therefore authors decided to construct a new algorithm of whole detection which consists of two stages. The first one lies in the application of a voxel coding technique to make a transformation of an object into a set of clusters, where a cluster is a set of connected voxels. The set of clusters gives important information about the object topology. In the second step the algorithm extracts and analyses clusters to detect holes. The algorithm was satisfyingly tested on several 3D crack images from a stress corrosion cracking experiment on a stainless steel sample. The discussion of obtained results and propositions for future works are also included in the paper.