Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: horizontal gene transfer

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Bakteriofagi jako kluczowy element w regulacji liczebności, zmienności i bioróżnorodności bakterii

Sitek R., Kowalczewska Z., Sosnowska E., Markwitz P., Drulis-Kawa Z.

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

2018

nr 4

48--54

Bakteriofagi (wirusy infekujące bakterie) są najliczniejszą grupą cząstek biologicznych w środowisku, wpływającą na bioróżnorodność i liczebność bakterii oraz obieg materii organicznej. Pomiędzy fagami a bakteriami występuje relacja drapieżnik – ofiara (pasożyt – żywiciel), która warunkuje zachowanie równowagi w populacjach bakterii zamieszkujących daną niszę ekologiczną, jak również generuje zmienność bakterii poprzez horyzontalny transfer genów. Rosnąca oporność bakterii na antybiotyki spowodowała wzrost zainteresowania fagami jako środkami terapeutycznymi. Zastosowanie w leczeniu znaleźć mogą zarówno same fagi, jak i ich enzymy (lizyny i depolimerazy).

Bacteriophages (viruses that infect bacteria) are the most abundant biological particles in the environment, impacting bacterial number and biodiversity as well as participating in the circulation of organic matter. There is a predator – prey (parasite – host) relation between phages and bacteria, which determines the balance in bacterial populations living in a given ecological niche as well as drives the evolution of bacteria by horizontal gene transfer. The growing antibiotic resistance in bacteria has caused an increasing interest in bacteriophages as therapeutic agents. Both phages and their enzymes (lysins and depolymerases) may be used for treatment.

H-trees: a Model of Evolutionary Scenarios with Horizontal Gene Transfer

Górecki P.

Fundamenta Informaticae

2010

Vol. 103, nr 1-4

105-128

In this paper, we present a model of evolution of genes in the context of evolution of species. The concept is based on reconciliation models. We assume that the gene evolution is modeled by macro-evolutionary events like gene duplications, losses and horizontal gene transfers (HGTs) while the evolution of species is shaped by speciation events. We define an evolutionary scenario (called an H-tree) which will represent the common evolution of genes and species. We propose a rewrite system for transforming the scenarios. We prove that the system is confluent, sound and strongly normalizing. We show that a scenario in a normal form (that is, non-reducible) is unique and minimal in the sense of the cost computed as the total number of gene duplications, losses and HGTs (mutation cost). We present a classification of the scenarios and analyze their hierarchies.