PL
 |
EN
Preferencje help
Polish version English version Język
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników

Znaleziono wyników: 10

Liczba wyników na stronie
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
Wyniki wyszukiwania
Wyszukiwano:
w słowach kluczowych:  genom
help Sortuj według:

help Ogranicz wyniki do:
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
1
Object oriented representation and processing of genomic data in relational database
Pelikant A.
Studia Informatica
|
2017
|
Vol. 38, nr 4
41--55
EN
The article shows a method of storing genomic data as the object in the relational database server. It presents a method of source data migration which is stored in the weakly determined text files on ftp servers. What is more, it describes the formal structure of the Common Language Runtime (CLR) class used to define user data type. Implementations of compulsory and optional methods are also presented. Furthermore, the paper shows a set of implemented matching algorithms and methods of using them to build adherence matrix. Finally, the paper – presents some efficiency tests which prove the advantages of the proposed algorithms.
PL
Artykuł prezentuje sposób zapisu danych opisujących genom w postaci obiektu składowanego w relacyjnym serwerze baz danych. Pokazano metodę migracji danych wejściowych, składowanych w postaci słabo zdeterminowanych plików tekstowych, a dostępnych na serwerach ftp. Opisano formalną konstrukcję obiektu z zastosowaniem CLR oraz implementacje metod obligatoryjnych i fakultatywnych. Przedstawiono oprogramowane algorytmy dopasowania oraz omówiono sposób ich wykorzystania do budowy macierzy przystawania. Artykuł zawiera wyniki kilku testów wydajnościowych potwierdzających zalety proponowanych metod.
2
Zastosowanie NGS i GWAS w diagnostyce i prognozowaniu chorób hematologicznych
Pierzyna-Świtała M., Sędek Ł.
Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski
|
2017
|
nr 9-10
22--27
PL
W ostatnich latach obserwujemy gwałtowny rozwój diagnostyki laboratoryjnej w kierunku diagnostyki spersonalizowanej. W pracy przedstawiono nowoczesne metody molekularne, ich praktyczne zastosowanie we współczesnej diagnostyce chorób hematologicznych oraz perspektywy wykorzystania tych metod w przyszłości.
EN
In recent years we have observed a rapid development of laboratory diagnostics into personalized diagnostics. The article presents modern molecular methods and their practical application in the contemporary diagnostics of haematological diseases, as well as the prospects of their future clinical use.
3
Genotypowanie jako przykład diagnostyki molekularnej
Szweda N., Włodek A.
Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski
|
2016
|
nr 9-10
28--31
EN
Research carried out by molecular diagnostics is extremely precise. It allows for the early detection of specific pathogens, which in turn enables to clarify diagnosis and the prompt introduction of the therapeutic treatment. The fast development of molecular diagnostics has made a wide range of molecular techniques available right now. The choice of a technique depends on the analyzed problem (detection, identification, selection, taxonomic studies and phylogenetics). Molecular diagnostic methods can be used either directly or indirectly.
PL
Badania wykonywane metodą diagnostyki molekularnej są niezwykle precyzyjne. Umożliwiają wczesne wykrycie określonych czynników chorobotwórczych, co z kolei pozwala na sprecyzowanie diagnozy i niezwłoczne wprowadzenie działań terapeutycznych. Szybki rozwój diagnostyki molekularnej sprawił, że obecnie dostępny jest szereg technik diagnostycznych. Wybór techniki zależy od analizowanego problemu (wykrywanie, identyfikacja, typowanie, badania taksonomiczne oraz filogeneza). Metody diagnostyki molekularnej mogą być stosowane w sposób bezpośredni oraz pośredni.
4
Filogenetyka molekularna - genom człowieka
Czernicka M.
Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski
|
2014
|
nr 7-8
18--22
PL
Genom człowieka jest źródłem dowodów na zdarzenia na drodze ewolucji molekularnej człowieka. Analiza genomu pozwoliła zidentyfikować zmiany w DNA, które przyczyniły się do rozdziału (specjacji) linii człowieka i szympansa około 5 milionów lat temu. Genomika porównawcza to narzędzie pozwalające na wyjaśnianie ewolucyjnej historii chromosomów i genów oraz poznanie organizacji ludzkiego genome.
EN
The human genome develops evidences for molecular events in human evolution. Genome analysis allowed to discover changes in human DNA which contributed to the evolution of human features after separation of the lineages of human and chimpanzee about 5 millions years ago. The comparative genomics is tool for clarifying the evolutionary history of chromosomes, genes and exploiting changes in the human genome organization.
5
Spektrometria mas w badaniach z dziedziny biologii systemów
Stobiecki Maciej
Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski
|
2012
|
nr 11-12
51--53
PL
Szybki rozwój genomiki obserwowany w ostatnim dziesięcioleciu ubiegłego wieku umożliwił przystąpienie do realizacji nowych projektów związanych z odczytem informacji genetycznej zapisanej w sekwencjach kwasów nukleinowych (genomach) organizmów modelowych. Najczęściej metodami instrumentalnymi stosowanymi z wyboru do prowadzenia identyfikacji białek i metabolitów są techniki spektrometrii mas. Zastosowanie całościowego (holistycznego, nie analitycznego) podejścia do badań nad organizmami pozwoliło na rozpoczęcie badań zgodnie z koncepcją biologii systemów.
EN
Fast developments in the field of genomics observed in the last decade of the previous century allowed realization of new projects based on deciphering of genetic information annotated in nucleic acids sequences (genomes) of model organisms. In this field the most often applied instrumental methods for protein and metabolites identification are mass spectrometric techniques. Application of holistic approach for analysis living organisms permitted to start investigations accordingly with systems biology concept.
6
Techniki sekwencjonowania jako nowej generacji analityka w omice
Szymańska S., Studzińska S., Pareek Ch. S., Buszewski B.
Analityka : nauka i praktyka
|
2012
|
nr 3
27--36
PL
Sekwencjonowanie pozwala na ustalenie kolejności nukleotydów i wymaga dalszych analiz dających możliwości wyciągania inspirujących wniosków pozwalających na odkrycia mogące mieć kluczowe znaczenie podczas walki z chorobami cywilizacyjnymi ludzkości.
7
Content available Automatyczna anotacja genomu jako narzędzie biologii systemów
Bizukojć M.
Inżynieria i Aparatura Chemiczna
|
2009
|
Nr 3
25-27
PL
W pracy przedstawiono metodę analizy metabolizmu organizmów polegającą na rekonstrukcji sieci metabolicznej na podstawie całkowicie lub częściowo zsekwencjonowanego genomu. Analizę tę przeprowadzono dla siedmiu gatunków grzybów nitkowych z rodzaju Aspergillus wykorzystując serwer automatycznej anotacji, a jej wyniki porównano z wybranymi danymi fizjologicznymi.
EN
A method based upon the reconstruction of fully or partially sequenced genome to analyse metabolic networks of organisms is presented. This analysis was performed for seven fungal species of genus Aspergillus with the use of automatic annotation server. The results were compared with selected physiological data.
8
Content available remote Bioinformatic environment for analyzing large scale genome sequence
Sarapata K., Sanak M.
Bio-Algorithms and Med-Systems
|
2008
|
Vol. 4, no. 8
25--31
EN
Presented application for large scale genome analysis is useful to test whole chromosomes with Genscan program. Implemented solutions manage with following problems: Genscan program, as context dependent gene seeking program, makes impossible simple division of long sequences into subsequences and simple sum of results , optimization of input subsequences to obtain high level of accuracy with Genscan program, calculation of the longest input subsequences which Genscan can analyze (in comply with hardware limitations). The main result of the work is the ability of scanning large scale sequences to find genes without redundancy error or losses, while analyzing result from dividing ranges. This paper focuses on conditions of using Genscan program. Analyzed sequences came from human genome sequences.
PL
Niniejsza praca prezentuje rozwiązanie informatyczne umożliwiające analizę dużych sekwencji nukleotydowych na poziomie całych chromosomów z wykorzystaniem programu Genscan. Powstałe rozwiązania dotyczą następujących problemów: zastosowanie kontekstowego algorytmu w programie Genscan uniemożliwiającego prosty podział dużych sekwencji na mniejsze i prostego sumowania wyników skanowania, optymalizacja wejściowych subsekwencji dla uzyskania najlepszych rezultatów analizy sekwencji za pomocą programu Genscan ( high levels of accuracy program , wyznaczenie najdłuższej subsekwencji do bezpośredniej i jednokrotnej analizy programem Genscan, wynikającej z ograniczeń sprzętowych. Uzyskanym efektem pracy jest możliwość skanowania dużych sekwencji z zapewnieniem braku redundancji wyników analizy oraz braku utraty danych w miejscach podział u dużej sekwencji. W pracy zwrócono uwag ę na kryteria i warunki zastosowania programu Genscan. Analizowane dane dotyczyły genomu ludzkiego.
9
Zastosowania cyfrowego przetwarzania sygnałów w biologii molekularnej
Izydorczyk J.
Przegląd Telekomunikacyjny + Wiadomości Telekomunikacyjne
|
2002
|
nr 2
92-100
PL
Przedstawiono budowę cząstki DNA oraz własności fizykochemiczne chromosomów bakteryjnych i eukariotycznych. Omówiono metodykę sekwencjonowania DNA. Nakreślono mechanizm ekspresji genów oraz zastosowanie komputerów do poszukiwania genów w poznanych sekwencjach DNA. W szczególności omówiono wykorzystanie dyskretnej transformaty Fouriera w celu wizualizacji własności statystycznych badanych sekwencji DNA, poszukiwania obszarów kodujących białka oraz określenia dla każdego takiego obszaru numeru ramki odczytu.
EN
In the article DNA strain structure is showed with physical and chemical properties of bacteria and eucariota chromosomes. Problem of DNA se- quencing is discussed. Genome expression mechanism is showed with applications of computers to genome investigation. An application of Discrete Fourier Transform to 1) DNA sequence visualization; 2) protein coding DNA regions identification 3) frame number identification is presented.
10
Rola telekomunikacji i informatyki w badaniach genomu ludzkiego
Dudek Z.
Przegląd Telekomunikacyjny + Wiadomości Telekomunikacyjne
|
2001
|
nr 11
767-773
PL
Po krótkim wprowadzeniu do genetyki przedstawiono, w jaki sposób rozkodowano genom ludzki i wskazano rolę telekomunikacji i informatyki w tych badaniach.
EN
After a short introduction to genetics the method of human genome sequencing has been presented and the significance of telecommunication and informatics in these research has been indicated.
first rewind previous Strona / 1 next fast forward last
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.