Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Exploring Baltic Sea cyanobacteria for small-molecule inhibitors of microRNA function: a project description

Brzuzan P., Mazur-Marzec H., Stefaniak F., Woźny M., Florczyk M.

Environmental Biotechnology

|

2018

|

Vol. 14, No. 1

1--4

EN

Cyanobacteria constitute a rich source of biologically active and structurally diverse compounds. The pharmacological potential of these compounds resides among others in their ability to control the proliferation and growth of cancer cell lines and potent disease-causing microbial agents. Despite recent scientific advances, the way these compounds interact with the body’s molecular structure are still unclear and science still has to discover how the cyanobacterial metabolites interact with cell structures and how cells react to them. In this project, we will study yet unexamined cyanobacterial metabolites, especially the compounds which act as chemical ligands for microRNA (miRNA) -binding sites, making them promising regulators (inhibitors) of gene networks that are involved in various diseases. We will first develop a stable cell line that constitutively expresses a unique miRNA reporter system. Then, we will conduct a screen on chemical compounds discovered in Baltic cyanobacteria to identify small molecules with inhibitory activity and specificity to MIR92b-3p, which has a significant impact on liver cell behavior in humans. We assume that a successful MIR92b-3p inhibitor will bind to the precursors of MIR92b-3p miRNA, disabling the action of either of the two processing enzymes involved in the biogenesis of any miRNA in a cell (Drosha or Dicer), thus affecting the MIR92b function. The discoveries made with these inhibitory chemical molecules could provide insight into the role of the MIR92 pathway in liver diseases and cancer, and possibly, if promising results appear, they may facilitate a strategy for treating some human diseases in the future.

2

Application of Biotests in Cyanobacterial Extract Toxicity Assessment

Sierosławska A., Rymuszka A., Skowroński T.

Archives of Environmental Protection

|

2014

|

Vol. 40, no. 3

115--121

EN

The aim of the study was to determine the toxicity of the extract obtained from the cyanobacterial cells derived from the waters of Zemborzycki dam reservoir with use of a battery of biotests. The taxonomic identiﬁcation of the bloom-forming cyanobacteria revealed high abundance of Aphanizomenon ﬂos-aquae and Dolichospermum spp. (Anabaena spp.) and in a lower degree of Microcystis aeruginosa and Planktothrix agardhii. In the extract obtained from concentrated cyanobacterial cells, hepatotoxin microcystin-LR at a concentration of 22.89 ± 3.74 μg/L and neurotoxin Antx-a at 13.02 ± 0.01 μg/L have been detected. Toxicity of the extract was evaluated with the following assays: Daphtoxkit F magna with the crustacean Daphnia magna, Thamnotoxkit F with the crustacean Thamnocephalus platyurus, Rotoxkit F with the rotifer Brachionus calyciﬂorus and Protoxkit F with ciliate Tetrahymena thermophila. The most sensitive organism among all studied was T. platyurus for which EC50 was estimated to be 1.2% of the initial extract concentration. On the basis of the highest obtained value of the toxicity unit (TU = 83) the studied sample was classiﬁed to the IV class, which is of high acute toxicity. Additionally, it was found that reactivity on cyanobacterial products differs greatly among organisms used in bioassays, which indicate the need for using a set of biotests.

PL

Celem pracy była ocena toksyczności ekstraktu uzyskanego z komórek cyjanobakterii obecnych w wodzie pobranej podczas zakwitu sinic z Zalewu Zemborzyckiego, z wykorzystaniem zestawu biotestów. Identyfikacja taksonomiczna wykazała w badanej próbce wysoką liczebność Aphanizomenon fl os-aquae i Dolichospermum spp. (Anabaena spp.) oraz w mniejszym stopniu Microcystis aeruginosa i Planktothrix agardhii. Analiza HPLC ekstraktu uzyskanego z zagęszczonych komórek cyjanobakterii wykazała obecność mikrocystyny-LR w stężeniu 22,89 μg/L oraz anatoksyny-a w stężeniu 13.02 μg/L. Stopień toksyczności uzyskanego ekstraktu oceniano na podstawie reakcji organizmów testowych, z użyciem następujących biotestów: Daphtoxkit F magna (Daphnia magna), Thamnotoxkit F (Thamnocephalus platyurus), Rotoxkit F (Brachionus calyciflorus) oraz Protoxkit F (Tetrahymena thermophila) (Microbiotests Inc., Belgia). Przeprowadzone badania wykazały szczególnie silne działanie toksyczne analizowanego ekstraktu wobec T. platyurus (24hEC50 oszacowane na 1,2% ekstraktu wyjściowego). Wyraźny efekt toksyczny obserwowany był także wobec B. calyciflorus i w mniejszym stopniu wobec T. thermophila. Natomiast największą odporność na toksyczne działanie ekstraktu wykazywała D. magna. Na podstawie uzyskanych wartości TU (jednostek toksyczności) badany ekstrakt zaliczony został do IV klasy toksyczności, tj. o wysokiej toksyczności ostrej. Z przeprowadzonych badań wynika, że organizmy na których wykonywane są testy toksyczności wykazują zróżnicowaną wrażliwość na produkty cyjanobakterii, stąd ocena toksyczności próbek zawierających tego typu substancje powinna być prowadzona z wykorzystaniem jak najszerszego zestawu biotestów.

3

Zagrożenie jeziora Turawskiego zakwitem sinic. Nowe aspekty w walce z cyjanobakteriami

Salejda E., Wolańska A., Tic W.J.

Zeszyty Naukowe. Inżynieria Środowiska / Politechnika Opolska

|

2009

|

Vol. 331, z. 7

7-19

PL

W pracy scharakteryzowano zanieczyszczenia wód śródlądowych pochodzące ze źródeł antropogenicznych i zagrożenia jakie stwarzają dla ekosystemów wodnych. Jednymi z zagrożeń są coraz częstsze zakwity sinicowe. Opisane w pracy działania walki z zakwitami sinicowymi na Jeziorze Dużym w Turawie polegają na zastosowaniu preparatu o nazwie ARMEX 5 zawierający ditlenek chloru jako substancję czynną. Wykazano, że ditlenek chloru w stężeniu powyżej 5 ppm powoduje spowolnienie niepożądanego wzrostu biomasy w badanych próbach wody oraz rozbicie struktur sinic i zmniejsza ich liczebność.

EN

The problem of excessive growth of green algae (Cyanophyta) in Turawa Lake was studied. It was found, that application of chlorine dioxide can effectively restrain undesired development of the algae biomass at ClO2 concentrations over 5 ppm. It was further shown that the applied effective concentration of the studied disinfectant was not harmful for the other higher-organized water organisms.

4

Ozonation-based removal of microcystin from drinking water drawn from the artificial lake of Sulejów, Poland

Kabziński A.K.M., Grabowska H., Cyran J., Juszczak R., Zawadzka A., Szczukocki D.E., Szczytowski K.

Environment Protection Engineering

|

2006

|

Vol. 32, nr 2

17-35

EN

Cyanobacteria can produce toxins and are also responsible for the taste and odour of water, which significantly impairs its quality. Removal of cyanobacterial cells with their intracellular compounds during water treatment not only improves the taste and odour of the treated water, but also reduces the concentration of toxic metabolites. In the present study, the ozonation of water in pretreatment plant near Sulejów artificial lake was tested. The concentrations of MCYST-LR and other isoforms of this hepatotoxin were determined at different steps of the pretreatment process by SPE and RP-HPLC methods.

PL

Sinice mogą produkować toksyny, związki pogarszające smak i dające nieprzyjemny zapach, obniżając w ten sposób jakość wody. Usuwanie komórek sinicowych wraz z ich produktami wewnątrzkomórkowymi w czasie procesu uzdatniania wody zmniejszy stężenie substancji smakowych i zapachowych oraz toksycznych metabolitów w uzdatnianej wodzie. Przedstawiono ozonowanie w stacji wstępnego uzdatniania wody znajdującej się w pobliżu zbiornika zaporowego w Sulejowie. Stężenie MCYST-LR i innych izoform tej hepatotoksyny w wodzie oznaczano techniką RP-HPLC po wstępnym oczyszczaniu i zatężaniu próby metodą SPE.

5

Attempts to eliminate cyanobacterial blooms in Lake Łasińskie

Wiśniewski R.

Environment Protection Engineering

|

2002

|

Vol. 28, nr 1

15-25

EN

In the years 1998-2001, investigations of Łasińskie Małe and Zamkowe Lakes were conducted. The two lakes are shallow and very susceptible to degradation. Very high trophic level, high pollution level and recurring annual cyanobacterial blooms have caused that lakes have not been recreationally used since 1994. The aim of investigations was to work out the programme of reservoirs restoration. In order to test the methods, in June 1998 trials of cyanobacterial bloom inhibition in natural, isolated bath area were undertaken. Main measures were exposure of barley straw bales and addition of FeCl3. After one month considerable changes in the composition of phytoplankton were recorded. The drastic slump in the biomass of Aphanizomenon flos-aquae and domination of eucariotic algae were observed. Water transparency substantially increased. The measures were repeated and the method was modified and developed in the successive years. The main causes of temporarily worse effects were damage of isolating barriers in the bathing area and seasonal increase in BOD5 caused by influx of fine-grained organic suspension from unidentified source.

PL

W latach 1998-2001 prowadzono badania na Jeziorze Łasiński Małym i Jeziorze Zamkowym. Obydwa jeziora są płytkie i bardzo podatne na degradację. Powtarzające się corocznie intensywne zakwity sinicowe stanowią główną przyczynę ograniczonego wykorzystywania rekreacyjnego obydwu zbiorników. Celem badań było opracowanie programu rekultywacji zbiorników. Aby przetestować zaproponowane metody, w czerwcu 1998 r. Podjęto zabiegi zmierzające do ograniczenia zakwitu sinic w rejonie odizolowanego, naturalnego kąpieliska miejskiego. Sprowadzały się one głównie do zastosowania zarówno balotów słomy jęczmiennej, jak i chlorku żelaza. Po miesiącu odnotowano znaczne zmiany w składzie fitoplanktonu. Stwierdzono drastyczny spadek biomasy Aphanizomenon flos-aquae i dominujący udział glonów eukariotycznych. Istotnie wzrosła przezroczystość wody. Prace w rejonie kąpieliska powtarzano w następnych latach, modyfikując i wzbogacając metodę. Powodem gorszych okresowo efektów, zwłaszcza w 2001 r., było rozszczelnienie osłony izolującej kąpielisko i wzrost BZT5 spowodowany dopływami drobnej zawiesiny organicznej z niezidentyfikowanego źródła.