Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: chemoinformatics

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

The log P Parameter as a Molecular Descriptor in the Computer - aided Drug Design - an Overview

Kujawski J., Popielarska H., Myka A., Drabińska B., Bernard M. K.

Computational Methods in Science and Technology

2012

Vol. 18, No. 2

81-88

The computer-aided drug design is an important tool in modern medicinal chemistry. Molecular lipophilicity, usually quantified as log P, is an important molecular characteristic in medicinal chemistry and also in rationalized drug design. The log P coefficient is well-known as one of the principal parameters for the estimation of lipophilicity of chemical compounds and determines their pharmacokinetic properties. This parameter has been measured using known experimental methods, but recently huge progress in determination of log P using computational chemistry methods is observed. The number of methodological publications about lipophilicity predictions has gradually increased over the last ten years, but the number of programs available for an on-line prediction of this important parameter remains limited. This paper presents some of log P prediction methods and very popular programs connected to this topic. The prediction of log P is highly important for the pharmaceutical industry since it limits time-consuming experiments to measure log P required to optimize pharmacodynamic and pharmacokinetic properties of hits and leads. Development of the methods reviewed in this paper concerning log P prediction seems to be a significant tendency in the modern pharmaceutical industry.

EDB – baza danych rozkładów energii potencjalnej białek

Mrozek D., Małysiak-Mrozek B., Kozielski S., Kral K., Moczała M., Oleś Ł., Suwała T., Szecówka A.

Studia Informatica

2009

Vol. 30, nr 2B

163-178

Analiza cech strukturalnych i energetycznych białek może być kluczem do zrozumienia, w jaki sposób białka oddziaływają ze sobą w reakcjach komórkowych. Podczas badania złożonych procesów, w których uczestniczą białka, niezwykle pomocne mogą być rozkłady energii potencjalnej na poszczególnych atomach struktury. Baza Energy Distribution Data Bank (EDB, http://edb.aei.polsl.pl) przechowuje rozkłady energii różnych typów dla struktur białkowych pobranych ze znanej amerykańskiej bazy Protein Data Bank. W niniejszym artykule opisujemy cel zbudowanej przez nas bazy EDB, możliwe sposoby jej wykorzystania w badaniach naukowych, możliwości wyszukiwania właściwej informacji i plany dalszego rozwoju.

The analysis of structural and energy features of proteins can be a key to understand how proteins work and interact to each other in cellular reŹactions. The distributions of energy over each atom in protein structures can be very supportive for the studies of the complex processes proteins are involved in. The Energy Distribution Data Bank (EDB, http://edb.aei.polsl.pl) stores a variety of energy distributions for protein molecular structures retrieved from the well-known Protein Data Bank. In the paper, we describe the purpose of the EDB, a possible use of the information stored in it, query possibilities, and plans for future development.