Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

KIS: An automated attribute induction method for classification of DNA sequences

Biedrzycki R., Arabas J.

International Journal of Applied Mathematics and Computer Science

|

2012

|

Vol. 22, no. 3

711-721

EN

This paper presents an application of methods from the machine learning domain to solving the task of DNA sequence recognition. We present an algorithm that learns to recognize groups of DNA sequences sharing common features such as sequence functionality. We demonstrate application of the algorithm to find splice sites, i.e., to properly detect donor and acceptor sequences. We compare the results with those of reference methods that have been designed and tuned to detect splice sites. We also show how to use the algorithm to find a human readable model of the IRE (Iron-Responsive Element) and to find IRE sequences. The method, although universal, yields results which are of quality comparable to those obtained by reference methods. In contrast to reference methods, this approach uses models that operate on sequence patterns, which facilitates interpretation of the results by humans.

2

Automatyczna anotacja genomu jako narzędzie biologii systemów

Bizukojć M.

Inżynieria i Aparatura Chemiczna

|

2009

|

Nr 3

25-27

PL

W pracy przedstawiono metodę analizy metabolizmu organizmów polegającą na rekonstrukcji sieci metabolicznej na podstawie całkowicie lub częściowo zsekwencjonowanego genomu. Analizę tę przeprowadzono dla siedmiu gatunków grzybów nitkowych z rodzaju Aspergillus wykorzystując serwer automatycznej anotacji, a jej wyniki porównano z wybranymi danymi fizjologicznymi.

EN

A method based upon the reconstruction of fully or partially sequenced genome to analyse metabolic networks of organisms is presented. This analysis was performed for seven fungal species of genus Aspergillus with the use of automatic annotation server. The results were compared with selected physiological data.

3

The proposed encoding scheme for the IPI PAN corpus

Bański P.

Prace Instytutu Podstaw Informatyki Polskiej Akademii Nauk

|

2001

|

Nr 936

1-28

EN

The present report describes the encoding scheme used for the purpose of creating a large annotated corpus of Polish, referred to here as the IPI PAN corpus. The corpus is going to contain at least 75-100 million words, and is going to be annotated structurally and morphosyntactically according to the suggestions laid out in the Corpus Encoding Standard (CES) Guidelines. The report begins with an overview of the existing approaches to corpus encoding, discusses the reasons behind the adoption of the CES, and finishes with a description of the activities to be performed during the process of constructing the IPI PAN corpus.

PL

Praca opisuje standard strukturalnego i morfosyntaktycznego oznaczania tekstu znany jako CES, czyli Corpus Encoding Standard, skupiając się na jego nowoczesnej implementacji w języku XML. Standard ten będzie użyty do oznaczenia dużego korpusu tekstów języka polskiego przygotowanego w Instytucie Podstaw Informatyki PAN w Warszawie, pod kątem zastosowań w inżynierii języka Autor omawia przyczyny wyboru tego właśnie standardu, a w szczególności jego wersji zdefiniowanej w języku XML. Praca kończy się opisem praktycznych czynności, jakie będą wykonane w ramach konstruowania korpusu.