Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: Proteobacteria

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Life in Extreme Habitats : Diversity of Endolithic Microorganisms from Cold Desert Ecosystems of Eastern Pamir

Khomutovska N., Jerzak M., Kostrzewska-Szlakowska I., Kwiatowski J., Suska-Malawska M., Syczewski M., Jasser I.

Polish Journal of Ecology

2017

Vol. 65, nr 4

303--319

The aim of this study was to identify cyanobacteria diversity in rock communities from the cold desert ecosystem in Eastern Pamir Mountains (Tajikistan) and assess if the rock type and rock`s porosity can be indicators of microbial diversity in this extreme environment. Seven samples were collected in July 2015 from hillsides (ca 4000-4500 m a.s.l.) of the Eastern Pamir Mountains. Petrographic and scanning microscopy (SEM) allowed for the characterization of the rocks inhabited by endolithic communities as granite, gneiss and limestone with variable porosity. Based on next-generation sequencing (NGS) of amplicon of V3-V4 hypervariable region of 16S rRNA gene, we established that Actinobacteria, Proteobacteria and Cyanobacteria dominated the endolithic communities of microorganisms in the rocks studied, which distinguishes these communities from those described for other cold arid regions. Chroococcidiopsis and Leptolyngbya were dominant genera in the cyanobacterial communities according to culture-dependent analysis, as well as microscopic analyses of endoliths scraps from the rocks. Culture-independent metagenomic analyses revealed that Microcoleus, Acaryochloris, Chroococcidiopsis and Thermosynechococcus reads were the most abundant from all reads and dominated interchangeably in the samples. Endolithic communities of microorganisms in the rocks from the cold desert shrubland of Eastern Pamir Mts. appear to be diverse and different from communities described for other cold deserts.

Komórki bakterii tworzące biofilmy w systemach wodnych

Berłowska J., Otlewska A., Kręgiel D.

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

2013

nr 11-12

57--60

Do niedawna badania składu gatunkowego złożonych populacji opierały się wyłącznie na tradycyjnych metodach hodowlanych. Zastosowanie nowoczesnej techniki badawczej – metagenomiki – umożliwiło nie tylko ocenę bioróżnorodności mikroorganizmów tworzących konsorcja, ale również analizę zmian zachodzących w wyniku sukcesji. W artykule przedstawiono metody kompleksowej analizy jakościowej, pozwalającej na zbadanie wpływu środowiska na wzrost komórek bakterii w błonach biologicznych oraz ich zróżnicowanie metaboliczne i fizjologiczne.

Until recently, the analysis of phylogenetic structure of consortia based on traditional culture methods. The usage of modern technique – metagenomics, allows not only evaluation of biodiversity of microorganisms in consortia, but also an analysis of the dynamics of bacterial biofilms as a result of succession. In this paper, we described different genetic and biochemical methods suitable to study the impact of environmental conditions on the growth of bacterial cells and their metabolic and physiological diversity in biofilms.