Wyniki wyszukiwania - BazTech

Ograniczanie wyników

2 Studia Informatica

Znaleziono wyników: 2

Liczba wyników na stronie

Wyniki wyszukiwania

Wyszukiwano:
w słowach kluczowych: Gene Ontology

Sortuj według:

Ogranicz wyniki do:

Gene Ontology based gene analysis in graph database environment

Kozielski M., Stypka Ł.

Studia Informatica

2013

Vol. 34, nr 2A

325--336

The article presents evaluation of the application of Neo4j graph database to Gene Ontology graph analysis. Graph-based term similarity measures are calculated in order to assess the effectiveness of the system. Two types of common ancestor search are presented and evaluated, and parallel execution of the analysis is also evaluated.

Artykuł przedstawia ocenę zastosowania grafowej bazy danych Neo4j do analizy grafu ontologii Gene Ontology. Ocena systemu została przeprowadzona na podstawie obliczenia bazujących na analizie grafu miar podobieństwa terminów ontologii. Przedstawione i ocenione zostały dwa sposoby wyszukiwania rodziców w grafie. Analizie poddano również równoległą realizację badanych algorytmów.

Application of binary similarity measures to analysis of genes represented in gene ontology domain

Kozielski M., Gruca A.

Studia Informatica

2012

Vol. 33, nr 2A

543-554

The work presents application of four binary similarity measures to analysis of Gene Ontology data. The measures are analysed and compared with semantic measure calculating term and gene similarity. Two kinds of experiments performed on two gene datasets show that binary similarity measures are valuable and interesting methods for the considered application.

Artykuł przedstawia zastosowanie czterech binarnych miar podobieństwa do analizy danych z ontologii Gene Ontology. Miary są analizowane i porównywane z semantyczną miarą wyznaczającą podobieństwo genów na podstawie podobieństwa terminów ontologii. Przeprowadzone zostały dwa typy eksperymentów na dwóch zbiorach danych o różnej charakterystyce. Eksperymenty te pokazują, że binarne miary podobieństwa są wartościowymi i interesującymi metodami analizy dla opisywanego zastosowania.