Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Zastosowanie przybliżenia hybrydowego B3LYP w badaniu oddziaływań międzycząsteczkowych pomiędzy harmanem a akryloamidem

Kowalska A., Stobiecka A.

Zeszyty Naukowe. Chemia Spożywcza i Biotechnologia / Politechnika Łódzka

|

2007

|

Z. 71

59-69

PL

W niniejszej pracy zastosowano przybliżenie hybrydowe B3LYP w badaniu oddziaływań międzymolekularnych, których wynikiem jest powstanie wiązania wodorowego w układzie 1:1 harman/akryloamid. Obliczono optymalizację geometrii oraz częstotliwości drgań czterech możliwych konfiguracji układu 1:1 harman/akryloamid z wykorzystaniem metody B3LYP/6-31G(d,p). Następnie, dla rozważanych układów obliczono energię stabilizacji z uwzględnieniem poprawki na błąd superpozycji bazy (BSSE) oraz poprawki na energię drgań w temperaturze zera bezwzględnego (ZPVE). Ponadto wyznaczono również entalpię i energię swobodną asocjacji badanych układów. Na podstawie uzyskanych wyników obliczeń wskazano najbardziej stabilną konfigurację kompleksu harman/akryloamid.

EN

In this study the hydrogen bonded interactions between harmane and acrylamide have been investigated using B3LYP/6-31G(d,p) method. Four reasonable geometries of harmane/acrylamide complex have been considered. The equilibrium structures and vibrational frequencies of the interacting systems have been determined. Three stable structures and one structure corresponding to the transition state have been found. Stabilization energies of the molecular systems under study have been estimated taking into account the zero-point vibrational energies (ZPVE) and the basis set superposition error (BSSE) corrections. In addition, some thermodynamical parameters of harmane/ acrylamide complexes have been calculated and the most stable harmane/ acrylamide complex has been found. Finally, the spectroscopic parameters of N-H stretching vibration in the most stable harmane/acrylamide complex have been compared to those corresponding to isolated harmane molecule in order to calculate their shifts due to the hydrogen bond formation.

2

The theoretical study on the molecular structure and electronic properties of harmane

Kowalska A., Stobiecka A.

Zeszyty Naukowe. Chemia Spożywcza i Biotechnologia / Politechnika Łódzka

|

2007

|

Z. 71

13-34

EN

In this study the geometry optimization of harmane using the semi-empirical (AM1, PM3, MNDO,) ab initio HF as well as the B3LYP method was performed. The calculated geometrical parameters of harmane were compared with the available crystallographic data to verify the extent to which theoretical models approximate the molecular structure of this compound. Additionally, some electronic properties of harmane in the neutral and monocationic form were calculated using various theoretical methods. The semi-empirical ZINDO-1 and TD/B3LYP calculations were carried out using the B3LYP/6-31+G(d,p) optimized geometry of harmane. The utility of the applied methods to predict properties of electronic transitions to the lowest excited singlet states of harmane was discussed.

PL

W pracy obliczono optymalizację struktury elektronowej harmanu z wykorzystaniem różnych metod obliczeniowych, tj. metod semi-empirycznych (AM1, PM3, MNDO), metody Hartree-Focka, jak również metody B3LYP. W celu sprawdzenia dokładności i użyteczności wyżej wymienionych metod teoretycznych w przewidywaniu struktury badanej ß-karboliny obliczone parametry strukturalne harmanu porównano z dostępnymi w literaturze danymi krystalograficznymi. Następnie obliczono wybrane właściwości elektronowe neutralnej oraz kationowej formy harmanu. Uzyskaną z obliczeń wartość różnicy energii orbitali HOMO i LUMO, którą można traktować jako przybliżoną energię przejścia do najniższego stanu singletowego cząsteczki, porównano z uzyskaną z eksperymentu wartością energii wzbudzenia harmanu. Spośród wykorzystanych w pracy metod obliczeniowych, zastosowanie metody B3LYP z użyciem bazy 6-31+G(d,p) pozwoliło na uzyskanie zadowalającego opisu właściwości strukturalnych i elektronowych harmanu. Dlatego też uzyskaną za pomocą tej metody strukturę elektronową harmanu wykorzystano do obliczeń energii przejść elektronowych cząsteczki. Obliczone metodą ZINDO-1 oraz TD B3LYP energie przejść elektronowych porównano z energią przejść elektronowych odpowiadającym odpowiednim pasmom w widmie absorpcji neutralnej oraz kationowej formy harmanu.

3

Theoretical Determinations of Ionization Potential and Electron Affinity of Gaseous alfa-Alanine

Lu J., Zhu S., Zhou Z., Wu Q., Zhao G.

Polish Journal of Chemistry

|

2006

|

Vol. 80, nr 3

471-481

EN

Adiabatic (vertical) ionization potential (IP) and valence electron affinity (EA) of gaseous alfa-alanine have been determined by density functional theory (B3LYP), ab initio Hartree-Fock (HF) calculations and ab initio third order algebraic diagrammatic construction [ADC(3)] Green function method with the 6-311++G** and 6-311G** basis sets, respectively. Eighteen possible conformers of alfa-alanine and its charged states have been optimized, employing density functional theory (B3LYP) with 6-311++G** and 6-311G** basis sets, respectively. In the gas phase, the IPs of all alfa-alanine calculated have positive values and all the EAs are negative, except for VEA2 (+0.555 eV) of 6A, which indicates that all anions except for 6A- are unstable with respect to electron autodetachment vertically and adiabatically. All kinds of chemical quantities, associated with the IP and EA, such as electronegativity, chemical potential, chemical hardness, and chemical softness, have also been determined. Finally, we also report the infrared spectrum frequencies and vibrational modes for neutral states of alfa-alanine 1A, 2A, 3A, 5A and their optimized cationic and anionic states in seven highest frequency regions, and analyzed the relationship between the vibrational frequencies when receiving or donating an electron.

4

A Model of Formic Acid Pyrolysis in the Gas Phase Based on harmonic Mode Analysis

Shi Y., Zhou Z., Gong X., Zhou X.

Polish Journal of Chemistry

|

2004

|

Vol.78 /nr 11-12

2185-2195

EN

Mechanism of the thermal decomposition of formic acid in the gas-phase catalyzed by water or water dimer is proposed by vibrational mode analysis. The barrier heights for both dehydration and decarboxylation reactions are revealed to be significantly lower than previously reported values, implying the importance of the catalytic effect of H2O and (H2O)2 at the B3LYP/6-311G(d,p) level. The relationships of the intermediates, transition states and products are elucidated by the vibrational mode and vibrational frequencies. We used different methods to calculate the energy of all the species in order to further elucidate our calculations.