Wykorzystanie bioinformatyki w biotechnologii

• Autorzy: Dobrowolska A.

Warianty tytułu

EN

The application of bioinformatics in biotechnology

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Dynamiczny rozwój bioinformatyki umożliwia zarówno planowanie badań biologicznych, jak i ich wielokierunkową analizę. Wykorzystanie komputerowych baz danych oraz specjalistycznych programów komputerowych stanowi obecnie podstawę rozwoju wielu współczesnych dziedzin biologii, w tym m.in. genetyki molekularnej. Bioinformatyka stanowi pomocne narzędzie w poznaniu struktury, mechanizmów działania i współdziałania genów. W opisywanej pracy sekwencje nukleotydowe genów plazmidu binarnego pCAMBIA1303, dostępne w bazie danych (www.ncbi.nlm.nih.gov), stanowiły podstawę dla zaprojektowania pary starterów będących matrycą dla syntezy genu fuzyjnego, kodującego stafylokinazę (sak) pochodzenia prokariotycznego. Startery zostały wykorzystane do amplifikacji genu fuzyjnego CaMV::sak-gusA-mgfp w metodzie PCR. Produkty amplifikacji analizowano, wykorzystując program komputerowy Analysis (Gerany Soft Imaging System GmbH). Wektor pCAMBIA1303sak zastał wykorzystany do transformacji siewek tytoniu.

EN

The dynamic development of bioinformatics enables both the planning of biological research and its multidirected analysis. The application of computer databases and specialised computer programmes is the basis for the development of many contemporary biological disciplines, including molecular genetics. Bioinformatics seems to be the tool neccesary to study the structure of genes, their mechanisms of operation, and their cooperation. In this research, the nucleotide sequence of the binary plazmid pCAMBIA1303 genes available in the database, (www.ncbi.nlm.nih.gov) were the basis to design the pair of primers for the synthesis of desirable fusion gene construct with prokaryotic stafylokinase gene in PCR method. The primers were used for the amplification of fusion gene construct CaMV::sak-gusA-mgfp. The products of amplification were analyzed by Analysis software (Gerany Soft Imaging System GmbH). The pCAMBIA1303sak vector was used for tobacco seedling transformation.

Słowa kluczowe

PL

genetyka; pCAMBIA; PCR

EN

genetics; pCAMBIA; PCR

• Wydawca: Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum ; Index Copernicus Sp. z o.o.
• Czasopismo: Bio-Algorithms and Med-Systems
• Rocznik: 2005
• Tom: Vol. 1, no. 1/2
• Strony: 111--112
• Opis fizyczny: Bibliogr. 5 poz.

Twórcy

autor

Dobrowolska A.

• Katedra Technologii Fermentacji i Mikrobiologii Technicznej Akademii Rolniczej w Krakowie

Bibliografia

• 1. Baxevanis A. D., Ouellette B. F. F.: Bioinformatyka, PWN, Warszawa 2004.
• 2. Dobrowolska A., Kononowicz A. K.: Expression of a CaMV: sak-gusA-mgfp in tobacco plants, World Journal of Microbiology & Biotechnology, 20: 333-335, 2004.
• 3. Giddings G.: Transgenic plants as factories for biopharma-ceuticals, Nature Biotechnology, 1, 18: 151-1155, 2000.
• 4. Malepszy S.: Biotechnologia roślin, PWN, Warszawa 2002.
• 5. Riva de la G. A., Gonzalez-Cabrera J., Vazquez-Padron R., Ayrapardo C.: Agrobacterium tumefciens : a natural tool for plant transformation, Electronic Journal of Biotechnology, 1: 1-16, 1998.