Badania metabolomiczne - zastosowanie chromatografii jonowej i technik pokrewnych

Michalski, Rajmund; Pecyna-Utylska, Paulina; Kernert, Joanna

Artykuł - szczegóły

Tytuł artykułu

Badania metabolomiczne - zastosowanie chromatografii jonowej i technik pokrewnych

Autorzy

Michalski Rajmund , Pecyna-Utylska Paulina , Kernert Joanna

Identyfikatory

Warianty tytułu

Metabolic studies - the use of ion chromatography and related techniques

Języki publikacji

Abstrakty

Metabolomika wraz z proteomiką, transkryptomiką i genomiką zajmuje się badaniami złożonych oddziaływań zachodzących w systemach biologicznych, co umożliwia uzyskanie pełniejszego obrazu funkcjonowania organizmów żywych. Oznaczanie substancji organicznych i nieorganicznych (w tym jonowych), szczególnie w próbkach o złożonej matrycy, wymaga stosowania odpowiednich metod i technik analitycznych. Najnowsze trendy w tym zakresie dotyczą technik łączonych, w których metody separacyjne łączone są z różnymi metodami detekcji, najczęściej spektroskopowymi. Znajdują one zastosowania m.in. w: biochemii, geologii, medycynie, farmacji czy kontroli jakości produktów żywnościowych. Jedną z nich, szczególnie użyteczną w zakresie badań substancji jonowych, jest chromatografia jonowa i jej odmiany. W pracy przedstawiono możliwości ich zastosowań w badaniach metabolomicznych.

Metabolomics, along with proteomics, transcriptomics and genomics, studies complex interactions that occur in biological systems, which enables to obtain a more complete representation of living organisms. The determination of organic and inorganic (including ionic) substances, especially in samples with a complex matrix, requires the use of suitable analytical techniques. The latest trends in this area relate to hyphenated techniques in which separation methods are combined with different detection methods, most often spectroscopic ones. They are used e.g. in biochemistry, geology, medicine, pharmacy, or the quality control of food products. One of them, which is especially useful in the field of ionic substance research, is ion chromatography, along with related techniques. The paper presents the possibilities of their applications in metabolomic research.

Słowa kluczowe

biologia systemowa metabolomika chromatografia jonowa badania

systems biology metabolomics ion chromatography research

Wydawca

ELAMED Media Group

Czasopismo

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

Rocznik

2019

Tom

nr 1

Strony

48--52

Opis fizyczny

Bibliogr. 24 poz., rys.

Twórcy

autor

Michalski Rajmund

Instytut Podstaw Inżynierii Środowiska PAN, Zabrze

autor

Pecyna-Utylska Paulina

Instytut Podstaw Inżynierii Środowiska PAN, Zabrze

autor

Kernert Joanna

Instytut Podstaw Inżynierii Środowiska PAN, Zabrze

Bibliografia

1. Zhang A. i wsp.: Modern analytical techniques in metabolomics analysis. „Analyst”, 2012, 137 (2), 293-300.
2. Kraj A., Drabik A., Silberring J.: Metabolomika i proteomika. WUW 2010, wyd. 1.
3. Jorge T.F. i wsp.: Mass spectrometry-based plant metabolomics: Metabolite responses to abiotic stress. „Mass Spectrom. Rev.”, 2016, 35 (5), 620-649.
4. Błażewicz A. i wsp.: Alterations of hair and nail content of selected trace elements in nonoccupationally exposed patients with chronic depression from different geographical regions. „Biomed. Res. Int.”, 2017.
5. Misra B.B.: New tools and resources in metabolomics: 2016-2017. „Electrophoresis”, 2018, 39 (7), 909-923.
6. Dereziński P.: Proteomiczna i metabolomiczna analiza surowicy krwi i moczu w poszukiwaniu biomarkerów raka prostaty – rozprawa doktorska. Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu, Wydział Farmaceutyczny, Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej, Poznań 2015.
7. Rojo D., Barbas C., Rupérez F.J.: LC-MS metabolomics of polar compounds. „Bioanalysis”, 2012, 4 (10), 1235-1243.
8. Błażewicz A. i wsp.: Iodine in autism spectrum disorders. „J. Trace Elem. Med. Bio.”, 2016, 34, 32-37.
9. Wang Z. i wsp.: Chronic exposure to aluminum and risk of Alzheimer’s disease: A meta-analysis. „Neurosci. Lett.”, 2016, 610, 200-206.
10. Strączyński G., Ligor T.: Comprehensive gas chromatography: food and metabolomics applications. „Crit. Rev. Anal. Chem.”, 2018, 48 (3), 176-185.
11. Forcisi S. i wsp.: Liquid chromatography-mass spectrometry in metabolomics research: Mass analyzers in ultra-high pressure liquid chromatography coupling. „J. Chromatogr. A”, 2013, 1292, 51-65.
12. Ren J.L. i wsp.: Advances in mass spectrometry-based metabolomics for investigation of metabolites. „RSC Adv.”, 2018, 8 (40), 22335-22350.
13. Witkiewicz Z., Kałużna-Czaplińska J.: Chromatografia gazowa. Podstawy chromatografii i technik elektromigracyjnych. Warszawa 2017, 30-165.
14. Gika H.G. i wsp.: Current practice of liquid chromatography-mass spectrometry in metabolomics and metabonomics. „J. Pharmaceut. Biomed.”, 2014, 87, 12-25.
15. Michalski R.: Analiza anionów i kationów w próbkach ciekłych. Chromatografia jonowa. Warszawa 2015, 147-211.
16. Michalski R.: Ion chromatography as a reference method for determination of inorganic ions in water and wastewater. „Crit. Rev. Anal. Chem.”, 2016, 36 (2), 107-127.
17. Michalski R.: Principles and Applications of Ion Chromatography. [In:] Application of IC-MS and IC-ICP-MS in environmental research. John Wiley & Sons, 2016, 1-37.
18. Michalski R. i wsp.: Chromatografia jonowa w praktyce – część I i II. „Analityka”, 2018, 1, 32-37.
19. Esteki M. i wsp.: A review on the application of chromatographic methods, coupled to chemometrics, for food authentication. „Food Control”, 2018, 93, 165-182.
20. Xu Y.J.: Foodomics: a novel approach for food microbiology. „Trac-Trend Anal. Chem.”, 2017, 96, 14-21.
21. Mena-Bravo A., Luque de Castro M.L.: Sweat: a sample with limited present applications and promising future in metabolomics. „J. Pharmaceut. Biomed.”, 2014, 90, 139-147.
22. Thienpont L.M., van Nuwenborg J.E., Stöckl D.: Ion chromatography as reference method for serum cations. „J. Chromatogr. A”, 1997, 789 (1-2), 557-568.
23. Michalski R.: Application of ion chromatography in clinical studies and pharmaceutical industry. „Mini-Rev. Med. Chem.”, 2014, 14 (10), 862-872.
24. Michalski R., Łyko A.: Research onto the contents of selected inorganic ions in the dialysis fluids and dialysates by using ion chromatography. „J. Liq. Chromatogr. R T.”, 2016, 39 (2), 96-103.

Uwagi

Opracowanie rekordu w ramach umowy 509/P-DUN/2018 ze środków MNiSW przeznaczonych na działalność upowszechniającą naukę (2019).

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.baztech-d7ff5acc-d812-4fef-8ffd-b88671f8519d