Wykrywanie bakterii z gatunku Acinetobacter baumannii w próbkach medycznych i środowiskowych

• Autorzy: Dąbrowiecka M. , Piątek I. , Obuchowski M. , Dąbrowiecki Z.

Identyfikatory

DOI

10.13006/PHR.48.2

Warianty tytułu

EN

The detection of Acinetobacter baumannii bacteria in medical and environmental samples

• Języki publikacji: PL EN

Abstrakty

PL

Drobnoustroje z rodzaju Acinetobacter należą do Gramujemnych pałeczek. Są to mikroorganizmy wolnożyjące, spotyka się je w glebie i w zbiornikach wodnych, ale niektórzy przedstawiciele rodzaju Acinetobacter mogą być również składnikiem mikroflory skóry człowieka, co powoduje, że mają duże znaczenie kliniczne, ponieważ często zasiedlają środowisko szpitalne i są przyczyną szpitalnych zakażeń oportunistycznych, zwłaszcza u pacjentów z obniżoną odpornością. Celem naszego projektu było opracowanie szybkiej i wiarygodnej metody detekcji bakterii z gatunku Acinetobacter baumannii, w próbkach medycznych i środowiskowych.

EN

Acinetobacter microogranisms belong to the genus of Gram-negative rod-shaped bacteria. These free living organisms are observed in the soil and water reservoirs with some of the representatives of the Acinetobacter genus being a component of the microflora of the human skin, which causes them to be of great clinical significance due to their presence in the hospital environment and causing opportunistic infections occurring particularly in immunocompromised patients. The objective of the project was to prepare a fast and credible method for detection of Acinobacter baumannii bacteria in medical and environmental samples.

Słowa kluczowe

PL

zakażenia szpitalne; Acinetobacter baumannii; diagnostyka molekularna

EN

hospital infections; Acinetobacter baumannii; molecular diagnostics

• Wydawca: Polskie Towarzystwo Medycyny i Techniki Hiperbarycznej
• Czasopismo: Polish Hyperbaric Research
• Rocznik: 2014
• Tom: nr 3(48)
• Strony: 19--32
• Opis fizyczny: Bibliogr. 26 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Dąbrowiecka M.

• Zakład Medycyny Morskiej i Hiperbarycznej Wojskowego Instytutu Medycznego w Gdyni

autor

Piątek I.

• Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego

autor

Obuchowski M.

• Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

autor

Dąbrowiecki Z.

• Zakład Medycyny Morskiej i Hiperbarycznej Wojskowego Instytutu Medycznego w Gdyni

Bibliografia

• 1. Krawczyk B: Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych. Post.Mikrobiol. 2007, No 46, 367-378
• 2. Maragakis L, Perl T: Acinetobacter baumannii: Epidemiology, Antimicrobial Resistance and Treatment Options. Clin. Infect. Dis. 2008, No 46, 1254-1263 , doi: 10.1086/529198
• 3. Meijie J, Zhijun Z, Shuping Z: Epidemiological Characteristics and Drug Resistance Analisis of Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii In China Hospital at Certain Time Polish Journal of Microbiology , 2014,Vol.63, No 3
• 4. Jawad A, Seifert H, Snelling A.M, Heritage J, Hawkey P.M: Survival of Acinetobacter baumannii on dry surfaces: comparison of outbreak and sporadic isolates. J. Clin. Microbiol. 1998, July, 1938-1941
• 5. Zmudziński M, Gospodarek E, Gierlotka K: Mechanizmy oporności pałeczek Acinetobacer spp. na antybiotyki nie β-laktamowe. Post. Mikrobiol. 2007, No 46, 335-342
• 6. Zapor M.J, Moran K.A: Infectious diseases during war time. Current opinion in Infectious Diseases , 2005, No18, 395-399
• 7. Peleg A, Seifert H, Paterson D: Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen. Clin. Microbiol. Rev. 2008, Jul, 538-582 , doi:10.1128/CMR.00058-07
• 8. Falagas M.E, Karveli E.A, Siempos I.I, Vardakas K.Z: Acinetobacter infections: a growing threat for critically ill patients. Epidemiol. Infect. 2008, No136,1009-1019
• 9. Wendt C, Dietze B, Dietz E, Rüden H: Survival of Acinetobacter baumannii on Dry Surfaces. J. Clin. Microbiol.1997 June, 1394-1397
• 10. Villgas M.V, Hartstein A.I: Acinetobacter outbreaks. Infect. Control. Hosp. Epidemol. 2003, No 24, 284-295
• 11. Murray C.K, Roop S.A, Hospenthal D.R: Bacteriology of war wounds at the time of injury. Mil. Med. 2006, No 171,821-825
• 12. Griffith M.E, Ceremuga J.M, Ellis M.W, Guymon C.H, Hospenthal D.R, Murray C.K: Acinetobacter skin colonization of US army soldiers. Infect. Control Hosp. Epidemiol. 2006, No 27, 659-661
• 13. Griffith M.E, Lazarus D.R, Mann P.B, Boger J.A, Hospenthal D.R, Murray C.K: Acinetobacter skin carriage among US army soldiers deployed In Iraq. Infect. Control Hosp. Epidemiol. 2007, No 28, 720-722
• 14. Kur J, Krawczyk B: Comparison of DNA-based typing methods of microbial organisms for epidemiological studies. Adv. Agric. Sci. 2002, No 8, 7-20
• 15. Seifert H, Schulze A, Bagiński R, Pulverer G: Comparison of Four Different Methods for Epidemiologic Typing of Acinetobacter baumannii. J. Clin. Microbiol. 1994, July, 1816-1819
• 16. Riley L.W: Molecular Epidemiology of Infectious Diseases. ASM Press 2004
• 17. Clifford R.J, Milillo M, Prestwood J, Quintero R, Zurawski D.V, Kwak Y.I, Waterman P.E, Lesho E.P, McGann P: Detection of Bacterial 16S rRNA and Identification of Four Clinically Important Bacteria by Real-Time PCR. PLOS ONE 2012, November, Vol.7 Iss.11 , doi:10.1371/journal.pone.0048558
• 18. Martin-Pena R, Dominguez-Herrera J, Pachon J, McConnell M.J: Rapid detection of antibiotic resistance in Acinetobacter baumannii using quantitative real-time PCR J. Antimicrob. Chemother. 2013, February 23
• 19. Scheinert P, Krausse R, Ullmann U: Molecular differentiation of bacteria by PCR amplification of the 16S- 23S rRNA spacer. J. Microbiol. Meth. 1996, No 26, 103-117
• 20. Krawczyk B, Lewandowski K, Kur J: Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences. Mol. Cell Probes, 2002, No16, 1-11
• 21. Krawczyk B, Kur J: Molecular diagnostic in microbiology. Publ. Polit. Gd. 2008
• 22. Mackay I.M: Real-Time PCR in Microbiology, from Diagnosis to Characterization. Caister Academic Press 2007
• 23. McConnell M.J, Perez-Ordonez A, Perez-Romero P, Valencia R, Lepe J.A, Vazquez-Barba I, Pachon J: Quantitative Real-Time PCR for Detection of Acinetobacter baumannii Colonization in the Hospital Environment. J. Clin. Microbiol. 2012, February, 1412-1414, doi:10.1128/JCM.06566-11
• 24. Jawad A, Hawkey P.M, Heritage J, Snelling A.M: Description of Leeds Acinetobacter Medium, a New Selective and Differential Medium for Isolation of Clinically Important Acinetobacter spp. and Comparison with Herellea Agar and Holton’s Agar, J. Clin. Microbiol. 1994, Oct, p. 2353-2358
• 25. Bannerman et al.: PFGE Typing Protocol Recommended by ARPAC for Acinetobacter baumannii, J. Clin. Microbiol. 1995, No 33, 551-555
• 26. Durmaz R, Otlu B, Koksal F, Hosoglu S, Ozturk R; The Optimization of a Rapid Pulsed Field Gel Electrophoresis Protocol for the Typing of Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella spp. Jpn. J. Infect. Dis.2009, No 62,372-377