Od algorytmu dynamicznej cieczy sieciowej do dedykowanego komputera równoległego II – maszyna mDLL

• Autorzy: Jung J. , Kiełbik R. , Rudnicki K. , Polanowski P.

Identyfikatory

DOI

10.15199/48.2017.11.34

Warianty tytułu

EN

From dynamic lattice liquid algorithm to dedicated parallel computer II – mDLL machine

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W artykule opisano złożenia projektowe, budowę i realizację maszyny przeznaczonej do symulacji zjawisk zachodzących w wieloskładnikowych układach molekularnych. Przedstawiony system elektroniczny zbudowano przy użyciu programowalnych układów scalonych FPGA (w j. ang. Field Programmable Gate Array). W maszynie zaimplementowano model dynamicznej cieczy sieciowej (ang. dynamic lattice liquid - DLL) i wykonano testy jej działania.

EN

The article describes the assumption of design, construction and implementation of a machine intended to simulate the phenomena occurring in complex molecular systems. Presented electronic system was built with the Field Programmable Gate Array (FPGA). In the machine was implemented a model of Dynamic Lattice Liquid (DLL) and the tests of the device operation was performed.

Słowa kluczowe

PL

programowalny układ FPGA; topologia sieci połączeń; równoległe przetwarzanie danych; symulacja molekularna

EN

field programmable gate array; topology of the network connections; parallel data processing; molecular simulations

• Wydawca: Wydawnictwo SIGMA-NOT
• Czasopismo: Przegląd Elektrotechniczny
• Rocznik: 2017
• Tom: R. 93, nr 11
• Strony: 162--170
• Opis fizyczny: Bibliogr. 17 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Jung J.

• Politechnika Łódzka, Katedra Fizyki Molekularnej ul. Żeromskiego 116, 90-924 Łódź

autor

Kiełbik R.

• Politechnika Łódzka, Katedra Mikroelektroniki i Technik Informatycznych ul. Żeromskiego 116, 90-924 Łódź

autor

Rudnicki K.

• Brightelligence Ltd 2/3, 1 Garriochmill Way G20 6LL, Galsgow, UK

autor

Polanowski P.

• Politechnika Łódzka, Katedra Fizyki Molekularnej ul. Żeromskiego 116, 90-924 Łódź

Bibliografia

• [1] Fitch B. G., Rayshubsky A . , Elftheriou M., Ward T. J. C., Giampapa M. E., Pitman M. C., Pitera J.W., Swope W.C., Germain R. S , Blue Matter: Scalling of Nbody simulations to one atom per node, IBM J. Res & Dev, 52 (2008), 145
• [2] Hu, Xiaohu, Hong L., Smith M. D., Neusius T., Cheng X., Smith J. C., The Dynamics of Single Protein Molecules Is Non-Equilibrium and Self-Similar over Thirteen Decades in Time, Nature Physics 12(2016), no. 2, 171–174.
• [3] Chen W., De Schutter E., Parallel STEPS: Large Scale Stochastic Spatial Reaction-Diffusion Simulation with High Performance Computers, 11(2017), Frontiers in Neuroinformatics, doi: 10.3389/fninf.2017.00013
• [4] Polanowski P., Implementacja sieciowych modeli cieczy i polimerów w symulacjach opartych na obliczeniach równoległych, Rozprawa doktorska, (2002), Politechnika Łódzka
• [5] Jackson R. D., Hoane A. J. Jr., Modular Infinitely Extentable Three Dimensional Torus Packing Scheme for Parallel Processing, (1998), US Patent no. US005715391A, http://www.google.ch/patents/US5715391
• [6] Pakula T., Collective dynamics in simple supercooled and polymer liquids, Journal of Molecular Liquids, 86(2000), 109-121
• [7] Polanowski P., Jeszka J. K., Krysiak K., Matyjaszewski K., Influence of intramolecular crosslinking on gelation in living copolymerization of monomer and divinyl cross-linker. Monte Carlo simulation studies, Polymer, 79(2015), 171-178.
• [8] Polanowski P., Jung J., Kiełbik R., Napieralski A., Lichy K., Od algorytmu dynamicznej cieczy sieciowej do dedykowanego komputera równoległego, Przegląd Elektrotechniczny, 84 (2008), n.11, 69-73
• [9] Jung J., Od wybranych zagadnień elektroniki organicznej do uniwersalnej maszyny przeznaczonej do analizy zjawisk zachodzących w gęstych układach wieloskładnikowych, Rozprawa habilitacyjna, (2016), Politechnika Łódzka
• [10] Jung J., Polanowski P., Kiełbik R., Special state machine based on Dynamic Lattice Liquid model, International Journal of Engineering Science and Innovative Technology (IJESIT), 3(2014), 360-367
• [11] Jung J., Polanowski P., Kiełbik R., Hałagan K., Zatorski W., Ulański J., Napieralski A., Pakuła T., A parallel machine with reduced number of connections between logical circuits, (2016), EP Patent Application no. EP3079073A1, 2016, https://www.google.com/patents/EP3079073A1?cl=un
• [12] Pachanek G.G., Pitsianis N. P., Barry E. F., Drabenstott T. L., Method and Apparatus for Manifold Array Processing, (2000), US Patent no. US6167502A, https://www.google.tl/patents/US6167502
• [13] Daniel H. W., Parallel Processor, (1992), EP Patent no. EP0501524A2, https://www.google.com.na/patents/EP0501524A2?cl=un
• [14] Passint R. S., Thorson G., Galles M. B., Hybrid Hypercube/Torus Architecture, (2001), US Patent no. US6230252B1, http://www.google.ch/patents/US6230252
• [15] Jung J., Polanowski P., Kiełbik R., Hałagan K., Zatorski W., Ulański J., Napieralski A., Pakuła T., Panel z układami elektronicznymi i zestaw paneli, (2016), RP Patent no. P.405479 http://regserv.uprp.pl/register/application?number=P.405479
• [16] Jung J., Polanowski P., Kiełbik R., Hałagan K., Zatorski W., Ulański J., Napieralski A., Pakuła T., A panel with electronic circuits and a set of panels, (2016), EP Patent Application no. EP3079071A1 https://google.com/patents/EP3079071A1?cl=en
• [17] Jung J., Polanowski P., Kiełbik R., Hałagan K., Zatorski W., Ulański J., Napieralski A., Pakuła T., A parallel machine having operational cells located at nodes of a face centered lattice, (2016), EP Patent Application no. EP3079072A1, https://www.google.com.na/patents/EP3079072A1?cl=en

Uwagi

Opracowanie ze środków MNiSW w ramach umowy 812/P-DUN/2016 na działalność upowszechniającą naukę (zadania 2017).