PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
Tytuł artykułu

Structural similarity of CheY-like proteins

Treść / Zawartość
Identyfikatory
Warianty tytułu
Języki publikacji
EN
Abstrakty
EN
The problem of structural similarity of polypeptide chains of low sequence similarity representing a similar 3D structural form has been the object of analysis of researchers engaged in the protein folding problem. Three homologous proteins of similar biological function with low sequence similarity are the objects of analysis presented in this paper. The structure of a hydrophobic core is used as the criterion for structural similarity assessment of these three proteins. The applied method allows recognition of differentiati on in topologically similar structures.
Słowa kluczowe
Rocznik
Strony
383--392
Opis fizyczny
Bibliogr. 13 poz., rys., tab.
Twórcy
autor
  • Department of Bioinformatics and Telemedicine, Jagiellonian University – Medical College, Lazarza 16, 31-530 Krakow, Poland
autor
  • Chair of Medical Biochemistry, Jagiellonian University – Medical College, Kopernika 7, 31-034 Krakow, Poland
autor
  • Department of Bioinformatics and Telemedicine, Jagiellonian University – Medical College, Lazarza 16, 31-530 Krakow, Poland
Bibliografia
  • [1] Madhusudan, Zapf J, Whiteley J M, Hoch J A, Xuong N H, Varughese K I 1996 Structure 4 679
  • [2] Kern D, Volkman B F, Luginb ̈uhl P, Nohaile M J, Kustu S, Wemmer D E 1999 Nature 402 894
  • [3] Volz K, Matsumura P 1991 J Biol Chem 266 15511
  • [4] Kalinowska B, Banach M, Konieczny L, Roterman I 2015 Entropy 17 (3) 1477
  • [5] Roterman I, Banach M, Kalinowska B, Konieczny L Entropy (in press)
  • [6] Sillitoe I, Lewis T E, Cuff A L, et al. 2015 Nucleic Acids Res doi: 10.1093/nar/gku947
  • [7] Hills R D Jr, Kathuria S V, Wallace L A, Day I J, Brooks C L 3rd, Matthews C R 2010 J Mol Biol 398 (2) 332
  • [8] Konieczny L, Brylinski M, Roterman I 2006 In Silico Biol 6 (1-2) 15
  • [9] Kullback S, Leibler R A 1951 Ann. Math. Stat. 22 79
  • [10] Banach M, Prymula K, Jurkowski W, Konieczny L, Roterman I 2012 J Mol Model 18 (1) 229
  • [11] Roterman I, Konieczny L, Jurkowski W, Prymula K, Banach M 2011 J Theor Biol 283 (1) 60
  • [12] Banach M, Prudhomme N, Carpentier M, Duprat E, Papandreou N, Kalinowska B, Chomilier J, Roterman I 2015 PLoS One 10 (4), e0125098
  • [13] Banach M, Konieczny L, Roterman I 2014 J Theor Biol 359 6
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.baztech-c2508972-892a-49ee-b363-bf1b5ae5da38
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.