Inhibicja enzymatyczna wolnowiążąca

• Autorzy: Pawełczak M. , Hurek J.

Warianty tytułu

EN

Enzymatic slow-binding inhibition

• Języki publikacji: PL EN

Abstrakty

PL

Inhibitory enzymów otrzymywane są głównie w celu ich zastosowania w medycynie, ochronie plonów, czy przemyśle spożywczym. Wolnowiążące się z enzymem inhibitory stanowią grupę inhibitorów nieklasycznych i ten typ inhibicji wymaga bardziej złożonej analizy danych kinetycznych. Znajomość mechanizmów hamowania enyzmów przez inhibitory jest kluczowa dla projektowania nowych, bardziej efektywnych związków tego typu. Poniżej przedstawiono algorytm pozwalający na rozstrzygnięcie jaki jest mechanizm inhibicji wolnowiążącej oraz oryginalny sposób obliczenia stałej Ki dla każdego z tych mechanizmów.

EN

Enzyme inhibitors are produced mostly for applications in medicine, crop protection and food industry. Inhibitors slow-binding with enzyme are a group of non-classical inhibitors and such type of inhibition requires more complex analysis of kinetic data. The knowledge of enzyme inhibition mechanisms by inhibitors plays essential role for designing new, more effective compounds of such type. Below, the algorithm is presented that allows to find out what is a mechanism of slow-binding inhibition and the original method for calculating constant Ki for each individual mechanism is shown.

Słowa kluczowe

PL

kinetyka enzymatyczna; inhibicja wolnowiążąca; mechanizmy inhibicji wolnowiążącej

EN

enzymatic kinetics; slow-binding inhibition; slowbinding inhibition mechanisms

• Wydawca: Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego, ZW CHEMPRESS-SITPChem
• Czasopismo: Chemik
• Rocznik: 2014
• Tom: Vol. 68, nr 4
• Strony: 377--384
• Opis fizyczny: Bibliogr. 13 poz., rys.

Twórcy

autor

Pawełczak M.

• Wydział Chemii, Uniwersytet Opolski, Opole

autor

Hurek J.

• Wydział Chemii, Uniwersytet Opolski, Opole

Bibliografia

• 1. Michaelis L., Menten M. L.: The kinetics of invertin action. FEBS Letters 2013, 587, 2712–2720.
• 2. Guay D., Beaulieu C, Percival D. A.: Therapeutic Utility and Medicinal Chemistry of Cathepsin C Inhibitors. Curr. Top. Med. Chem. 2010, 10, 708–716.
• 3. Kafarski P., Grembecka J., Mucha A., Pawełczak M., Drąg M., Berlicki Ł., Olechnowicz D. Projektowanie potencjalnych leków i pestycydów z wykorzystaniem wiedzy o strukturze przestrzennej enzymów. Przem. Chem. 2003, 82, 1087–1089.
• 4. Lejczak B., Kafarski P., Zygmunt J.: Inhibition of Aminopeptidases by Aminophosphonates. Biochemistry. 1989, 28, 3549-3555.
• 5. Cook P. F., Cleland W. W.: Enzyme kinetics and mechanism. Garland Science 2007, 195-204.
• 6. Copeland R. A.: Enzymes. A practical introduction to structure, mechanism and data analysis. VILEY-VCH, 2000, 318-349.
• 7. Copeland R. A.: Evaluation of enzyme inhibitors in drug discovery. John Wiley&Sons, 2013, 203-245.
• 8. Allegra C., J., Chabner B. A., Drake J. C., Lutz R., Rodbard D., Jolive J. Enhanced Inhibition of Thymidylate Synthase by Methotrexate Polyglutamates. J. Biol. Chem. 1985, 260, 9720–9726.
• 9. Jimenez M., Garcia-Carmona F.: 4-Substituted Resolcinols (Sulfite Alternatives) as Slow-Binding Inhibitors of Tyrosinase Catecholase Activity. J. Agric. Food Chem. 1997, 45, 2061–2065.
• 10. Goličnik M., Stojan J.: Slow-binding inhibition: A theoretical and practical course for students. Biochem. Mol. Biol. Educ. 2004, 32, 228–235.
• 11. Duggleby, R.G., Attwood, P.V., Wallace, J.C., Keech B.: Avidin is a slow-binding inhibitor of pyruvate carboxylase. Biochemistry 1982, 21, 3364–3370.
• 12. Kuzmič P.: A steady state mathematical model for stepwise „slow-binding”reversible enzyme inhibition. Anal. Biochem. 2008, 380, 5–12.
• 13. Drąg M., Wieczerzak E., Pawełczak M., Berlicki Ł., Grzonka Z., Kafarski P.Toward very potent, non-covalent organophosphonate inhibitors of cathepsin C and related enzymes by 2-amino-1-hydroxy-alkanephosphonates dipeptides. Biochimie 2013, 95, 1640–1649.