Propedeutyka kierunkowych oddziaływań miedzycząsteczkowych. Wiązania wodorowe, oddziaływania asocjacji warstwowej i wiązania halogenowe

Kruszyński, R.

Artykuł - szczegóły

Tytuł artykułu

Propedeutyka kierunkowych oddziaływań miedzycząsteczkowych. Wiązania wodorowe, oddziaływania asocjacji warstwowej i wiązania halogenowe

Autorzy

Kruszyński R.

Wybrane pełne teksty z tego czasopisma

http://cybra.lodz.pl/dlibra/collectiondescription?dirids=8

Identyfikatory

Warianty tytułu

Introduction to directional intermolecular interactions. Hydrogen bonds, stacking interactions and halogen bonds

Języki publikacji

Abstrakty

The review presents the typical bonding intermolecular interactions: hydrogen bonds, halogen bonds and stacking interactions. The first part describes the specific types of intermolecular interactions, including their definitions, energy and selected properties. The second part deals with the application of quantum-mechanical methods to study of intermolecular interactions, especially the appliance of the natural bond orbitals method, and usage of ab intio calculations for solving of structural problems appearing during the above mentioned studies. All above referred interactions have been presented in orbital terms. The third part describes the novel employment of graph theory to characterise the motifs formed by intermolecular interactions in the solid state.

Słowa kluczowe

oddziaływanie międzycząsteczkowe wiązanie wodorowe wiązanie halogenowe oddziaływanie warstwowe oddziaływanie niekowalencyjne oddziaływanie wiążące

intermolecular interaction hydrogen bond halogen bond stacking interaction

Wydawca

Wydawnictwo Politechniki Łódzkiej

Czasopismo

Zeszyty Naukowe. Chemia / Politechnika Łódzka

Rocznik

2011

Tom

Z. 50

Strony

5--47

Opis fizyczny

Bibliogr. 125 poz.

Twórcy

autor

Kruszyński R.

Wydział Chemiczny, Politechnika Łódzka

Bibliografia

1. Muller-Dethlefs K., Hobza P., Chem. Rev. 100, 143 (2000).
2. Lodish H., Berk A., Zipursky S.L., Matsudaira P., Baltimore D., Darnell J., Molecular Cell Biology. Freeman, New York (2000).
3. Lee S., Mallik A.B., Fredrickson D.C., Cryst. Grow. Des. 4, 279 (2004).
4. Sparkes H.A., Raithby P.R., Clot E., Shields G.P., Chisholm J.A., Alien F.H., CrystEngComm. 8, 563 (2006).
5. GluskerJ.P., Topics in Current Chemistry, 198, 1 (1998).
6. Wrener A., Liebig's Annalen der Chemie, 332, 261 (1902).
7. Hantzsch A., Chemische Berichte. 43, 3049 (1910).
8. Pfeiffer P., Liebig's Annalen der Chemie. 398, 137 (1913).
9. Latimer W.M., Rodebush W.H., J. Am. Chem. Soc. 42, 1419 (1920).
10. Pauling L., J. Am. Chem. Soc. 57, 2680 (1935).
11. Pauling L., The nature of the chemical bond. Cornell University Press, Ithaca, New York (1939).
12. Pauling L., Corey R.B., Branson H.R., Proc, Nat. Acad. Sci. USA. 37, 205 (1951).
13. Watson J.D., Crick F.H.C., Nature (London). 171, 737 (1953).
14. Pimentel G.C., McClellan A.L., The hydrogen bond. Freeman, San Francisco (1960).
15. Green R.D., Hydrogen bonding by C-H groups. Macmillan, London (1974).
16. Taylor R., Keannard O., Am. Chem. Soc. 104, 5063 (1982).
17. Hunter C.A., Sanders J.K.M., J. Am. Chem. Soc. 112, 5525 (1990).
18. Structure and Bonding 126. Halogen Bonding - Fundamentals and Application. Ed. Metrangolo P. Resnati G. Springer-Verlag, Berlin Heidelberg (2008).
19. Schottel B.L., Chifotides H.T., Dunbar K.R., Chem. Soc. Rev. 37, 68 (2008).
20. Hay B.P., Custelcean R., Cryst. Growth Des. 9, 2539 (2009).
21. Kruszynski R., Trzesowska-Kruszynska A., Majewski P., Łukaszewicz E., Majewska K., Sierański T, Lewiński B., J. Mol. Struct. 970, 79 (2010).
22. Małecki J.G., Kruszynski R., Jaworska M., Lodowski P., Mazurak Z., J. Organomet. Chem. 693, 1096 (2008).
23. Malecki J.G., Kruszynski R., Jaworska M., Lodowski P., J. Coord. Chem. 60, 741 (2007).
24. Wright W.B., Meyers E.A., Cryst. Struct. Commun. 9, 1173 (1980).
25. Kruszynski R., Cent. Eur. J. Chem. 6, 542 (2008).
26. Jeffrey G.A., An Introduction to Hydrogen Bonding. Oxford University Press. Oxford (1997).
27. Coulson C.A., Valence. Oxford University Press, Oxford (1952).
28. Hydrogen bonding. Ed. Hadzi D. Pergamon Press. New York (1959).
29. Cotton F.A., Luck R.L., Inorg. Chem. 28, 3210 (1989).
30. Aakeröy C.B., Seddon K.R., Chem. Soc. Rev. 22, 397 (1993).
31. Kruszynski R., Acta Cryst. C65, o396 (2009).
32. Kruszynski R., Trzesowska-Kruszynska A., Acta Cryst. C66, o449 (2010).
33. Perrin C.L., Acc. Chem. Rex. 43, 1550 (2010).
34. Knak Jensen S.J., Csizmadia I.G., Chem. Phys. Lett. 319, 220 (2000).
35. Kumagai T., Kaizu M., Okuyama H., Hatta S., Aruga T., Hamada I., Morikawa Y., Phys. Rev. B 81, 045402 (2010).
36. Trzesowska-Kruszynska A., Kruszynski R., Acta Cryst. C65, o19 (2009).
37. Albert N.A., Infrared Absorption Associated with Strong Hydrogen Bonds. California Institute of Technology, Pasadena, California (1961).
38. Nyquist R.A., Interpreting Infrared, Raman, and Nuclear Magnetic Resonance Spectra. Academic Press, London (2001).
39. Richardson T., de Gala S., Crabtree R.H., Siegbahn P.E.M., J. Am. Chem. Soc. 117, 12875 (1995).
40. Crabtree R.H., Siegbahn P.E.M., Eisenstein O., Rheingold A.L., Koetzle T.F., Acc. Chem. Res. 29, 348 (1996).
41. Dill S.D., Schleyer P. v. R., Binkley J.S., Pople J.A., J. Am. Chem. Soc. 99, 6159 (1977).
42. DeFrees D.J., Raghavachari K., Schlegel H.B., Pople J.A., Schleyer P. v. R., J. Phys. Chem. 91, 1857 (1987).
43. Cotton F.A., Matonic J.H., Murillo C.A., J. Am. Chem. Soc. 120, 6047 (1998).
44. Rozas I., Alkorta I., Elguero J., J. Phys. Chem. A101, 4236 (1997).
45. Desiraju G.R., Steiner T., The Weak Hydrogen Bond in Structural Chemistry and Biology. Oxford University Press, Oxford (1999).
46. Pearson R.G., Chem. Rev. 85, 41 (1985).
47. Brookhart M., Green M.L.H., J. Organometall Chem., 250, 395 (1983).
48. Schneider J.J., Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 35, 1068 (1996).
49. SchererW., McGradyG, S., Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 43, 1782 (2004).
50. Crabtree R.H., Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 32, 78 (1993).
51. Hamilton W.C, , Ibers J.A., Hydrogen Bonding in Solids. Benjamin Press, New York (1968).
52. Steiner T., Saenger W., Carbohydr. Res 259 1 (1994).
53. Murray-Rust P., Glusker J.P., J. Am. Chem. Soc. 106, 1018 (1984).
54. Steiner T., Desiraju G.R., Chem. Commun. 891 (1998).
55. Kruszynski R., Sieranski T., Cent. Eur. J. Chem. 9, 94 (2011).
56. Rutherford R.A., Pullan B.R., Isherwood I., Neuroradiotogy. 11, 15 (1976).
57. Haffner H., Appel H., Holmes K.C., Eur. Biophys. J. 14, 37 (1986).
58. Legon A.C., Ann. Rev. Phys, Chem. 34, 275 (1983).
59. Garg A.N., Goel P.S., J. Inorg. Nuclear Chem. 31, 697 (1969).
60. Emsley J., Chem. Soc. Rev. 9, 91 (1980).
61. Kruszynski R., Trzesowska-Kruszynska A., Acta Cryst. C65, o624 (2009).
62. Hughes A., Proc. K. Soc. London. A155, 710 (1936).
63. Alexander A. E., J. Chem. Soc. 1813 (1937).
64. Abraham R.J., Fivazi F., Pearson H., Smith K.M., J. Chem. Soc., Chem. Commun. 698 (1976).
65. Abraham R.J., Eivazi F., Pearson H., Smith K.M., J. Chem. Soc., Chem. Commun. 699 (1976).
66. Burley S.K., Petsko G.A., Adv. Protein Chem. 39, 125 (1988).
67. Saenger W., Principles of Nucleic Acid Structure. Springer-Verlag, New York (1984).
68. Hobza P., Selzle H.L., Schlag E.W., Chem. Rev. 94, 1767 (1994).
69. Hobza P., Selzle H.L., Schlag E.W., J. Phys. Chem. 100, 18790 (1996).
70. Marsili S., Chelli R., Schettino V., Procacci P., Phys. Chem. Chem. Phys. 10, 2673 (2008).
71. Sinnokrot M.O., Valeev E.F., Sherrill C.D., J. Am. Chem. Soc. 124, 10887 (2002).
72. Bates D.M., Anderson J.A., Oloyede P., Tschumper G.S., Phys. Chem. Chem. Phys. 10, 2775 (2008).
73. Antony J., Grimme S., Phys. Chem. Chem. Phys. 10, 2722 (2008).
74. Guthrie F., J. Chem. Soc. 16, 239 (1863).
75. Lewis G.N., J. Franklin Inst. 226, 301 (1938).
76. Mulliken R.S., J. Phys. Chem. 56, 801 (1952).
77. Mulliken R.S., Person W.B., Molecular complexes. Wiley-Interscience, New York (1969).
78. Metrangolo P., Pilatib T., Resnati G., CrystEngComm. 8, 946 (2006).
79. Politzer P., Lane P., Concha M.C., Ma Y., Murray J.S., J. Mol. Model. 13, 305 (2007).
80. Metrangolo P., Neukirch H., Pilati T., Resnati G., Acc. Chem. Res. 38, 386 (2005).
81. Clark T., Hennemann M., Murray J.S., Politzer P., J. Mol. Model. 13, 291 (2007).
82. Murray J.S., Lane P., Clark T., Politzer P., J. Mol. Model. 13, 1033 (2007).
83. Murray J.S., Lane P., Politzer P., J. Mol. Model. 15, 723 (2009).
84. Politzer P., Murray J.S., Lane P., Int. J. Quantum Chem. 107, 3046 (2007).
85. Palusiak M., J. Mol. Struct. THEOCHEM. 945, 89 (2010).
86. Kruszynski R., Acta Cryst. C63, o389 (2007).
87. Wiberg K.B., Bader R.F.W., Lau C.D.H., J. Am. Chem. Soc. 109, 985 (1987).
88. Bader R.F.W., Atoms in Molecules - A Quantum Theory, Oxford University Press. Oxford (1990).
89. Bader R.F.W., Gough K.M., Laidig K.E., Keith T.A., Mol. Phys. 75. 1167 (1992).
90. Bader R.F.W., Keith T.A., J. Chem. Phys. 99, 3683 (1993).
91. Foster J.P., Weinhold F., J. Am. Chem. Soc. 102, 7211 (1980).
92. Reed A.E., Curtiss, L.A., Weinhold F., Chem. Rev. 88, 899 (1988).
93. Jansen H.B., Ross P., Chem. Phys. Lett. 3. 140 (1969).
94. Liu B., McLean A.D., J. Chem. Phys. 59, 4557 (1974).
95. Mayer I., Int. J. Quant. Chem. 23, 341 (1983).
96. Boys S.F., Bernardi F., Mol. Phys. 19, 553 (1970).
97. Simon S., Duran M., Dannenberg J.J., J. Chem. Phys. 105, 11024 (1996).
98. Hobza P., Müller-Dethlefs K., Non-covalent Interactions: Theory and Experiment. Royal Society of Chemistry, Cambridge (2009).
99. Wojciechowski P.M., Wiadomości Chemiczne. 59, 193 (2005).
100. Löwdin P.-O., Phys. Rev. 97. 1509 (1955).
101. Weinhold F., Natural Bond Orbital Methods, w Encyclopedia of Computational Chemistry, red. Schleyer P.v.R. Allinger N.L. Clark T. Gasteiger J. Kollman P.A. Schaefer III H.F. Schreiner P.R. John Wiley & Sons, Chichester, UK, 3, 1792-1811 (1998).
102. Reed A.E., Weinhold F., 7. Chem. Phys. 83, 1736 (1985).
103. Reed A.E., Weinhold F., J. Chem. Phys. 78, 4066 (1983).
104. Reed A.E., Weinstock R.B., Weinhold F, J. Chem. Phys. 83, 735 (1985).
105. Carpenter J.E., Weinhold F., J. Mol. Struct. (Theochem). 169, 41 (1988).
106. Weinhold F, Landis C.R., Chem. Educ. Res. Pract. Eur. 2, 91 (2001).
107. Weinhold F., Landis. C.R., Valency and Bonding: A Natural Bond Orbital Donor-Acceptor Perspective. Cambridge University Press, Cambridge (2005).
108. Hohenberg P., Kohn W., Phys. Rev. 136, 8864 (1964).
109. Kohn W., Sham L.J., Phys. Rev, 140, A1133 (1965).
110. Moller C, Plesset M.S., Phys. Rev. 46, 618 (1934).
111. Head-Gordon M., Pople J.A., Frisch M., J. Chem. Phys, Lett. 153, 503 (1988).
112. Saebo S., Almlof J., Chem. Phys. Lett. 154, 83 (1989).
113. Krishnan R., Pople J.A., Int. J. Quant. Chem. 14, 91 (1978).
114. Raghavachari K., Pople J.A., Replogle E.S., Head-Gordon M., J, Phys. Chem. 94, 5579 (1990).
115. Ditchfield R., Hehre W.J., Pople J.A., J. Chem. Phys. 54, 724 (1971).
116. Hehre W.J., Ditchfield R., Pople J.A., J Chem. Phys. 56, 2257 (1972).
117. Trzesowska A., Kruszynski R., J. Moi. Struct. TEOCHEM. 714, 175 (2005).
118. Dovesi R., Orlando R., Civalleri B., Roetti R., Saunders V.R., Zicovich-Wilson C.M., Z. Kristallogr. 220, 571 (2005).
119. Kruszynski R., Polish J. Chem. 83, 615 (2009).
120. Kruszynski R., Acta Cryts. C67, o52 (2011).
121. Etter M.C., Accounts Chem. Res. 23, 120 (1990).
122. Etter M.C., MacDonald J. C. Bernstein J. Acta Cryst. B46, 256 (1990).
123. Etter M.C., J. Phys. Chem. 95, 4601 (1991).
124. Bernstein J., Acta Cryst. B47, 1004 (1991).
125. Bernstein J., Davis R.E., Shimoni L., Chang N.-L., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34, 1555 (1995).

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.baztech-article-LOD7-0029-0072