Podstawy analizy matematycznej w ocenie ekspresji genów metodą real-time PCR

• Autorzy: Skommer J.
• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Artykuły pt. "Systemy znakowania w real-time PCR" cz. I i II, opublikowane w numerach 3 i 4/2003 LAB, stanowiły, wraz z krótkim wprowadzeniem, dość obszerny przegląd różnych metod detekcji amplikonu w technice real-time PCR. Systemy znakowania mają na celu umożliwienie badaczowi śledzenia reakcji amplifikacji w czasie rzeczywistym, a także - w różnym zakresie - określenia charakterystyki specyficzności reakcji. Uzyskane wyniki, w postaci wartości CT i CP (w praktyce oba parametry stanowią numer cyklu reakcji, przy którym sygnał fluorescencji przekracza poziom tła), stanowią podstawę dalszej analizy, prowadzącej do ilościowego określenia ekspresji badanych genów.

Słowa kluczowe

PL

real-time PCR; analiza matematyczna; szacowanie ekspresji genów; gen referencyjny

EN

real-time PCR; mathematical analysis; gene expression estimation

• Wydawca: Roble Sp. z o.o.
• Czasopismo: LAB Laboratoria, Aparatura, Badania
• Rocznik: 2003
• Tom: R. 8, nr 6
• Strony: 16--17
• Opis fizyczny: Bibliogr. 5 poz.

Twórcy

autor

Skommer J.

• Zakład Wirusologii Molekularnej, UAM, Poznań

Bibliografia

• 1. Pfaffl MW, Horgan GW, Dempfle L, 2002. Relative expression software tool (REST) for group-wise comparison and statistical analysis of relative expression results in real-time PCR. Nucleic Acid Res, 30.
• 2. Pfaffl MW, 2001. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR. Nucleic Acis Res, 29, 2002-2009.
• 3. Mannhalter C, Koizar D, Mitterbauer C, 2000. Evaluation of RNA isolation Methods and Reference Genes for RT-PCR Analyses of Rare Target RNA. Clin Chem Lab Med 38,171-177.
• 4. Threllin O, Zorzi W, Lakaye B, De Borman В, Coumans В, Hennen G, Grisar T, Igout A, Heinen E, 1999. Housekeeping genes as internal standards:use and limits. J Biotech 75, 291-295.
• 5. Bustin SA, 2000. Absolute quantification of mRNA using real-time reverse transcription polymerase chain reaction assays. J Mol Endocrinol 25,169-193.