DNA polymorphism in population that has undergone size changes in its history

• Autorzy: Łobos E.

Warianty tytułu

PL

O polimorfizmie DNA w populacji, której rozmiar zmienia się w czasie

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

In this paper we consider mutations which occur in genealogy of an n-individual sample taken from population which has undergone size changes in the course of its evolution. For any n = 2,3, ... we derive recurrent formulae for the probability generating function of the number of segregating sit es in the sample. If population size is constant the formulae reduce to known Watterson formulae [1]. From these formulae we obtain probabilities for numbers of segregating sites in triplets and we use it in exemplary numerical calculations. Computations are performed for four population models - two theoretical and two based on research concerning human population (from [2] and [3]). Then we compare our computations with the experimental data.

PL

Praca dotyczy rozkładu liczby mutacji, które pojawiły się w genealogii n-elementowej próbki pochodzącej z populacji, o której zakładamy, że jej rozmiar jest funkcją czasu. Podano wzory rekurencyjne na funkcje tworzące liczby miejsc segregujących w takich próbkach. Wzory te są uogólnieniem znanych wzorów G.A. Wattersona dla populacji, których rozmiar nie zmienia się w czasie. Obliczenia przeprowadzono w przypadku n = 3 dla czterech modeli rozwoju populacji -- dwóch teoretycznych i dwóch opartych na badaniach dotyczących populacji ludzi. Następnie porównano je z wynikami symulacji oraz danymi eksperymentalnymi.

Słowa kluczowe

EN

genetic drift; population genetics models; mutation; segregating sites

PL

polimorfizm DNA; wzory rekurencyjne

• Wydawca: Nałęcz Institute of Biocybernetics and Biomedical Engineering of the Polish Academy of Sciences ; Elsevier
• Czasopismo: Biocybernetics and Biomedical Engineering
• Rocznik: 1999
• Tom: Vol. 19, no. 4
• Strony: 91--98
• Opis fizyczny: Bibliogr. 6 poz., wykr.

Twórcy

autor

Łobos E.

• Silesian Technical University, Department of Mathematics, Gliwice, Poland