Electrochemical studies of interactions of pyronine B with RNA and determination of RNA

• Autorzy: Sun W. , You J. , Wang Q. , Jiao K.

Warianty tytułu

PL

Elektrochemiczne badanie oddziaływań między pyroniną B i RNA oraz oznaczanie RNA

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

Interaction of pyronine B (PB) with yeast RNA (yRNA) has been studied by electrochemical method on a hanging mercury drop electrode (HMDE) in 0.2 mol L(-1) Britton-Robinson (B-R) buffer solution. Under selected conditions, voltammetric peak at-0.90 V (vj SCE) corresponding to reduction of PB was formed. After addition of yRNA, the height of the reduction peak of PB apparently decreased and its potential exhibited a positive shift; no new redox peaks were observed. Some electrochemical properties of PB were quantitatively determined in the absence and in the presence of yRNA. It has been found that the values of E°, ks, an, etc. changed in the presence of yRNA, which indicated the formation of electroactive PB—RNA complex. yRNA was electroinactive in the selected potential range. Consequently, redox activity of PB in PB-RNA biocomplex was lowered and the corresponding peak height was decreased, as well as the peak potential was shifted. Conditions of the binding reaction and electrochemical detection of PB have been optimised. Under optimum conditions a decrease of peak current was linearly proportional to the concentration of yRNA in the range 1.0-35.0 μg mL(-1). The corresponding regression equation is: δIp(nA) = 24.12C (μg mL(-1) + 25.27 (n = 14, r = 0.993), detection limit is 0.73 μg mL(-1)(3σ). The proposed method has been applied to the determination of yRNA in synthetic samples with satisfactory results.

PL

Badano oddziaływania między pyroninąB (PB) i RNA z drożdży (yRNA) stosując wiszącą kroplową elektrodę rtęciową (HMDE, WKER) w środowisku buforu Britona-Robinsona o stężeniu 0,2 mol L(-1). W wybranych warunkach eksperymentalnych, obserwowano pik woltamperometryczny redukcji PB w potencjale -0,90 V (względem NEK). Po dodaniu do roztworu yRNA, pik PB malał, a jego potencjał przesuwał się w stronę dodatnią. Nie obserwowano powstawania nowego piku. Opisano ilościowo elektrochemiczne zachowanie PB w obecności i nieobecności yRNA. Stwierdzono niewielką zmianę wartości takich parametrów redukcji PB jak: E°, ks i αn; świadczy to o tworzeniu się elektroaktywnego kompleksu PB-RNA. Zoptymalizowano warunki powstawania kompleksu i oznaczania PB. W optymalnych warunkach obniżenie prądu piku PB zależało liniowo, w zakresie stężeń l ,0-35,0 μg mL(-1), od stężenia yRNA. Zależność tę można opisać równaniem δIp (nA) = 42,12 C(μg mL(-1) + 25,27 (n = 14, r = 0,993). Granicę wykrywalności określono jako 0,73 μg mL(-1)(3σ). Zaproponową metodę zastosowano z sukcesem do oznaczania yRNA w próbkach syntetycznych.

Słowa kluczowe

EN

pyronine B; yeast RNA; voltammetry; binding interaction

PL

pyronina B; drożdże RNA; woltamperometria; wiązanie

• Wydawca: Komitet Chemii Analitycznej PAN
• Czasopismo: Chemia Analityczna
• Rocznik: 2006
• Tom: Vol. 51, No. 4
• Strony: 477--488
• Opis fizyczny: Bibliogr. 30 poz.

Twórcy

autor

Sun W.

autor

You J.

autor

Wang Q.

autor

Jiao K.

• College of Chemistry and Molecular Engineering, Qingdao University of Science and Technology, Qingdao 266042 P. R. China,

Bibliografia

• 1.Paleček E., Nature, 188, 656 (1960).
• 2.Patrici S.A.M., Jesus L.C., Arturo J.M.O. and Pauliao T.B., Anal Bioanal. Chem., 378, 104 (2004).
• 3.Paleček E. and Fajta M., Anal Chem., 73, 74A (2001).
• 4.Patrici S.A.M., Jesus L.C., Arturo J.M.O. and Pauliao T.B., Electroanal., 15, 1193 (2002).
• 5.Paleček E., Talanta, 56, 809 (2002).
• 6.Xu H., Deng H., Hu H.Y., Liu J.Z., Chao H., Liu J. and Ji L.N., Chem. J. Chinese Univ., 24, 25 (2003).
• 7.Wilms C., Noah J.W, Zhong D. and Wollenzien P., RNA, 3, 602(1997)
• 8.Chehab F.F. and Kan W., Proc. Natl Acad. Sci., 86, 9178 (1989).
• 9.Li Z.P., Li Y.K. and Wang Y.C., Luminescence, 20, 282 (2005).
• 10.Wang Y.T., Zhao F.L., Li K.A. and Tong S.Y., Spectrochim. Acta Part A, 56, 1827 (2000).
• 11.Da J. and Huang C.Z., Chin. J. Anal. Chem., 10, 1204 (1999).
• 12.Liu R.T., Yang J.H., Wu X. and Hu T., Anal Chim. Acta., 448, 85 (2001).
• 13.Carter M.T., Rodriguez M. and Bard A.J., J. Am. Chem. Soc., 111, 8901 (1989).
• 14.Rodriguez M. and Bard A.J., Anal. Chem., 62, 2658 (1990).
• 15.Jiao K., Wang Q.X., Sun W. and Jian F.F., J. Inorg. Biochem., 99, 1369 (2005).
• 16.Jiao K., Li Q.J., Sun W. and Wang Z.J., Electroanal, 11, 997 (2005).
• 17.Sun W., Shang Z.M., Li Q.J. and Jiao K., J. Chin. Chem. Soc., 52, 1269 (2005).
• 18.Wang S.F., Peng T.Z. and Yang C.F., Electroanal, 14, 1648 (2002) .
• 19.Erdem A. and Ozsoz M., Electroanal, 14, 965 (2002).
• 20.Radi A., ELRies M.A., and Kandil S., Anal. Bioanal. Chem., 381,451 (2005).
• 21.Sun Z. Y., Ma Z., Zhang W. J., Wang X. Y., Fan C.H. and Li G.X, Anal Bioanal Chem., 379, 283 (2004).
• 22.Balcarová Z. and Brabec V., Biophys. Chem., 33, 56 (1989).
• 23.Cater P.J, Cheng C.C. and Thorp H.H., J. Am. Chem. Soc., 120, 632 (1998).
• 24.Lindeil M., Romby P. and Wagner E.G., RNA, 8, 534 (2002)
• 25.Chwo C.S. and Barton J.K., Biochemistry, 31, 5423 (1992)
• 26.Liu A.C. and Barton J.K., Biochemistry, 37, 9138 (1998)
• 27.Chu F., Smith J., Lynch V.M. and Anslyn E.V., Inorg. Chem., 34, 5689 (1995)
• 28.Gao F., Li Y.X., Zhang L. and Wang L., Spectrochim Acta A, 60, 2505 (2004).
• 29.Laviron E., J. Electroanal. Chem., 101, 19 (1979).
• 30.Zhang N., Zhang X.L. and Zhao Y.F., Microchem. J., 75, 249 (2003).