Quantification of a selenium-containing protein in yeast extract via an accurate determination of a tryptic peptide by species-specific isotope dilution capillary HPLC-ICP MS

Polatajko, A.; Encinar, J. R.; Schaumlöffel, D.; Szpunar, J.

Artykuł - szczegóły

Tytuł artykułu

Quantification of a selenium-containing protein in yeast extract via an accurate determination of a tryptic peptide by species-specific isotope dilution capillary HPLC-ICP MS

Autorzy

Polatajko A. , Encinar J. R. , Schaumlöffel D. , Szpunar J.

Wybrane pełne teksty z tego czasopisma

http://beta.chem.uw.edu.pl/chemanal/

Identyfikatory

Warianty tytułu

Ilościowe oznaczanie białka zawierającego selen w ekstrakcie z drożdży przez dokładne oznaczenie peptydu trypsynowego metodą specyficznego rozcieńczenia izotopowego w kapilarnej HPLC-ICP MS

Języki publikacji

Abstrakty

A method based on the species-specific isotope dilution analysis was developed for the accurate determination of an Asp-Tyr-SeMet-Gly-Ala-A!a-Lys pcptide directly in a tryptic digest of an aqueous extract of selenized yeast. For this purpose a 77Se labeled peptide to be used as a standard had been purified by 2D liquid chromatography from yeast grown on ⁷⁷SeO_{3,-rich culture and quantified by reversed-phase isotope dilution analysis. The sample mixed with the}⁷⁷^{Se-!abeled peptide spike was analyzed by capillary HPLC-ICP collision cell MS. The isotopic labeling allowed the unequivocal identification of the peptide among all the Se species detected. It compensates for retention time shift and possible peak distortion due to the injection of a complex sail-rich matrix onto a capillary column. The isotoperatio of selenium (⁷⁷Se⁸⁰/) was measured in the peak corresponding to the peptide of interest enabling its accurate quantification by isotope dilution. The determined concentration of the peptide, which was quantitatively formed from a selenized 12 kDa heat-shock protein, made the quantification of the latter possible by capillary HPLC-ICP MS directlyin a yeast extract, without any additional purification.}

Opracowano specyficzną metodę analizy z zastosowaniem rozcieńczenia izotopowego w celu dokładnego oznaczenia peprydu Asp-Tyr-SeMet-Gly-Ala-Ala-Lys bezpośrednio w wodnym ekstrakcie selenowych drożdży po trawieniu za pomocątrypsyny. W tym celu peptyd znakowany ⁷⁷Se stosowany jako standard oczyszczano chromatografią cieczową 2D z drożdży hodowanych na kulturze wzbogaconej ⁷⁷SeO⁷⁷ i oznaczano ilościowo z zastosowaniem rozcieńczenia izotopowego metodą chromatografii cieczowej w odwróconym układzie faz. Próbkę mieszano z peptydem znaczonym ^Se i analizowano kapilarną chromatografią cieczową i spektrometrią rnas z komorą zderzeniową oraz jonizacją w plazmie indukcyjnie sprzężonej. Izotopowe znakowanie pozwala na jednoznaczną identyfikację peptyclu zawierającego selen. Umożliwia kompensacje przesunięcia czasu retencji i ewentualnego zniekształcenia piku wywołanego wstrzykiwaniem do kapilarnej kolumny matrycy o dużej zawartości soli. Stosunek zawartości izotopów selenu(⁷⁷77Se(^/80Se) mierzono dla piku odpowiadającego peptydowi, co pozwala na dokładne oznaczenie ilościowe me to da rozcieńczenia izotopowego. Oznaczenie stężenia peptydu, utworzonego z selenizowanego białka 12 kDa w szoku term icznym, było możliwe za pomocą kapilarnej HPLCICP MS bez dodatkowego oczyszczania.

Słowa kluczowe

species-specific isotope dilution 77Se labeled peptide HPLC-ICP-MS

metoda specyficznego rozcieńczenia izotopowego peptyd znakowany 77Se chromatografia w odwróconym układzie faz chromatografia cieczowa kapilarna

Wydawca

Komitet Chemii Analitycznej PAN

Czasopismo

Chemia Analityczna

Rocznik

2005

Tom

Vol. 50, No. 1

Strony

265--278

Opis fizyczny

Bibliogr. 31 poz.

Twórcy

autor

Polatajko A.

Group of Bio-Inorganic Analytical Chemistry, CNRS UMR 5034, Hélioparc, 2, av. Pr Angot, F-64053. Pau, France

autor

Encinar J. R.

Group of Bio-Inorganic Analytical Chemistry, CNRS UMR 5034, Hélioparc, 2, av. Pr Angot, F-64053. Pau, France

autor

Schaumlöffel D.

Group of Bio-Inorganic Analytical Chemistry, CNRS UMR 5034, Hélioparc, 2, av. Pr Angot, F-64053. Pau, France

autor

Szpunar J.

Joanna.Szpunar@univ.pau.fr

Group of Bio-Inorganic Analytical Chemistry, CNRS UMR 5034, Hélioparc, 2, av. Pr Angot, F-64053. Pau, France

Bibliografia

1. Heumann K.G., in: Metal Speciation in the Environment, [Broekaert J.A.C., Gucer S., Adams F., Eds.], NATO ASI Series, Vol. G 23, Springer, Berlin 1990, pp 153-168.
2. Ruiz Encinar J., Anal. Bioanal. Chem., 375, 41 (2003).
3. Nusko R. and Heumann K.G., Fresenius' J. Anal. Chem., 351, 1050 (1997).
4. Huo D. and Kingston H.M., Anal. Chem., 72, 5047 (2000).
5. Diemer J. and Heumann K.G., Fresenius' J. Anal. Chem., 351, 74 (1997).
6. Gallus S.M. and Heumann K.G., J. Anal. At. Spectrom., 11, 887 (1996).
7. Wimschneider A. and Heumann K.G., Fresenius' J. Anal. Chem., 355, 191 (1995).
8. Reifenhaeuser C. and Heumann K.G., Fresenius' J. Anal. Chem., 336, 559 (1990).
9. Yang L., Mester Z. and Sturgeon R.E., J. Anal. At. Spectrom., 18, 431 (2003).
10. Ruiz Encinar J., Villar M.I.M., Gotor V., Garcia Alonso J.I. and Sanz-Medel A., Anal. Chem., 73, 3174 (2001).
11. Ebdon L., Hill S.J. and Rivas C., Spectrochim. Acta, 53B, 289 (1998).
12. Schedlbauer O.F. and Heumann K.G.,. Anal.. Chem., 71, 5459 (1999).
13. Wolf W.R., Zainal H. and Yager B., Fresenius' J Anal. Chem., 370, 286 (2001).
14. Zhu X. and Desiderio D.M., Mass Spectrometry Review, 15, 213 (1996).
15. Moseley M.A., Trends Biotechnol., 19, S10 (2001).
16. Hill J., Mass Spectrometry Review, 22, 182 (2003).
17. Barr J.R., Maggio V.L., Patterson D.G. Jr., Cooper G.R., Henderson L.O., Turner W.E., Smith S.J., Needham W.H. and Sampsom E.J., Clin. Chem., 42, 1676 (1996).
18. Barnidge D.R., Dratz E.A., Martin T., Bonilla L.E., Moran L.B. and Lindall A., Anal. Chem., 75, 445 (2003).
19. Gerber S.A., Rush J., Stemman O., Kirschner M.W. and Gygi S.P., Proc. Natl. Acad Sci. USA, 100, 6940 (2003).
20. Zhang R., Sioma C.S., Wang S. and Regnier F.E., Anal.Chem., 73, 5142 (2001).
21. Wind M. and Lehmann W.D., J. Anal. At. Spectrom., 19, 20 (2004).
22. Sanz-Medel A., Montes-Bayón M. and Fernández Sánchez M.L., Anal. Bioanal. Chem., 311, 236 (2003).
23. Szpunar J., Anal. Bioanal. Chem., 378, 54 (2004).
24. Becker J. S., Zority M., Becker J.S., Pickhardt C. and Przybylski M., J. Anal. At. Spectrom., 19, 149 (2004).
25. Schaumlöffel D., Ruiz Encinar J. and Lobinski R., Anal. Chem., 75, 6837 (2003).
26. Ruiz Encinar J., Ouerdane L., Buchmann W., Tortajada J., Lobinski R. and Szpunar J., Anal. Chem., 75, 3765 (2003).
27. Ruiz Encinar J., Garcia Alonso J.I., Sanz-Medel A., Main S., Turner P.J., J. Anal. At. Spectrom., 16, 322 (2001).
28. Larsen E.H., Sloth J.J., Hansen M. and Moesgaard S., J. Anal. At. Spectrom., 18, 310 (2003).
29. Sloth J.J. and Larsen E.H., J. Anal. At. Spectrom., 15, 669 (2000).
30. Hinojosa Reyes L., Marchante Gayón J.M., Garcia Alonso J.I. and Sanz-Medel A., J. Anal. At. Spectrom.. 18, 11 (2003).
31. Ruiz Encinar J., Garcia Alonso J.I., Sanz-Medel A., Main S. and Turner P. J., J. Anal. At. Spectrom., 16, 315 (2001).

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.baztech-article-BPP1-0049-0050