Miniaturowy system do żelowej kapilarnej elektroforezy DNA z detekcją fluorescencyjną

• Autorzy: Kubicki W. , Walczak R. , Dziuban J.

Warianty tytułu

EN

Miniature system for capillary gel electrophoresis of DNA with fluorescence detection

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W pracy przedstawiono wyniki badań nad miniaturowym systemem do elektroforetycznej separacji DNA, wykorzystującym układ detekcji fluorescencyjnej. Opisano technologię całkowicie szklanego biochipa z krzyżową konfiguracją kanałów mikrofluidycznych. W opracowanym stanowisku laboratoryjnym przeprowadzono elektroforezę żelową DNA znakowanego barwnikami „czerwonymi” (Cy5, TO-PRO-3) z detekcją fluorymetryczną w czasie rzeczywistym. Sygnał detektora przetworzono cyfrowo, uzyskując charakterystyki intensywności fluorescencji w funkcji czasu.

EN

In the paper, miniature system with fluorometric detection for electrophoretic separation of DNA is reviewed. Technology of all-glass biochip with cross-shaped microfluidic channels is described. Gel electrophoresis of DNA labeled with red-line markers (Cy5, TO-PRO-3) was conducted in laboratory set-up with real-time fluorometric detection. Detection signal was processed into time-graphs of fluorescence intensity.

Słowa kluczowe

PL

biochip; elektroforeza żelowa; DNA; fluorescencja

EN

biochip; DNA; gel electrophoresis; fluorescence

• Wydawca: Wydawnictwo SIGMA-NOT
• Czasopismo: Przegląd Elektrotechniczny
• Rocznik: 2010
• Tom: R. 86, nr 10
• Strony: 69--71
• Opis fizyczny: Bibliogr. 9 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Kubicki W.

autor

Walczak R.

autor

Dziuban J.

• Politechnika Wrocławska, Wydział Elektroniki Mikrosystemów i Fotoniki, Wydziałowy Zakład Mikroinżynierii i Fotowoltaiki,

Bibliografia

• [1] Kaczanowski R., Trzeciak L., Kucharczyk K., Multitemperature single-strand conformation polymorphism, Electrophoresis, 22 (2001), 3539-3545
• [2] Kubicki W., Bargiel S., Szklany mikrochip do elektroforezy kapilarnej, X Konferencja Naukowa Czujniki Optoelektroniczne i Elektroniczne COE 2008, Poznań, 2008
• [3] Paegel B., Blazej R., Mathies R., Microfluidic devices for DNA sequencing: sample preparation and electrophoretic analysis, Current Opinion in Biotechnology, 14 (2003), 42-50
• [4] Schmalzing D., Tsao N., Koutny L. et al., Toward real-world sequencing by microdevice electrophoresis, Genome Research, 9 (1999), 853-858
• [5] Griebel A., Rund S. et al., Integrated polymer chip for two-dimensional capillary gel electrophoresis, LabChip, 4 (2004), 18-23
• [6] Gut tman A., Gao H., Haas R. , Rapid analysis of mitochondrial DNA heteroplasmy in diabetes by gel-microchip electrophoresis, Clinical Chemistry, 47 (2001), n.8, 1469-1472
• [7] Walczak R., Dziuban J., Koszur J., Bang D., Ruano- Lopez J., Miniaturowy system do prowadzenia reakcji PCR czasu rzeczywistego do taniego i masowego wykrywania patogenów żywności, Elektronika, 49 (2008), nr.6, 242-244
• [8] Kubicki W. , Bargiel S., Glass microdevice with integrated optical sensor for on-chip capillary electrophoresis, V Konferencja Naukowa Studentów, Wrocław, 2007
• [9] von Heeren F., Verpoorte E., Manz A., Thormann W., Characterization of electrophoretic sample injection and separation in a gel-filled cyclic planar microstructure, Journal of Microcolumn Separations, 8 (1996), n.6, 373-381