Application of image analysis for quantification of cardiac function in vivo by MRI in the mouse model of heart failure

• Autorzy: Kosecka S. , Wojnar L. , Petryniak R. , Skórka T. , Heinze-Paluchowska S. , Tyrankiewicz U. , Chłopicki S.

Warianty tytułu

PL

Zastosowanie metod analizy obrazu dla ilosciowej oceny niewydolnosci funkcji serca myszy na obrazach pochodzących z rezonansu magnetycznego

• Konferencja: STERMAT 2008 : VIII International Conference on Stereology and Image Analysis in Materials Sciences (VIII ; 02-06.09.2008 ; Zakopane, Polska)
• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

This paper presents the application of the image analysis method for the detection of left ventricle in the mouse hearts in vivo. Images were obtained using Magnetic Resonance Imaging (MRI) and the method of their analysis was developed. The whole process of detection was divided into two main parts: initial analysis and final analysis. The aim of the initial analysis was to establish the marker for the subsequent final analysis. The final analysis was performed because one or two images from each series of measurements included only part of the left ventricle circumference. The ventricle reconstruction was done by clustering all objects which had one common part including the marker.

PL

Artykuł przedstawia zastosowanie metod analizy obrazu dla problemu detekcji lewej komory serca myszy. Analizowane obrazy uzyskane zostały metodą obrazowania magnetyczno-rezonansowego (MR) z rezonansu magnetycznego. Cały proces detekcji został podzielony na dwie części. Celem pierwszej części było oszacowanie rozmiaru znacznika wykorzystywanego w drugiej części procesu detekcji. Drugi etap jest wymagany, ponieważ dla pojedynczych obrazów w serii detekcja wskazywała tylko część obszaru komory, a nie cały obszar. Rekonstrukcja poszukiwanego obszaru odbywała się poprzez grupowanie wszystkich obiektów znajdujących się w obrębie znacznika.

Słowa kluczowe

PL

zastosowanie metod analizy obrazu; metoda obrazowania magnetyczno-rezonansowego (MR); niewydolność funkcji serca myszy; rezonans magnetyczny

• Wydawca: Wydawnictwo SIGMA-NOT
• Czasopismo: Inżynieria Materiałowa
• Rocznik: 2008
• Tom: Vol. 29, nr 4
• Strony: 459--462
• Opis fizyczny: Bibliogr. 12 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Kosecka S.

autor

Wojnar L.

autor

Petryniak R.

autor

Skórka T.

autor

Heinze-Paluchowska S.

autor

Tyrankiewicz U.

autor

Chłopicki S.

• Instytut Infromatyki Stosowanej, Politechnika Krakowska,

Bibliografia

• [1] Drelicharz Ł., Kozlovski V., Skórka T., Heinze-Paluchowska S., Jasiński A., Gebska A., Guzik T., Olszanecki R., Wojnar L., Mende U., Csanyi G., Chłopicki S.: NO and PGI(2) in coronary endothelial dysfunction in transgenic mice with dilatedcardiomyopathy. Basic Res Cardiol. (2008 Apr 22).
• [2] Elas M., Bielanska J., Pustelny K., Plonka P. M., Drelicharz Ł., Skórka T., Tyrankiewicz U., Wozniak M., Heinze-Paluchowska S., Walski M., Wojnar L., Fortin D., Ventura-Clapier R., Chlopicki S.: Detection of mitochondrial dysfunction by EPR technique in mouse model of dilated cardiomyopathy. Free Radic Biol Med. 45(3) (2008) 321-328.
• [3] Heinze-Paluchowska S., Skórka T., Drelicharz Ł., Chłopicki S., Jasiński A.: MR imaging of mouse heart in vivo using a specialized probehead and gradient system, Polish J. Chem. 80 (2006) 1133-1139.
• [4] Kapur JN, Sahoo PK,. Wong AKC.: A New Method for Gray-Level Picture Thresholding Using the Entropy of the Histogram. Komputer Vision, Graphics, and Image Processing (1985).
• [5] Krzemińska-Pakuła M: Metody obrazowe w diagnostyce chorób układu krążenia. Państwowy Zakład Wydawnictw Lekarskich (1991).
• [6] Malina W, Smiatacz M.: Metody cyfrowego przetwarzania obrazów. EXIT (2005).
• [7] Mende U, Semsarian C, Martins DC, Kagen A, Duffy C, Schoen FJ, Neer EJ (2001) Dilated cardiomyopathy in two transgenic mouse lines expressing activated G protein alpha(q): lack of correlation between phospholipase C activation and the phenotype. J Mol Cell Cardiol 33 1477-1491.
• [8] M.Nagao and T.Matsuyama: Edge Preserving Smoothing, Komputer Graphics and Image Processing, Vol. 9, No. 4 (1979) 394-407.
• [9] Nieniewski M.: Segmentacja obrazów cyfrowych. EXIT (2005).
• [10] Ogiela MR.: Strukturalne metody rozpoznawania obrazów w kognitywnej analizie zobrazowań medycznych. Wydawnictwa AGH (2004).
• [11] Wojnar L, Kurzydłowski KJ, Szala J.: Praktyka analizy obrazu. Polskie Towarzystwo Stereologiczne (2002).
• [12] Zieliński KW.: Komputerowa analiza obrazu biomedycznego. PWN (2002).