Struktura, dynamika i termodynamika białek globularnych: siatkowe modele Monte Carlo

• Autorzy: Koliński A.

Warianty tytułu

EN

The structure, dynamics and thermodynamics of globular proteins

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Scharakteryzowano własny, opisany już w literaturze symulacyjny model białka, oparty na dyskretyzacji siatkowej i metodzie Monte Carlo. Oddziaływania pomiędzy tzw. atomami połączonymi wyprowadzono w nim w postaci potencjałów statystycznych wynikających z analizy regularności strukturalnych obserwowanych w znanych strukturach jednodomenowych białek globularnych. Przedstawiono kilka przykładowych zastosowań i przedyskutowano zakres stosowalności modelu oraz kierunki jego dalszego rozwoju. Bardziej szczegółowo opisano wyniki symulacji procesu asocjacji podwójnej helisy fragmentu białka transkrypcyjnego GCN4

EN

A Monte Carlo high-resolution lattice model of protein structure and dynamics is described. Interactions between combined atoms are described in terms of statistical potentials derived from the analysis of the structural regularities occurring in the known structures of single-domain globular proteins. Illustrative applications, applicability range, and possible further development of the model are given. Results of the simulations of the coil assembly of the leucine zipper fragment of transcriptional activator GCN4 are discussed in more detail.

Słowa kluczowe

PL

modele siatkowe białek; symulacje Monte Carlo; struktura białek; przewidywanie struktury białek

EN

lattice models of proteins; Monte Carlo simulation; protein structure; prediction of protein structure

• Wydawca: Sieć Badawcza Łukasiewicz – Instytut Chemii Przemysłowej
• Czasopismo: Polimery
• Rocznik: 1998
• Tom: T. 43, nr 6
• Strony: 341--351

Twórcy

autor

Koliński A.