Tytuł artykułu
Autorzy
Wybrane pełne teksty z tego czasopisma
Identyfikatory
Warianty tytułu
The structure, dynamics and thermodynamics of globular proteins
Języki publikacji
Abstrakty
Scharakteryzowano własny, opisany już w literaturze symulacyjny model białka, oparty na dyskretyzacji siatkowej i metodzie Monte Carlo. Oddziaływania pomiędzy tzw. atomami połączonymi wyprowadzono w nim w postaci potencjałów statystycznych wynikających z analizy regularności strukturalnych obserwowanych w znanych strukturach jednodomenowych białek globularnych. Przedstawiono kilka przykładowych zastosowań i przedyskutowano zakres stosowalności modelu oraz kierunki jego dalszego rozwoju. Bardziej szczegółowo opisano wyniki symulacji procesu asocjacji podwójnej helisy fragmentu białka transkrypcyjnego GCN4
A Monte Carlo high-resolution lattice model of protein structure and dynamics is described. Interactions between combined atoms are described in terms of statistical potentials derived from the analysis of the structural regularities occurring in the known structures of single-domain globular proteins. Illustrative applications, applicability range, and possible further development of the model are given. Results of the simulations of the coil assembly of the leucine zipper fragment of transcriptional activator GCN4 are discussed in more detail.
Czasopismo
Rocznik
Tom
Strony
341--351
Opis fizyczny
Twórcy
autor
Bibliografia
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.baztech-article-BPL3-0003-0062