Bootstrap i inne metody oceny wiarygodności drzew filogenetycznych

• Autorzy: Bartoszek K.

Warianty tytułu

EN

The bootstrap and other methods of testing phylogenetic trees

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Ostatnim etapem analizy filogenetycznej jest ocena wiarygodności powstałego drzewa. Nie jest to łatwy problem, gdyż nie znamy pełnego modelu probabilistycznego ewolucji. Zaproponowano kilka metod, ale w literaturze jest szeroka dyskusja, co do ich stosowalności oraz interpretacji.

EN

The final step of phylogenetic analysis is the test of the generated tree. This is not a easy task for which there is an obvious methodology because we do not know the full probabilistic model of evolution. A number of methods have been proposed by they is a wide debate concerning the interpretations of the results they produce.

Słowa kluczowe

PL

analiza filogenetyczna; ocean wiarygodności drzewa filogenetycznego; metoda bootstrap

EN

phylogenetic analysis; test of the generated tree; bootstrap method

• Wydawca: Wydział Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki Politechniki Gdańskiej
• Czasopismo: Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne
• Rocznik: 2007
• Tom: T. 12
• Strony: 103--108
• Opis fizyczny: Bibliogr. 4 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Bartoszek K.

• Katedra Algorytmów i Modelowania Systemów, Politechnika Gdańska

Bibliografia

• [1] Felsenstein J.: Confidence Limits on Phylogenies: An Approach Using the Bootstrap. W: Evolution 1985, vol. 39 nr 4, s. 783-791.
• [2] Soltis P., Soltis D.: Applying the Bootstrap in Phylogeny Reconstruction . W: Statistical Science 2003, vol. 18 nr 2, s.256-267.
• [3] Ewens W., Grant G.: Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction, Springer, 2005.
• [4] Felsenstein J.: Inferring Phylogenies, Sinauer Associates, 2003.