Grafowo-tekstowy model rekombinacji DNA u orzęsek

• Autorzy: Bartoszek K.

Warianty tytułu

EN

A graph-string model of gene assembly in ciliates

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Praca streszcza formalny model przekształceń ciągu DNA u orzęsek z mikronukleusa do jego uporządkowanej postaci makronukleusowej. Orzęski (typ CiIiata) charakteryzują się tym, iż w przeciwieństwie do pozostałych pierwotniaków posiadają mikro- i makronukleus. Podczas procesu koniugacji materiał genetyczny z mikronukleusa musi przekształcić się do postaci makronukleusowej. Model oparty jest o operacje na słowach i teorię grafów. Wskazuje on, że w komórkach dochodzi do złożonych operacji obliczeniowych. Model został obszernie opisany w [2][3][4][5].

EN

The ciliates are a family of unicellular organisms that characterize themselves by having two types of nuclei, micro- and macronuclei. During cell mating the genetic material must change from the micronuclei to the macronuclei form. The paper summarises a formal model for this change. The model which is described in [2][3][4][5], is based on strings and graphs. It shows that inside the cell complex computational operations have to take place.

• Wydawca: Wydział Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki Politechniki Gdańskiej
• Czasopismo: Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne
• Rocznik: 2006
• Tom: T. 10
• Strony: 523--534
• Opis fizyczny: Bibliogr. 6 poz., 8 rys.

Twórcy

autor

Bartoszek K.

• Katedra Algorytmów i Modelowania Systemów, Politechnika Gdańska

Bibliografia

• [1] http://ecyclopedia.thefreedictionary.coiTi/_viewer.aspx?path=f/fa/&nmaes=Stvlonichia.jpg
• [2] Ehrenfeucht A.,Harju T., Petre L, Prescott D., Rozenberg G.: Computation in Living Cells, Springer, Heidelberg 2004.
• [3] Harju T., Petre L, Rozenberg G.: Gene assembly in ciliates: Formal framework, Raport instytutowy 558, Turku Center for Computer Science, październik 2003.
• [4] Harju T.: A combinatorical view on gene assembly, Raport instytutowy 588, Turku Center for Computer Science, styczeń 2004.
• [5] Harju T., Petre L, Rozenberg G.: Modelling simple operations for gene assembly, Raport instytutowy 697, Turku Center for Computer Science, sierpień 2003.
• [6] Solomon E., Berg L., Villee C.: Biologia, Multico, W-wa 1998.