Progress in structural studies of proteins by NMR spectroscopy

Kazimierczuk, K.; Misiak, M.; Zawadzka, A.; Koźmiński, W.

Artykuł - szczegóły

Tytuł artykułu

Progress in structural studies of proteins by NMR spectroscopy

Autorzy

Kazimierczuk K. , Misiak M. , Zawadzka A. , Koźmiński W.

Wybrane pełne teksty z tego czasopisma

https://ichp.vot.pl/index.php/p

Identyfikatory

Warianty tytułu

Postęp w badaniach strukturalnych białek za pomocą spektroskopii NMR

Języki publikacji

Abstrakty

In this review we discuss recent advances in the field of NMR structural studies of proteins. We mention the development of new spectrometer hardware, novel experimental techniques and sample preparation. The approaches improving obtained structures, like analysis of Residual Dipolar Couplings, and enabling studies of large molecules as for example TROSY and CRINEPT are compared. As the most important, achievements in the field of fast multidimensional NMR are discussed in details.

Praca zawiera przegląd ostatnich osiągnięć dotyczących badań strukturalnych białek metodami spektroskopii NMR. Omówiono postęp w konstrukcji spektrometrów, nowe techniki eksperymentalne i sposoby przygotowania próbek. Wymieniono nowe procedury analizy wyników eksperymentalnych pozwalające uzyskać lepszą jakość obrazu badanych struktur (np. analiza resztkowych sprzężeń dipolowych), a także umożliwiające badania coraz większych molekuł (np. TROSY i CRINEPT).

Słowa kluczowe

NMR structure determination proteins multidimensional NMR

badania strukturalne metodami NMR białka wielowymiarowy NMR

Wydawca

Sieć Badawcza Łukasiewicz – Instytut Chemii Przemysłowej

Czasopismo

Polimery

Rocznik

2007

Tom

T. 52, nr 10

Strony

736--744

Opis fizyczny

Bibliogr. 59 poz.

Twórcy

autor

Kazimierczuk K.

autor

Misiak M.

autor

Zawadzka A.

autor

Koźmiński W.

Warsaw University, Chemistry Department, ul. Pasteura 1, 02-093, Warszawa, kozmin@chem.uw.edu.pl

Bibliografia

[1] Berman H. M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T. N., Weissig H., Shindyalov I. N., Bourne P. E.: Nucleic Acids Research 2000, 28, 235.
[2] Sattler M., Schleucher }., Griesinger C.: Próg. Nuci Magn. Reson. Spectrosc. 1999, 34, 93.
[3] Fiaux J., Bertelsen E. B., Hor-wich A. L., Wiithrich K.: Nature 2002, 418, 207.
[4] Fer-nandez C., Wider G.: Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 570.
[5] Kay L.: /. Magn. Reson. 2005,173,193.
[6] Oschkinat H., Griesinger C., Kraulis P. J., Sorensen O. W., Ernst R. R., Gronenborn A. M., Clore G. M.: Naturę 1988, 332, 374.
[7] Yuister G. W., Boelens R., Kaptein R.: /. Magn. Reson. 1988, 80, 176.
[8] Marion D., Kay L. E., Sparks S. W., Torchia D. A., Bax A.: /. Ara. Chem. Soc. 1989, 111, 1515.
[9] Ikura M., Kay L. E., Bax A.: Biochemistry 1990, 29, 4659.
[10] Bax A., Grzesiek S.: Acc. Chem. Res. 1993, 26,131.
[11] Yamazaki T., Lee W., Arrowsmith C. H., Muhandiram D. R., Kay L. E.: /. Ara. Chem. Soc. 1994,116,11 655.
[12] Pervushin K., Riek R., Wider G., Wüthrich K.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94,12 366.
[13] Riek R., Wider G., Pervushin K., Wüthrich K.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 4918.
[14] Morris G. A., Freeman R.: /. Ara. Chem. Soc. 1979, 101, 760.
[15] Güntert R: Próg. Nuci. Magn. Reson. Spectrosc. 2003, 43, 105.
[16] Kigawa T., Nuto Y., Yokoyama S.: /. Biomol. NMR 1995, 6, 129.
[17] Xu R., Ayers B., Cowburn D., Muir T. W.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 388.
[18] Lian L.-Y., Middleton D. A.: Próg. Nuci. Magn. Reson. Spectrosc. 2001, 39, 90.
[19] Otomo T., Teruya K., Uegaki K., Yamazaki T., Kyogoku Y.: /. Biomol. NMR 1999,14,105.
[20] Simon B., Sattler M.: Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41/3, 437.
[21] Annila D., Permi R: Concepts Magn. Reson. 2004, 23A, 22.
[22] de Alba E., Tjandra N.: Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2002, 40, 175.
[23] Blackledge M.: Próg. Nuci. Magn. Reson. Spectrosc. 2005, 46, 23.
[24] Bax A.: Protein Sci. 2003,12,1.
[25] Riickert M., Otting G.: /. Ara. Chem. Soc. 2000, 122, 7793.
[26] Ottiger M., Bax A.: /. Biomol. NMR 1998, 12, 361.
[27] Tjandra N., Bax A.: Science 1997, 278, 1111.
[28] Cavagnero S., Dyson H. J., Wright P. E.: /. Biomol. NMR 1999,13, 387.
[29] Prosser R. S., Losonczi J. A., Shiyanovskaya I. V.: /. Ara. Chem. Soc. 1998,120,11 010.
[30] Barrientos L. G., Dolan C., Gronenborn A. M.: /. Biomol. NMR 2000,16, 329.
[31] Clore G. M., Starich M. R., Gronenborn A. M.: /. Ara. Chem. Soc. 1998, 120, 10 571.
[32] Hansen M. R., Mueller L., Pardi A.: Naturę Struct. Biol. 1998,5,1065.
[33] Sass H. J., Cordier F., Hoffmann A., Rogowski M., Cousin A., Omichinski J. G., Lowen H., Grzesiek S.: /. Ara. Chem. Soc. 1999,121, 2047.
[34] Koenig B. W., Hu J. S., Ottiger M., Bose S., Hendler R. W., Bax A.: /. Ara. Chem. Soc. 1999,121,1385.
[35] Fleming K., Gray D., Presannan S., Matthews S.: /. Ara. Chem. Soc. 2000,122,5224.
[36] Tycko R., Blanco F. J., Ishii Y.: /. Ara. Chem. Soc. 2000, 122, 9340.
[37] Sass H. J., Musco G., Stahl S. J., Wingfield P. T., Grzesiek S.: /. Biomol. NMR 2000,18, 303.
[38] Chou J. J., Gaemers S., Howder B., Louis J. M., Bax A.: /. Biomol. NMR 2001, 21, 377.
[39] Bodenhausen G., Ernst R. R.: /. Magn. Reson. 1981,45,367.
[40] Bodenhausen G., Ernst R. R.: /. Ara. Chem. Soc. 1982,104,1304.
[41] Koźmiński W., Sperandio D., Nanz D.: Magn. Res. Chem. 1996,34,311.
[42] Koźmiński W., Nanz D.: /. Magn. Res. 1997, 124, 383.
[43] Bracewell R. N.: Aust. J. Phys. 1956, 9, 198.
[44] Nagayama K., Bachmann P, Wüthrich K., Ernst R. R.: /. Magn. Reson. 1978, 31,133.
[45] Szyperski T., Wider G., Buschweller J. H., Wüthrich K.: /. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9307.
[46] Szyperski T., Wider G., Buschweller J. H., Wüthrich K.: /. Biomol. NMR 1993, 3, 127.
[47] Brutscher B., Simorre J. R, Caffrey M. S., Marion D.: /. Magn. Reson. 1994, B 105,77.
[48] Löhr R, Rüterjans K: /. Biomol. NMR 1995,6,189.
[49] Kim S., Szyperski T.: /. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13 958.
[50] Koźmiński W., Zhukov L: /. Biomol. NMR 2003, 26,157.
[51] Malmodin D., Billeter M.: /. Magn. Reson. 2005, 176, 47.
[52] Malmodin D., Billeter M.: /. Am. Chem. Soc. 2005,127,13 486.
[53] Kupce E., Preeman R.: /. Am. Chem. Soc. 2003,125,13 958.
[54] Coggins B. E., Yenters R. Av Zhou R: /. Am. Chem. Soc. 2005,127,11 562.
[55] Yoon J., Godsill S., Kupce E., Freeman R.: Magn. Res. Chem. 2006, 44,197.
[56] Leue E. D., Maygner M. R., Skilling J., Staunton J.: /. Magn. Reson. 1986,68,14.
[57] Rovnyak D., Frueh D. R, Sastry M., Sun Z. Y. J., Stern A. S., Hoch J. C, Wagner G.: /. Magn. Reson. 2004,170,15.
[58] Marion D,: /. Biomol. NMR 2005, 32, 141.
[59] Kazimierczuk K., Zawadzka A., Koźmiński W., Zhukov L: /. Biomol. NMR 2006,36,157.

Typ dokumentu

Bibliografia

Identyfikator YADDA

bwmeta1.element.baztech-article-BAT7-0006-0045