Powiadomienia systemowe
- Sesja wygasła!
Tytuł artykułu
Autorzy
Wybrane pełne teksty z tego czasopisma
Identyfikatory
Warianty tytułu
Analiza obrazów mikromacierzy DNA przy użyciu morfologicznego przetwarzania obrazów
Konferencja
PELINCEC International Workshop on "Image Processing in Industrial Information Technology- Methods and Applications" Warsaw, 14-15.10.2004
Języki publikacji
Abstrakty
This paper presents the usefulness of the morphological image processing in analysis of the DNA microarray hybridization pictures. The algorithm for automatic spot positioning based on the morphological covariance and morphological reconstruction will be proposed. The algorithm presented here makes it possible to easily determine two important parameters of the microarray image: mean distance between spots and mean value of the background erosions.
W artykule przedstawiono użyteczność morfologicznego przetwarzania obrazów w analizie obrazów hybrydyzacji mikromacierzy DNA. Zostanie zaproponowany wykorzystujący morfologiczną kowariancję i rekonstrukcję morfologiczną algorytm automatycznego pozycjonowania spotów. Przedstawiony algorytm umożliwia określenie w łatwy sposób dwóch ważnych parametrów obrazu hybrydyzacji: średniej odległości między spotami oraz średniej wartości erozji tła.
Wydawca
Czasopismo
Rocznik
Tom
Strony
54--57
Opis fizyczny
Bibliogr. 10 poz., rys.
Twórcy
autor
- Warsaw University of Technology, Institute of Theoretical Electricity and Measuring Systems, , ul.Koszykowa 75, 00-661 Warszawa, Poland
autor
- Warsaw University of Technology, Institute of Control and Industrial Electronics, ul.Koszykowa 75, 00- 662 Warszawa, Poland
Bibliografia
- [1] Angulo J., Serra J., Automatic analysis of DNA microarray images using mathematical morphology BIOINFORMATICS Vol. 19 no. 5 2003, pages 553–562
- [2] Dudoit S., Gentleman R., Irizarry R., Yang Y. H. Introduction to DNA microarray technologies http://www.bioconductor.org/workshops/WyethCourse101702/
- [3] Dudoit S., Gentleman R, Introduction to genome biology http://www.bioconductor.org/workshops/ WyethCourse101702/
- [4] Ilnicki F., BioChip – Narzędzie do analizy DNA, Przegląd Elektrotechniczny 4 2004. pages 277 -282
- [5] Iwanowski M., Automatic car number plate detection using morphological image processing, Przegląd Elektrotechniczny, this issue
- [6] Nieniewski M., Morfologia matematyczna w przetwarzaniu obrazów, PLJ Warszawa, 1998,
- [7] Serra J., Image analysis and mathematical morphology, vol.1, Academic Press, 1983,
- [8] Serra J., Image analysis and mathematical morphology, vol.2, Academic Press, 1988,
- [9] Soille P., Morphological image analysis, Springer, 2002
- [10] Yang Y. H., Buckley M., Dudoit S., Speed T., Comparison of methods for image analysis on cDNA microarray data,University of California, Berkeley, Technical Report # 584 (2002).
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.baztech-article-BAR0-0008-0011