Zastosowanie algorytmu hit-miss do segmentacji barwnych obrazów mikroskopowych w badaniu metodą ELISPOT

• Autorzy: Bieniecki W. , Gródecki A. , Grabowski S. , Kościelska-Kasprzak K. , Drulis-Fajdasz D. , Mazanowska O. , Klinger M.

Warianty tytułu

EN

The application of hit-miss algorithm to the segmentation of color microscope images in ELISPOT examination

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

W artykule zaproponowano podejście do segmentacji barwnych obrazów mikroskopowych w badaniu ELISPOT z zastosowaniem metody hit-miss. Metoda ta jest przeznaczona do segmentacji obrazów binarnych. Przedstawiono podejście uogólnione, które polega na przetwarzaniu obrazu monochromatycznego oraz barwnego. Opisane zostały testy, które wskazują na skuteczność działania algorytmu. Wadą wspomnianego podejścia jest dość duża złożoność obliczeniowa. Algorytm jest częścią oprogramowania Spot-View do analizy ilościowej obrazów ELISPOT, przeznaczonego do badań nad określeniem ryzyka odrzucenia przeszczepu nerki, prowadzonych przez Akademię Medyczną we Wrocławiu.

EN

A color microscope ELISPOT image segmentation approach based on the hit-miss method is presented. The original method is intended for binary images only. The authors propose an extension, which enables monochrome and color image processing. The algorithm has been successfully tested from the viewpoint of accuracy. The drawback of such approach is high computation complexity. The algorithm is part of the computer vision system SpotView, developed for Wroclaw Medical University, where the research on kidney graft rejection risk is conducted.

Słowa kluczowe

PL

ELISPOT; segmentacja obrazów barwnych; hit-miss

EN

ELISPOT; color image segmentation; hit-miss

• Wydawca: Wydawnictwa AGH
• Czasopismo: Automatyka / Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie
• Rocznik: 2008
• Tom: T. 12, z. 3
• Strony: 585--597
• Opis fizyczny: Bibliogr. 10 poz., rys., tab., wykr.

Twórcy

autor

Bieniecki W.

• Katedra Informatyki Stosowanej, Politechnika Łódzka

autor

Gródecki A.

• Katedra Informatyki Stosowanej, Politechnika Łódzka

autor

Grabowski S.

• Katedra Informatyki Stosowanej, Politechnika Łódzka

autor

Kościelska-Kasprzak K.

• Katedra i Klinika Nefrologii i Medycyny Transplantacyjnej, Akademia Medyczna we Wrocławiu

autor

Drulis-Fajdasz D.

• Katedra i Klinika Nefrologii i Medycyny Transplantacyjnej, Akademia Medyczna we Wrocławiu

autor

Mazanowska O.

• Katedra i Klinika Nefrologii i Medycyny Transplantacyjnej, Akademia Medyczna we Wrocławiu

autor

Klinger M.

• Katedra i Klinika Nefrologii i Medycyny Transplantacyjnej, Akademia Medyczna we Wrocławiu

Bibliografia

• [1] Gillies A.M., Automatic generation of morphological template features. Proc. SPIE, vol. 1350, Image Algebra and Morphological Image Processing, San Diego, 1990, 252-261.
• [2] Zhao D., Daut D.G., Shape recognition using morphological transformation. J. Visual Comm. and Image Rep. 2, Sept 1991, 230-243.
• [3] Wilson S.S., Mathematical Morphology in Image Processing. New York, 1992.
• [4] Kraus E., Doughterty E., Segmentation free morphological character recognition. Proc. ŚPIĘ, vol. 2181, Document Recognition, San Jose, 1994, 14-23.
• [5] Bloomberg D.S., Yincent L., Biur Hit-Miss Transform and its use in Document Image Pattern Detection. Proc. SPIE, vol. 2422, Document Recognition II, San Jose, 1995. 278-292.
• [6] Gebauer B.S., Hricik D.E., Atallah A., Bryan K., Riley J., Tary-Lehmann M., Greenspan N.S., Dejelo C., Boehm B.O., Hering B.J., Heeger P.S., Evolution of the enzyme-linked immunosorbent spot assay for post-transplant alloreactmty as a potentially useful immune monitoring tool. Am. J. Transplant., vol. 2, 2002, 857-866.
• [7] Hricik D.E., Rodriguez V., Riley J., Bryan K., Tary-Lehmann M., Greenspan N., Dejelo C., Schulak J.A., Heeger P.S., Enzyme linked immunosorbent spot (ELISPOT) assay for interferon-gamma independent/y predicts renal function in kidney transplant recipients. Am. J. Transplant., vol. 3, 2003, 878-884.
• [8] Fisher R.B., Perkins S., Walker A., Wolfart E., Hypermedia Image Processing Reference. John Wiley & Sons LTD, 2004.
• [9] Wójcicki D., Bieniecki W., Grabowski S., Kościelska-Kasprzak K., Algorytmy przetwarzania wstępnego obrazów mikroskopowych w badaniu aktywności wydzielniczej limfocytów. XIII konf. „Sieci i systemy informatyczne", Łódź, 2005, 573-580.
• [10] Bieniecki W., Grabowski S., Kościelska-Kasprzak K.. Drulis-Fajdasz D., Mazanowska O., Klinger M., An Algorithm for Smart ROI Detection in ELISPOT Examination Images . XV konf. „Sieci i systemy informatyczne", Łódź, 2007, 133-136.